Introduction : La coloproctectomie totale (CPT) avec anastomose iléo-anale (AIA) est actuellement le traitement chirurgical de référence de la rectocolite ulcéro-hémorragique (RCUH) et de la polypose adénomateuse familiale (PAF). Aux Cliniques Universitaires Saint Luc, l’Unité de chirurgie colorectale a fait le choix de réaliser exclusivement des anastomoses manuelles avec mucosectomie endo-anale (MEA). Le but de ce travail était donc d’évaluer les résultats fonctionnels à long terme et la pertinence oncologique de la MEA réalisée au cours de l’AIA manuelle après CPT pour RCUH et PAF. Matériel et méthodes : Tous les patients opérés d’une CPT avec AIA manuelle et MEA pour RCUH et PAF aux Cliniques Universitaires Saint-Luc de juin 1986 à octobre 2017 ont été inclus. Les données démographiques, fonctionnelles, anatomopathologiques sur pièce de MEA et les complications post opératoires ont été recueillies rétrospectivement. Deux questionnaires évaluant la qualité de vie (SF-36 et FIQL) ont été transmis aux patients. Résultats : Au total, 199 patients ont été inclus (61% d’hommes). L’âge moyen était de 32 ± 12 ans. Le suivi moyen était de 101 ± 73 mois. 132 avaient une RCUH et 67 une PAF. La fréquence moyenne de selles diurne était de 6 ± 3 et de 1 ± 1 pour les selles nocturnes. Le score de Wexner moyen était de 4 ± 1. L’incontinence diurne était absente dans 80% des cas et l’incontinence nocturne était absente dans 54% des cas de RCUH et 76% des cas de PAF (p=0.002). Le résumé physique du score SF-36 était de 70 ± 3 dans le groupe RCUH et de 82 ± 2 dans le groupe PAF (p = 0.005). Le score FIQL moyen était de 3 ± 0,1 pour la RCUH et de 3,4 ± 0,1 pour la PAF (p=0,02). D’un point de vue oncologique, 67% des patients du groupe PAF présentaient une lésion sur la pièce de MEA (deux carcinomes ont été découverts) alors que seulement 6% des patients du groupe RCUH en présentaient une. Conclusion : Les résultats montrent que la CPT avec AIA manuelle pour RCUH et PAF est une technique sûre et reproductible avec de bons résultats fonctionnels. Elle a également démontré son intérêt oncologique pour la PAF. Néanmoins, pour la RCUH, les résultats fonctionnels inférieurs et la faible proportion de dysplasies retrouvées sur les pièces de MEA laissent supposer que l’anastomose mécanique chez ces patients pourrait être une alternative à privilégier.