Le microbiote intestinal interagit en permanence avec l’organisme et exerce un rôle bénéfique grâce à sa fonction métabolique, son effet barrière et son impact sur le système immunitaire. Au cours de la petite enfance, l’exposition à différents microorganismes permet de développer le microbiote intestinal, de stimuler les défenses de l’organisme et d’induire un tolérance du système immunitaire, réduisant ainsi le risque de survenue de maladies allergiques plus tard dans la vie. Cependant, une faible exposition aux microorganismes dans l’enfance pourrait provoquer une dysbiose et s’avérer délétère. La prise de probiotiques dès l’enfance pourrait être un moyen intéressant de diversifier le microbiote intestinal de l’enfant et de prévenir la survenue d’une dysbiose et ainsi d’une allergie. Une multitude d’étude scientifiques ont été réalisée sur le sujet, cependant il existe trop de différences entre chacune d’elles pour conclure définitivement sur l’intérêt bénéfique ou non des probiotiques dans cette indication (souche administrée, population étudiée, durée de prise, dose, administration d’un mélange de souches ou encore pendant la grossesse). Toutefois, la WAO (Organisation mondiale des Allergies) recommande l’utilisation de probiotiques pour la prévention de l’eczéma chez les nourrissons à haut risque de développer une allergie. Malgré de nombreuses incertitudes, la prise de probiotiques semble intéressant pour favoriser la diversification du microbiote intestinal chez les enfant les plus à risque de développer une dysbiose. A ce jour, aucun probiotique n’est commercialisé dans le but de prévenir les allergies chez l’enfant.