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Apport de la PCR digitale pour l'évaluation du potentiel d'une trousse commerciale de RT-PCR en temps réel à quantifier des rhinovirus de différents génotypes
Pharmacie / 24-10-2023
Thouault Luc
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La grande diversité des rhinovirus humains (HRV) rend leur quantification par biologie moléculaire complexe. L’objectif de cette étude était d’évaluer la capacité d’un test commercial de RT-PCR temps réel (RT-PCR TR) à quantifier différents génotypes de HRV dont le génome avait été préalablement titré en PCR digitale par deux systèmes : QX200TM (Biorad) et Naica® (Stilla). Cette méthode avait en effet montré une supériorité par rapport à la RT-PCR-TR pour quantifier ces virus. Le génome de six génotypes de HRV (A1, A2, A68, B17, B69, C5) a été quantifié en RT-dPCR et testé en parallèle avec la RT-PCR TR rhinovirus/entérovirus R-GENE®. A partir des courbes de calibration génotype-spécifique obtenues, un modèle de droite de calibration consensus a été établi. Les titres obtenus à partir de cette droite de calibration étaient comparables aux titres de référence obtenus en dPCR. La RT-PCR TR Rhinovirus R-GENE® aurait la capacité de quantifier de manière exacte différents génotypes de HRV.
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