Plusieurs espèces appartenant au genre bactérien Mycoplasma sont responsables d'infections chez les ruminants, les porcs et les volailles, entraînant des pertes économiques majeures dans ces secteurs de production. Chez les bactéries pathogènes, dont les mycoplasmes, certains éléments sécrétés sont impliqués dans l’interaction hôte-pathogène. Ces travaux de thèse visent à examiner au sein de différentes espèces la présence de deux éléments du sécrétome mycoplasmique : (i) la capsule polysaccharidique (CPSs) et (ii) les nucléases à activité DNasique. Parmi les espèces étudiées, un β-(1->6)-glucane à variation de phase a été mis en évidence chez le pathogène aviaire M. iowae avec, comme chez les mycoplasmes des ruminants, une diversité intra-espèce. L’étude de la sécrétion des CPSs par des approches biochimiques a également contribué à la mise en évidence de la production d’une capsule de β-(1->6)-glucofuranose sécrété par M. fermentans. Il s’agit de la première description de ce CPS sous forme d’homopolymère chez les bactéries. La reconstruction in silico des voies métaboliques des CPSs élargie à d’autres espèces de mycoplasmes a permis d’introduire des éléments de classification des synthases, enzymes permettant la polymérisation des polysaccharides, et leur export à la capsule. Concernant la présence de nucléases à activité DNasique, trois méthodes ont été testées, basées sur l’observation de la dégradation in vitro de trois sources d’ADN. Les résultats des trois tests sont concordants. Ils ont mis en évidence la capacité de M. gallisepticum et M. iowae infectant les volailles, et de M. hyopneumoniae, M. hyorhinis et M. flocculare infectant les porcs à dégrader les ADNs. En revanche, nous n’avons pas détecté de DNases sécrétées par M. synoviae et certains mycoplasmes appartenant au cluster mycoides. Ces résultats pourraient aider à mettre en lien la diversité intra et inter-espèce des éléments sécrétés et les pouvoirs pathogènes variables des bactéries du genre Mycoplasma.