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Pharmacie
/ 17-12-2021
Morel-Handa Aya
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Après autorisation de mise sur le marché d’un nouveau médicament, son prix et taux de remboursement doivent être définis. Cette étape clé est encadrée par des procédures nationales qui régulent l’accès au marché du médicament. Les décisions impactent directement le taux de prescription du traitement, la stratégie thérapeutique et la prise en charge du patient. L’enjeu est donc double : pour l’industriel de réaliser des bénéfices et pour le patient d’avoir accès au meilleur traitement disponible. Le Japon est confronté à de nombreux défis, comme sa situation démographique et épidémiologique qui remettent en cause la soutenabilité de son système d’assurance maladie universelle. Afin de contrôler ses dépenses de santé, le gouvernement japonais agit sur de nombreux leviers régulant la tarification et le remboursement du médicament, cette thèse présente l’état actuel de l’accès au marché du médicament au Japon.
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Analyse et traitement de l'information et des images médicales
/ 17-12-2021
Tomasi Jacques
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La dissection aortique de type B non compliquée représente un véritable enjeu décisionnel pour le clinicien. En effet ces patients justifient du traitement médical optimal mais malgré ce traitement environ 30% présenteront une évolution anévrysmale justifiant d’une correction chirurgicale ou endovasculaire. La méthode de suivi consiste à répéter les investigations cliniques et d’imagerie. La simulation numérique pourrait apporter des informations supplémentaires de manière non-invasive pour affiner les décisions. Nous avons ainsi développé une méthode de segmentation de l’aorte disséquée spécifique au patient, implémenté des simulations fluides de référence, qui restent cependant coûteuses en temps de calcul. Ce modèle est ensuite réduit de manière à calculer rapidement les contraintes de pression en modifiant des critères permettant de simuler des scenarii cliniques différents. Ces travaux nous laissent imaginer la possibilité d’un jumeau numérique aortique sur lequel différentes conditions peuvent être simulées.
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Chimie physique, chimie théorique
/ 17-12-2021
Bassil Patricia
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La consommation rapide des ressources fossiles et la politique mondiale qui appelle à diminuer la dépendance aux énergies fossiles contribuent au développement des énergies renouvelables telles que l’énergie solaire et éolienne. La production des énergies renouvelables est finement liée aux conditions climatiques ce qui nécessite de développer des systèmes de stockage d’énergie. Parmi les systèmes de stockage électrochimique les plus prometteurs, l’accent est mis sur les batteries à flux redox du fait de leurs caractéristiques remarquables. En effet, l’architecture unique des batteries à flux redox offre un atout technologique d’importance : le découplage de la puissance disponible de la quantité d’énergie stockée. L’objectif de cette thèse consiste à étudier des espèces organiques susceptibles d’être utilisée comme négolyte dans les batteries à flux redox. Nous avons dans un premier temps étudié, une molécule organique, l’alizarine, qui a la capacité d’échanger deux électrons en milieu alcalin. Cette espèce a montré de bonnes performances au cours du cyclage, mais elle subit une transformation électrochimique sur l’électrode qui conduit à un deuxième système redox. Dans un deuxième temps, nous avons abordé l’influence des conditions de cyclage sur les performances de la batterie. L’ensemble des facteurs a été étudié au travers de plans d’expériences. Ensuite, les solvants eutectiques profonds sont introduits comme co-solvant dans les batteries à flux redox. Dans la dernière partie de cette thèse, un soin particulier a été pris pour identifier le nouveau composé redox issu de la transformation de l’alizarine, qui a été alors testé en batterie. Celui-ci a montré des performances prometteuses, qui pourront être encore améliorées en étudiant finement cette nouvelle molécule.
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Microbiologie, virologie, parasitologie
/ 17-12-2021
Bougon Juliette
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Les virus du syndrome dysgénésique et respiratoire porcin (SDRPV) et de l’influenza A porcin (swIAV) sont deux acteurs majeurs du complexe respiratoire porcin. Si les connaissances sur les mono-infections SDRPV ou swIAV sont nombreuses, les interactions possibles entre ces virus sont encore largement incomprises. De plus, les vaccins vivants atténués (modified live vaccine, MLV) anti-SDRPV sont administrés chez le porcelet lorsqu’une infection à swIAV peut survenir. Les objectifs de ce projet de thèse étaient d’étudier les effets cliniques, virologiques et immunologiques de la co-infection SDRPV/swIAV chez le porc et d’évaluer l’effet d’une infection grippale sur la vaccination MLV. Nous avons montré qu’une infection à swIAV réduit la multiplication du SDRPV au niveau pulmonaire, retarde la virémie MLV sans diminuer l’efficacité vaccinale et accélère la mise en place de la réponse cellulaire vis-à-vis du SDRPV. Par ailleurs, une pré-infection SDRPV entraîne l’atténuation des signes cliniques, des réponses inflammatoires et antivirales liées à l’infection grippale, et augmente les taux d’anticorps anti-swIAV (IgG, IgA, anti-HA et neutralisants) au niveau pulmonaire. Des analyses de corrélation ont montré que l’induction de la voie de l’interféron de type I, laquelle est bloquée par le SDRPV mais stimulée par le swIAV, paraît jouer un rôle clé dans cette interférence virale bidirectionnelle. L’étude des mécanismes sous-jacents a été initiée via des expériences de co-infections dans un système de co-culture de macrophages pulmonaires et de cellules épithéliales de trachée de porc. Les nouvelles connaissances acquises confirment l’importance de déterminer l’étiologie des syndromes respiratoires, pour adapter au mieux les moyens de maîtrise (dont les protocoles de vaccination) en tenant compte de l’ensemble des agents pathogènes impliqués.
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Analyse et traitement de l'information et des images médicales
/ 17-12-2021
Tabbal Judie
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En tant que système complexe, le cerveau traite de manière flexible les informations grâce à une reconfiguration dynamique des réseaux neuronaux sur une échelle de temps de l’ordre de la milliseconde. Un objectif majeur en neurosciences est de décrire l'organisation spatio-temporelle du cerveau comme une série d'«états de connectivité fonctionnelle » transitoires à travers une analyse dynamique des réseaux. Ce domaine prend de l'ampleur car il permet non seulement d'aborder les processus cognitifs, mais aussi d’apporter des informations importantes sur les altérations fonctionnelles des principaux motifs de connectivité dans le cadre des pathologies neurologiques. Dans ce contexte, deux enjeux principaux ont été identifiés : (1) A quel point les techniques de neuroimagerie non-invasives à haute résolution temporelle, tel que l'électro/magnétoencéphalographie (EEG/MEG), peuvent-elles suivre l’évolution temporelle rapide des états cérébraux essentiels durant l'exécution d’une tâche? (2) Comment les maladies neurologiques peuvent-elles affecter, spatialement et temporellement, les états dynamiques des réseaux cérébraux? Par conséquent, pour tenter de relever ces deux défis, les deux objectifs de ma thèse sont les suivants : 1. Estimer les états dynamiques des réseaux cérébraux à l’aide des techniques EEG/MEG. Le premier objectif consiste à explorer la méthodologie appropriée qui permet d'extraire des motifs de connectivité pertinents relatifs à l'activité neuronale lors de l'exécution d’une tâche. Tout d'abord, trois ensembles indépendants de données MEG chez des sujets sains ont été utilisés pendant des tâches motrice et de mnésique exécutées sur des échelles de temps variables. Nous avons utilisé la méthode de « EEG/MEG source connectivity » suivie d'une estimation dynamique des réseaux fonctionnels afin d’estimer la connectivité fonctionnelle dynamique au niveau cortical. Ensuite, plusieurs techniques de décomposition basées sur les données ont été appliquées pour réduire la dimension des réseaux dynamiques, et ceci en dérivant les principaux états cérébraux avec leur activation temporelle. La performance relative de ces techniques a été évaluée et comparée au niveau du groupe et au niveau individuel. Dans un second temps, une démarche similaire à la précédente a été testée sur des EEG virtuels produits par un modèle computationnel de cerveau humain dans lequel une tâche cognitive de dénomination d’images a été simulée en respectant une échelle de temps très rapide, afin d’évaluer quantitativement les méthodes de décomposition ainsi que certains facteurs clés utilisés. Principalement, les résultats qualitatifs et quantitatifs montrent les effets prometteurs des méthodes testées avec néanmoins une certaine variabilité en termes de précision spatiale et temporelle, liée à la complexité du scénario et à l'échelle temporelle. Cette étude basée sur une vérité terrain indique que le choix des méthodes peut influencer l'interprétation des résultats. 2. Détecter les anomalies de connectivité fonctionnelle au sein des réseaux cognitifs dans la maladie Parkinson. L'objectif principal de ce travail était d'identifier les principales altérations dans les états dynamiques des réseaux cérébraux cognitifs chez les patients Parkinsoniens. Pour cette étude, des données EEG de haute résolution (HD-EEG, 256 éléctrodes) ont été enregistrées à partir de 31 sujets (21 patients, 10 sujets sains) au cours de la tâche de conflit cognitif nommée Simon-Task. Une variante de l'analyse des composantes indépendantes a été utilisée pour dériver des composantes statistiquement indépendantes dans les deux groupes. Les résultats démontrent l’existence de différences spatiotemporelles dans les états dynamiques des réseaux cérébraux entre les sujets sains et les patients.
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Informatique
/ 17-12-2021
Cheron Antoine
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Le World Wide Web est principalement composé de deux types de composants applicatifs : les applications et les services. Les applications, qu'elles soit des applications mobiles ou Web, c-a-d ayant vocation à être utilisées depuis un navigateur, ont en commun qu'elles sont une sorte de texte à trous et communiquent avec les services pour personnaliser l'application pour chaque utilisateur. C'est donc le service qui possède et gère les données. Pour rendre possible cette communication, les services rendent disponible des APIs suivant l'architecture REST. La gestion du cycle de vie d'une API REST est alors un élément central du développement de systèmes dans le Web. La première étape de ce cycle de vie est la définition des exigences d'une API (fonctionnalité et propriétés logicielles). Ensuite, les technologies qui permettront de la concevoir, l'implémenter et la documenter sont choisies. Elle est ensuite implémentée et documentée puis mise en ligne. Dès lors, des applications peuvent l'utiliser. S'ensuit alors une phase de maintenance et d'évolution de l'API, dans laquelle les bogues sont corrigés et les fonctionnalités évolues pour s'adapter aux changements des attentes de ses utilisateurs. Dans cette thèse, nous passons en revue les méthodes et technologies qui accompagnent le développeur au cours de ce cycle de vie. Nous identifions deux challenges restant sans réponse. Premièrement, il existe de nombreuses technologies pour créer et documenter une API. Choisir les technologies les plus pertinentes pour un projet est une tâche difficile. Comme première contribution de cette thèse, nous établissons des critères permettant de comparer ces technologies. Ensuite, nous utilisons ces critères pour comparer les technologies existantes et proposons ainsi trois matrices de comparaison. Enfin, pour simplifier cette selection, nous avons développé un assistant open-source disponible sur le Web, qui guide le développeur dans son choix. Le second challenge que nous avons identifié est lié à la maintenance et l'évolution des APIs REST. La littérature existante ne permet pas de faire évoluer une API REST librement, sans risquer de rendre inopérantes les applications qui s'en servent (leurs clients). La seconde contribution de ce travail est une nouvelle approche à la co-évolution des APIs REST et de leurs clients. Nous avons identifié qu'en suivant 7 règles régissant la documentation de l'API et les données qu'elles renvoient en répondant à ses clients, il est possible de créer des interfaces utilisateur Web capable de s'adapter à la majorité des évolutions des APIs REST sans produire de bogues, ni les casser et sans même nécessiter la modification de leur code source.
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Informatique
/ 17-12-2021
Mercier Romain
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Depuis plusieurs décennies, la tolérance aux fautes est devenue un domaine de recherche majeur en raison du rétrécissement des transistors et de l’augmentation de la puissance des systèmes sur puce. En particulier, les défauts survenant dans les réseaux sur puce (Network-on-Chips - NoCs) de ces systèmes ont un impact significatif en raison de la grande quantité de données qui traversent les NoCs. De plus, les approches existantes de tolérance aux fautes ne peuvent pas traiter efficacement plusieurs fautes permanentes. Pour remédier à ces limitations, nous proposons la technique de brassage de bits (Bit-Shuffling - BiSu) qui réduit l’impact des fautes survenant dans le chemin de données des NoCs. Pour ce faire, l’approche proposée exploite, au moment de l’exécution, la position des défauts permanents et modifie l’ordre des bits à l’intérieur d’un flit. Notre méthode réduit, autant que possible, l’impact des fautes en les reportant sur les bits les moins significatifs, au lieu de les garder sur les bits les plus significatifs. Les résultats obtenus par des évaluations approfondies montrent que la méthode BiSu peut réduire l’impact de multiples défauts permanents, avec des coûts matériels faibles, par rapport aux approches existantes, comme le code de Hamming. Ensuite, nous proposons une approche de brassage de bits basée sur des régions (Region-based BiSu - R-BiSu) qui réduit les coûts matériels de la technique BiSu en réduisant son efficacité de tolérance aux fautes.
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Médecine Générale
/ 16-12-2021
Ambard Anaëlle
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Contexte : Compte tenu de la baisse du nombre de gynécologues et du suivi non optimal des femmes, les médecins généralistes jouent un rôle important en gynécologie de premier recours. Pourtant, l’examen peut être vécu comme inconfortable notamment par les hommes. Cette difficulté apparaît dès le début de la formation en gynécologie. Objectifs : Nous nous intéressons donc au ressenti des internes masculins lors de l’examen gynécologique puis à leurs attentes sur leur formation en gynécologie. Matériel et méthode : Étude qualitative inspirée de la théorisation ancrée à visée phénoménologique. L’analyse a porté sur dix entretiens semi-directifs auprès d’internes de Rennes ayant fait leur stage de gynécologie et leur SASPAS. Résultats : Le ressenti résulte de l’intrication de leurs représentations et des connaissances théoriques et pratiques mises en application lors de la relation particulière avec la patiente. L’encadrement pédagogique joue un rôle important. Le vécu durant leur formation conditionnerait leur intention de pratiquer la gynécologie plus tard. Ils attendent une formation professionnalisante, basée sur des objectifs d’acquisition de compétence : le savoir-faire et le savoir-être à l’aide d’un encadrement adapté à chaque niveau de maîtrise. Conclusion : Le vécu de l’examen gynécologique par les étudiants masculins dépend de plusieurs facteurs et pourrait conditionner leur pratique future. Une formation adaptée à la pratique de la gynécologie en médecine générale est donc nécessaire.
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Informatique
/ 16-12-2021
Torregrossa François
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Les données présentent des natures hétérogènes: textes, graphes et hiérarchies. Dans cette thèse, nous traitons l’ensemble des manières de représenter ces trois types en tirant profit d’espaces géométriques adaptés à chacun. Au départ, nous étudions les plongements de mots pour la représentation de textes et tentons d’évaluer leur qualité et de proposer des propriétés déterminant leur efficacité. L’enrichissement de ces plongements par des connaissances expertes nous permet de mieux traiter une tâche industrielle. À partir de ce constat, nous cherchons d’autres moyens pour obtenir des connaissances structurées (hiérarchies) à partir de sources disponibles gratuitement (Linked Open Data) ou à partir d’informations à plat contenus dans des textes (induction de taxonomies) ou d’autre types de bases de données. Ces hiérarchies de connaissances sont représentés au mieux par des plongements hyperboliques, et nous proposons une nouvelle méthode de plongement dans ces espaces. Le but est de limiter la perte d’information de la hiérarchie à l’espace continue, puis de déterminer une manière de combiner ces nouvelles connaissances dans les plongements de mots usuels.
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Médecine générale
/ 16-12-2021
Cherif Ronan
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Introduction : L’intérêt porté à la santé au travail a été croissant à travers le siècle dernier. Les études chez les soignants se multiplient et les chiffres sont inquiétants. L’étude de l’intérêt du dispositif de disponibilité chez les internes n’a pas encore été réalisée. Ce dispositif semble s’inscrire comme une stratégie d’ajustement ou coping chez les internes. Objectif : Caractériser le ressenti des internes de médecine générale sur la place et l’intérêt d’un semestre de disponibilité au cours de leur cursus. Méthode : Etude qualitative basée sur des entretiens semi-dirigés, réalisée auprès d’internes ayant fait au moins un semestre de disponibilité au cours de la période du 1er Mai 2017 au 1er Mai 2020. Analyse des verbatims par double codage indépendant et triangulation des données. Résultats : La disponibilité s’inscrit comme une pause nécessaire dans un cursus ou l’exposition aux facteurs favorisants du stress et du syndrome d’épuisement professionnel est importante. C’est l’exposition à ces facteurs favorisants qui est la motivation principale de la demande de disponibilité, même si le syndrome d’épuisement n’est pas objectivé. Les bénéfices rapportés sont supérieurs aux inconvénients. Le dispositif de disponibilité représente chez l’ensemble des internes interrogés une expérience positive et est recommandé par tous. Discussion / Conclusion : Les motivations pour la réalisation d’une disponibilité sont plus compliquées qu’elles n’y paraissent. Bien que la majorité des internes ne se considère pas en Burn-out au moment de la demande de la disponibilité, ce dispositif correspond à une stratégie de coping, en deux temps (centré sur les émotions puis sur le problème). Pour ces internes, la pratique médicale au cours de l’internat a été en inadéquation avec leur conception de la médecine générale. Cette pratique est responsable d’une exposition quotidienne aux facteurs favorisants du stress et du syndrome d’épuisement professionnel. La disponibilité en tant que stratégie de coping, permet à certains internes de finir leur cursus dans de meilleurs conditions, ou de le finir tout simplement.
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