De récentes données ont montré la présence de bactéries anaérobies strictes dans le microbiote pulmonaire des sujets sains mais également des patients atteints de mucoviscidose (CF, cystic fibrosis). Bien que leur proportion soit importante, les bactéries anaérobies strictes demeurent les inconnues du poumon, tant au niveau de leur diversité microbienne et de leur résistance que de leur rôle dans la physiopathologie de la maladie. C’est dans ce contexte que l’étude ANA-MUCO a été mise en place, avec pour objectif principal de décrire de façon la plus exhaustive possible le microbiote broncho-pulmonaire anaérobie strict chez les patients CF. De mars à octobre 2018, 101 patients CF ont été inclus dans l’étude. A partir de 120 expectorations étudiées par approche culturale, 35 genres et 73 espèces anaérobies stricts ont été isolés, avec en moyenne sept espèces différentes par patients. Deux genres ont été isolés pour la première fois dans le poumon CF : Pyramidobacter et Varibaculum. Sur les 150 prélèvements inclus, l’approche moléculaire quantitative a permis de détecter 134 prélèvements positifs pour le genre Prevotella, 136 pour le genre Veillonella et 104 pour le genre Fusobacterium. La détection ciblée de deux espèces du genre Porphyromonas a mis en évidence une faible prévalence, pouvant s’expliquer par le fort taux de patients colonisés à P. aeruginosa (59%). La conservation des 866 isolats anaérobies stricts permettra la caractérisation ultérieure du profil de résistance de ces bactéries.