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Biochimie, biologie moléculaire et cellulaire
/ 04-04-2019
Bronsard Julie
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Staphylococcus aureus est un agent pathogène humain, qui peut être à l’origine d’un large spectre d’infections communautaires et nosocomiales. Les évènements facilitant le passage d’un état commensal à pathogène chez cette bactérie restent mal connus. Néanmoins, ils sont à corréler à la régulation fine de l’expression de nombreux gènes (dont des facteurs de virulence) permettant à la bactérie de s’adapter efficacement à son environnement. Outre les facteurs globaux de transcription, les ARN régulateurs (ARNreg) ont été montrés comme jouant un rôle clé dans la régulation de l’expression de ces gènes. Le développement de l'utilisation du séquençage ARN à haut débit a montré que le répertoire en ARNreg de S. aureus ne serait pas entièrement décrit. Ainsi, le premier objectif de ce travail était de rechercher de nouveaux ARNreg chez la souche Newman de S. aureus, une souche jamais utilisée pour ce type d’étude. Cette recherche a permis la découverte de 24 nouveaux ARNreg. Parmi ces 24 ARNreg, 7 appartiennent au core génome de S. aureus, confirmant que le répertoire en ARNreg de cette espèce n’est pas encore entièrement décrit. La caractérisation de ces ARN a mis en évidence la présence d’un locus original regroupant 5 ARNreg nommés Srn_9342 à Srn_9346. L’étude du premier ARN de ce locus Srn_9342, a révélé qu’il était transcrit sous deux formes (Srn_9342court et Srn_9342long) ayant des profils d’expression opposés et dépendants de la phase de croissance. L’identification des cibles de ces deux formes par MAPS, indique qu’elles auraient des rôles distincts. Ainsi, Srn_9342court interagirait préférentiellement avec des ARNreg ayant un rôle dans la virulence (ARNIII, SprD et RsaC). Une hypothèse que nous suggérons serait que la forme courte aurait un rôle d’ARN éponge. Concernant la forme longue, d’après les cibles enrichies par MAPS, cette ARNreg contribuerait à l’adaptation de la bactérie face aux différents stress rencontrés au cours de l’infection. La validation et l’étude de l’ensemble de ces partenaires potentiels permettra de mieux comprendre le rôle de cet ARNreg au sein de la bactérie.
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