La recherche sur les bases de données chiffrées vise à rendre efficace une tâche apparemment simple : déléguer le stockage de données à un serveur qui ne serait pas de confiance, tout en conservant des fonctionnalités de recherche. Avec le développement des services de stockage dans le Cloud, destinés aussi bien aux entreprises qu'aux individus, la mise au point de solutions efficaces à ce problème est essentielle pour permettre leur déploiement à large échelle. Le principal problème de la recherche sur bases de données chiffrées est qu'un schéma avec une sécurité ''parfaite'' implique un surcoût en termes de calcul et de communication qui serait inacceptable pour des fournisseurs de services sur le Cloud ou pour les utilisateurs - tout du moins avec les technologies actuelles. Cette thèse propose et étudie de nouvelles notions de sécurité et de nouvelles constructions de bases de données chiffrées permettant des recherches efficaces et sûres. En particulier, nous considérons la confidentialité persistante et la confidentialité future de ces bases de données, ce que ces notions impliquent en termes de sécurité et d'efficacité, et comment les réaliser. Ensuite, nous montrons comment protéger les utilisateurs de bases de données chiffrées contre des attaques actives de la part du serveur hébergeant la base, et que ces protections ont un coût inévitable. Enfin, nous étudions les attaques existantes contre ces bases de données chiffrées et comment les éviter.