L’objectif de cette thèse est de démontrer que la modernisation des ports maritimes est commandée par la besoin de flexibilité structurelle et d’autonomie d’action des acteurs. La théorie des nouvelles formes organisationnelles est ici mobilisée pour tenter d’analyser ces mutations dont l’objectif reste la performance. Notre recherche démontre que les transformations portuaires observées au niveau macro contraignent les organisations portuaires au niveau micro à évoluer et à s’adapter pour prendre la forme de port-réseau ou port-logistique. Le système portuaire se transforme en respectant les cultures nationales qui impactent les cultures organisationnelles. L’approche culturaliste vient soutenir notre analyse. Le Grand Port Maritime de Nantes Saint Nazaire (GPMNSN) en France, un pays développé et le Port Autonome de Lomé (PAL) au Togo, un pays non-développé sont les deux terrains où nous avons mené nos recherches-intervention ethnographiques. Ces études confirment que les transformations sont engagées tant à Nantes qu’à Lomé avec pour objet de faire des deux ports des ports-logistiques. Dans les deux organisations les acteurs visent la flexibilité et l’autonomie par le renouvellement des pratiques et la mise en place de nouveaux outils. Notre thèse démontre que le nouveau management public gagne les deux organisations. Elle repère les limites des pratiques managériales observées dans les deux ports maritimes. Elle met en évidence le rôle des acteurs tels que le leader, le cadre intermédiaire, les opérationnels de terrain et bien entendu les acteurs externes avec lesquels le sommet a tout intérêt à construire et renforcer la communication, la coopération et les apprentissages. Elle n’omet pas le rôle central de la culture organisationnelle qui peut s’appuyer sur une charte de management sans négliger de s’ouvrir au confucianisme.