Les bactéries au métabolisme ralenti (tolérantes et persistantes) sont capables de survivre aux antibiotiques ce qui contribue à l’échec des traitements et à la rechute des infections. Les systèmes toxine-antitoxine (TA) font partie des mécanismes participant à la formation des bactéries tolérantes/persistantes. Chez Staphylococcus aureus, un pathogène humain majeur, l’antitoxine ARN SprF1 appartenant au système TA de type I SprG1/SprF1, peut se fixer sur les ribosomes ce qui entraine une atténuation de la traduction et favorise la formation des bactéries persistantes. Afin de mieux comprendre le rôle de SprF1 dans l’adaptation de S. aureus aux antibiotiques, nous nous sommes intéressés à l’étude de la régulation du système SprG1/SprF1 et à l’identification du targetome de SprF1. Par des approches in silico et par la technique MAPS (MS2 Affinity Purification coupled with RNA Sequencing), nous avons mis en évidence 12 cibles ARNm de SprF1, dont l’ARNm sprG1. Nous avons ensuite démontré que SprF1 interagi, in vitro, avec les ARNm yidC et rpmE2, le premier codant une protéine insertase et le second la protéine ribosomale L31, et que cette interaction entraîne une modulation de l’expression des protéines YidC et RpmE2. Par la suite, nous avons observé que la surexpression de rpmE2 favorise la tolérance aux antibiotiques ce qui pourrait contribuer au phénotype de persistance induit par SprF1. Les résultats présentés dans ce travail de thèse montrent donc que certaines antitoxines de type I agissent comme des ARN régulateurs typiques qui, en interagissant avec plusieurs cibles, ont un rôle dans l’adaptation des bactéries à leur environnement.