De nos jours, parmi toutes les transformations chimiques dont disposent les chimistes organiciens, le réarrangement sigmatropique [3,3] constitue un outil puissant afin de créer une liaison C-C ou encore C-hétéroatome. Le réarrangement d’allyl cyanate en allyl isocyanate, jusqu’ici peu utilisé, est en train d’émerger, comme une nouvelle méthode efficace de préparation d’allylamines substituées. C’est dans ce contexte que s’inscrit mon travail de thèse qui a pour objectif d’étudier et d’utiliser le réarrangement sigmatropique [3,3] d’allyl cyanates diversement substitués pour la synthèse de molécules d’intérêt biologique. Dans une première partie, l’emploi d’allyl cyanates borylés nous a permis de synthétiser, de façon stéréocontrôlée, des ènecarbamates et des ènehydroxyurées cycliques à 7 chainons ainsi que des γ-butyrolactones. Cette méthodologie a été appliquée à la première synthèse totale de la (-)-Galbacin. Les ènecarbamates cycliques ont fait l’objet, en seconde partie, d’une étude structure-activité en tant qu’inhibiteur du protéasome humain. Dans une troisième partie, nous avons étudié le réarrangement d’allyl cyanates silylés ce qui nous a permis d’accéder à des α-amino allylsilanes énantioenrichis. En dernière partie, nous avons mis en évidence un oxo-réarrangement à partir d’allyl carbamates substitués par un groupement aryle.