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Génétique, génomique, bioinformatique
/ 04-04-2024
Turpin Marion
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L'identité cellulaire est en partie dictée par l'activité de régions génomiques régulatrices appelées enhancers. Leur activation est associée au remodelage de la chromatine et à la liaison de facteurs de transcription tels que les protéines Hox et leur partenaire Meis1. Le remodelage de la chromatine des enhancers neuraux liés à Meis1 s'accompagne d'un processus actif de déméthylation des dinucléotides CpG reposant sur l'oxydation des 5-méthylcytosines (5mC) en divers intermédiaires par les enzymes TET. Les enhancers sont régulés par la méthylation de l'ADN, et la déméthylation active de l’ADN orchestrée par les TET et la TDG pourrait, en déstabilisant les nucléosomes, favoriser l'engagement de facteurs de transcription tel que Meis1, indépendamment de leur motif de liaison à l'ADN. Malgré ces avancées, l’importance de la présence de CpG au sein des enhancers et de leur méthylation/ déméthylation vis-à-vis de la dynamique d’activation de ces régions génomiques reste méconnue. Au cours de ma thèse, j’ai étudié du rôle de la TDG dans la régulation de l’expression des gènes dans les cellules P19 et au cours de leur différenciation neurale. Nous avons mis en évidence une fonction de la TDG dans le contrôle des gènes régulés par le facteur de transcription ATF4. De plus, je j’ai aussi entrepris l’étude de l’influence de la densité et de la conservation des CpG ciblés par la TDG dans les processus associés à l’activation des enhancers liés par Meis1. Les résultats obtenus suggèrent que la présence de CpG confère aux enhancers une plus forte activité.
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Médecine
/ 15-09-2023
Turpin Marion
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Le saignement post-opératoire en chirurgie cardiaque sous circulation extracorporelle, est un facteur indépendant de morbi-mortalité. Cependant, très peu de travaux ont évalué le saignement post-opératoire après transplantation cardiaque, dont les facteurs de risque et les conséquences restent largement inconnues. L’objectif principal de cette étude était de décrire l'incidence des complications hémorragiques sévères après transplantation cardiaque adulte. Nous avons réalisé une étude observationnelle incluant tous les patients adultes ayant bénéficiés d’une transplantation cardiaque de janvier 2022 à juillet 2022 au CHU de Rennes. Les données ont été recueillies de manière rétrospective à partir du registre local de chirurgie cardiaque. Le critère de jugement principal était l’incidence des complications hémorragiques sévères définies par un score UDPB ≥ 3 (Universal Definition of Perioperative Bleeding), mesuré à partir de la fermeture sternale. Parmi les 217 patients inclus, 54 (25%) ont présenté un saignement sévère (UDPB 3-4), 59 (27%) un saignement modéré (UDPB 1-2) et 104 (48%) un saignement non significatif (UDPB 0). Les facteurs indépendamment associés à la survenue d'événements hémorragiques graves étaient l'assistance cardiaque mécanique à long terme (adjOR 6,84 [2,15-25,0]) et la durée de la CPB (par augmentation de 10 minutes, adjOR=1,15 [1,07-1,25]). L’ECMO et l’état critique préopératoire présentaient une association cliniquement pertinente avec les hémorragies graves sans toutefois atteindre la significativité, avec des OR respectifs de 3,14 (0,82- 12,4) et de 2,35 (0,98-5,88). La mortalité était de 15 % au 30e jour et de 18 % à un an. Les saignements postopératoires graves ont été associés à une augmentation de la mortalité à un an, avec un rapport de risque non ajusté de 4,94 (IC 95 %, 2,62-9,31 ; p<0,001). Après ajustement en fonction de la bilirubinémie préopératoire, de la durée de la CPB et de l'ECMO postopératoire précoce, les hémorragies postopératoires graves n'étaient pas statistiquement significatives, même si les intervalles de confiance incluaient un impact potentiellement cliniquement pertinent sur la mortalité à un an (HR, 2,01 ; IC à 95 %, 0,90-4,46, p = 0,087). Cette étude rapporte une incidence élevée de complications hémorragiques sévères après transplantation cardiaque, notamment chez les patients bénéficiant d'un soutien circulatoire mécanique ou avec une durée importante de circulation extra-corporelle. Ces complications étaient associées à une augmentation significative de la morbidité et de la mortalité. Des études à plus grande échelle sont nécessaires pour identifier les facteurs de risque de saigne- ment et envisager des stratégies de prévention.
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