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Microbiologie, virologie, parasitologie
/ 06-10-2022
Dejoies Loren
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Enterococcus faecium et Staphylococcus aureus sont des bactéries pathogènes opportunistes de l’homme responsables d’épidémies hospitalières. Les antiseptiques sont très utilisés pour prévenir la survenue de ces infections et leur présence dans l’environnement hospitalier, même à faibles concentrations, dites subinhibitrices, constitue un stress auquel ces bactéries doivent d’adapter. Les ARN régulateurs (sARN) sont des acteurs importants pour l’adaptation aux variations environnementales des bactéries. Les preuves de leur existence sont anciennes chez S. aureus mais récentes chez E. faecium, entrainant un état des connaissances très hétérogène. Dans un premier temps, nous avons souhaité caractériser les sARN dont l’expression était altérée en cas de stress antiseptique exercé par de la chlorhexidine, du chlorure de benzalkonium, de la povidone iodée et du triclosan. Nous avons montré que ce stress entrainait une répression globale des sARN étudiés chez E. faecium mais pas chez S. aureus. Dans un second temps, l’étude approfondie d’un sARN d’E. faecium sélectionné, l’Ern0160, a permis de mettre en évidence la toute première cible directe d’un sARN de E. faecium. En effet, l’Ern0160 se lie spécifiquement à un ARN messager dont la protéine correspondante serait impliquée dans la virulence d’après un modèle expérimental murin. L’Ern0160 régule négativement l’expression de sa cible in vitro. L’impact de l’Ern0160 sur l’atténuation de la virulence de E. faecium reste à évaluer in vivo afin d’avoir une vision globale de son rôle dans la pathogénicité de ce dernier.
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Biologie et sciences de la santé
/ 12-07-2017
Ivain Lorraine
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Staphylococcus aureus est une bactérie pathogène opportuniste de l’Homme et de l’animal qui représente l’une des premières causes d’infections nosocomiales. A l’heure actuelle, la sévérité de ces infections est accentuée par l’augmentation des multi-résistances aux antibiotiques qui en font un problème majeur de santé public. La découverte et l’étude des ARN régulateurs (ARNrég) exprimés par le staphylocoque doré a permis de mettre en évidence leurs rôles de régulateurs de l’étape de colonisation et d’infection (quorum sensing, virulence, résistance aux antibiotique, adaptation environnementales). Au cours de ma thèse, je me suis intéressée à l’étude de deux ARNrég, SprD impliqué dans la virulence de la bactérie sur modèle animal murin et SprX régulant la résistance aux glycopeptides. Dans le but de comprendre les bases moléculaires de leurs rôles dans la bactérie, nous avons souhaité identifier et valider l’ensemble des cibles directes à ces deux ARN. Dans un premier temps, nous nous sommes intéressés à l’étude des nouvelles cibles de SprX. Pour cela, nous avons mis en place une approche in vivo de validation des cibles des ARNrég basée sur la technique des gènes rapporteurs. Nous avons ainsi pu valider deux nouvelles cibles de SprX, les ARNm ecb et purC impliqués respectivement dans l’évasion du système immunitaire et dans le métabolisme des purines. SprX interagit au niveau du site d’initiation de la traduction de ces deux ARNm, et inhibe leurs traductions. Par la suite, nous avons souhaité rechercher de nouvelles cibles pour SprD. Nous avons pu adapter à S. aureus une technique d’identification de nouvelles cibles des ARNrég. L’ensemble des résultats obtenus permettent de préciser les rôles déjà connus des deux ARNrég et offrent de nouvelles possibilités concernant l’étude et la validation des cibles potentielles.
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