La bonne santé du corps humain est assurée par un assemblage complexe de signaux moléculaires, cellulaires et tissulaires dans tous les organes. Les avancées technologiques récentes et les découvertes scientifiques qui en découlent ont permis de démontrer l’importance d’un « nouvel » organe : le microbiote intestinal. Son étude a permis de montrer son influence sur de nombreuses voies métaboliques et sa capacité à modifier un état de bonne santé ou un état pathologique. Son influence ne se limite pas au niveau intestinal, mais a des répercussions sur de nombreuses fonctions physio-pathologiques comme c’est le cas dans les pathologies hépatiques alcooliques et non alcooliques. Il semble en conséquence possible d’intégrer aujourd’hui la modification du microbiote dans les stratégies thérapeutiques de ces maladies. Cette thèse bibliographique porte dans une première partie sur la description du microbiote intestinal, l’évolution de sa composition au cours de la vie chez l’Homme, mais aussi sur les fonctions métaboliques, immunitaires et protectrices contre les organismes pathogènes que le microbiote apporte à son hôte. Puis, la deuxième partie, présente des études récentes où la dysbiose est mise en cause dans la survenue des pathologies hépatiques alcooliques et non alcooliques. En perspective, l’exploration des effets thérapeutiques de prébiotiques, probiotiques et antibiotiques est exposée.