Tri :
Date
Titre
Auteur
|
|
Analyse et traitement de l'information et des images medicales
/ 02-12-2020
Marage Louis
Voir le résumé
Voir le résumé
L’Imagerie par Résonance Magnétique (IRM) est une application majeure de la physique quantique accessible à l’échelle macroscopique. Elle permet, dans le cadre de son utilisation en santé, d’imager les organes internes d’un patient en fournissant des contrastes paramétrables en fonction de la localisation et/ou de la pathologie étudiée. Il est possible de passer de ces images résolues et contrastées à une imagerie quantitative, et donc à une caractérisation tissulaire précise. Dans la pratique clinique néanmoins, l’IRM quantitative, n’est que marginalement utilisée. Cela vient principalement du fait que ces méthodes de caractérisation tissulaire prennent un temps précieux à la fois lors de l’acquisition, mais également pour le post-traitement nécessaire à l’extraction des paramètres quantitatifs. Néanmoins, l’information plus riche et synthétique extraite fera, à terme, gagner un temps précieux au praticien. L’objectif de ces travaux de thèse est donc de proposer une mise en oeuvre de méthodes de quantification qui ne nécessitent pas le recours à des agents de contrastes dont l’utilisation peut être contre-indiquée. Ces méthodes comprennent notamment la quantification des temps de relaxation caractéristiques des tissus, de leurs différentes composantes comme la fraction de graisse, mais également de leurs paramètres de diffusion et de perfusion. Les méthodes de quantification proposées dans ce travail de thèse seront confrontées aux contraintes cliniques et des outils permettant une extraction plus simple et rapide des biomarqueurs quantifiés sont proposés. Ces méthodes sont illustrées ici dans des localisations anatomiques de la plus à la moins contraignante, allant de l’imagerie thoracique à celle du poignet en passant par le rachis lombaire.
|
|
Chimie moléculaire et macromoléculaire
/ 02-12-2020
Percevault Lucie
Voir le résumé
Voir le résumé
Dans ce travail, nous développerons l’utilisation de solvants eutectiques profonds (DES) pour l’hydrolyse des polysaccharides et l’extraction de métabolites de macroalgues. Nos cibles privilégiées seront les polyphénols, les caroténoïdes ou encore les chlorophylles présentant un pouvoir antioxydant intéressant en cosmétique. L’objectif de ces travaux est de caractériser les DES et d’extraire des métabolites d’algues avec ces solvants pour qu’ils soient formulés en cosmétique. Les DES sont composés de deux ou trois constituants pouvant s’associer via des liaisons hydrogènes. Ils ont la particularité de former un eutectique leur donnant un point de fusion plus bas que leurs composants seuls. De nombreux constituants peuvent jouer le rôle d’accepteur et de donneur de liaison hydrogène dans les DES comme les alcools, les sucres, les acides organiques, les acides aminés ou encore les ammoniums quaternaires. Dans ce manuscrit, nous aborderons la caractérisation physico-chimique de ces solvants (teneur en eau, miscibilité, pH, viscosité, conductivité, polarité…). Une étude de l’impact de la dilution dans l’eau sera également effectuée. Une partie de ces travaux sera consacrée aux interactions et liaisons hydrogènes établies par spectroscopie RMN, spectrométrie de masse et RAMAN. Après l’étude de ces paramètres physico-chimiques et structuraux, les différents facteurs d’extraction des composés d’intérêt seront évalués. Nous aborderons ainsi l’influence de l’espèce d’algue utilisée, le pourcentage de matière sèche introduit, le solvant utilisé, la température ou encore le temps d’extraction. L’ensemble de ces facteurs sera étudié au travers de plans d’expériences de criblage.
|
|
Signal, image, vision
/ 02-12-2020
Liu Jie
Voir le résumé
Voir le résumé
Le travail dans cette thèse concerne l’identification du modèle IntraVoxel Incoherent Motion (IVIM) des images IRM de diffusion. Cette identification a pour objectif la quantification de diffusion et de perfusion des tissus humains avec une application aux images IRM du foie et de la moelle osseuse. La première partie de ce travail de thèse porte sur la détection d’une potentielle présence d’un volume partiel dans la région d’intérêt. Ce problème d’identification est formulé sous forme d’un problème d’identification d’un modèle IVIM tri-exponentiel sous contraintes de parcimonie de la distribution spatiale du volume partiel dans la région d’intérêt étudiée et de la non-négativité des paramètres de ce modèle. La prise en compte d’informations spatiales est rendue possible grâce au modèle IVIM multi-voxel introduit dans cette thèse et permettant un traitement simultané de l’ensemble de voxels définis dans la région d’intérêt considérée. L’approche proposée, ne permet pas seulement une bonne identification du volume partiel mais aussi une quantification de la diffusion et de la perfusion du tissue étudié. La deuxième partie de cette thèse porte sur la comparaison de méthodes d’identification du modèle IVIM bi-exponentiel avec une application aux images IRM de diffusion de la moelle osseuse. La dernière partie de cette concerne l’amélioration de la quantification des images métaboliques (Chemical Shift Imaging) par l’introduction d’un fantôme virtuel comme une référence dans l’image acquise.
|
|
Médecine générale
/ 01-12-2020
Guillouet-Lamy Manon
Voir le résumé
Voir le résumé
Introduction L’alcool, substance psychoactive la plus consommée en France, est responsable d’une morbi mortalité importante. Le dépistage des patients ayant un trouble d’usage d’alcool (TUA) est essentiel. Les objectifs de ce travail sont d’identifier les obstacles au repérage précoce des TUA et de faire émerger des pistes d’amélioration. Méthode 14 entretiens semi-dirigés ont été réalisés entre janvier et août 2020 auprès de médecins généralistes installés en Ille-et-Vilaine et dans le Morbihan. L’analyse a été faite par théorisation ancrée. Résultats Les médecins déplorent le manque de temps et de formation, craignent la réaction du patient et n’utilisent pas d’outil pour ce repérage. Les consommations des médecins influencent le dépistage. La peur du jugement, le déni, la banalisation de l’alcool et les méconnaissances des dangers constituent des freins côté patient. Discussion Le RPIB, efficace, est sous-utilisé. Nos résultats confirment les données de la littérature. Une thèse quantitative serait intéressante pour évaluer le poids de chacun des obstacles. Conclusion Encore trop de freins entourent le sujet de l’alcool en consultation pour permettre un repérage précoce.
|
|
Pharmacologie
/ 30-11-2020
Mena Youri
Voir le résumé
Voir le résumé
Revue des paramètres pharmacocinétiques en vie réelle de la daptomycine ainsi que des différents paramètres pharmacodynamiques décrits dans la littérature (AUC/CMI>666, Cmax/CMI entre 60 et 100 µg/ml, Cmin<24,3 µg/ml) au cours d’une étude observationnelle rétrospective multicentrique à partir des dosages de daptomycine réalisés à Rennes entre 2015 et 2019. On observe une variabilité intra et interindividuelle vis-à-vis de la relation dose-concentration dans une population septique sans vérification de la linéarité de la relation dose-concentration décrite lors des études précliniques chez le volontaire sain. Par ailleurs, les cibles pharmacodynamiques sont atteintes dans tous les cas étudiés lorsque les CMI sont < 1, c’est-à-dire pour les staphylocoques, sans nécessité d’adaptation posologique. Les cibles pour les entérocoques ne sont pas établies donc aucune conclusion sur l’atteinte des cibles dans des infections causées par ce germe. Dans cette étude, la relation concentration-toxicité décrite pour la survenue de l’élévation des CPK sous traitement par daptomycine pour une Cmin > 24,3 µg/ml n’est pas vérifiée. Les données recueillies ne permettent pas d’identifier une population qui serait plus à risque de développer ce type d’effet indésirable. Le suivi thérapeutique pharmacologique de la daptomycine ne montre pas un bénéfice évident dans l’atteinte des cibles d’efficacité, en tous cas pour les bactériémies. La question reste pertinente pour les infections ostéo-articulaires du fait d’une faible diffusion de la molécules au niveau osseux. La relation concentration-toxicité est à remettre en question. Toutefois les patients traités par daptomycine haute dose peuvent présenter des concentrations plasmatiques élevées sans justification bactériologique ni pharmacologique et le suivi thérapeutique pharmacologique peut permettre de détecter ces situations.
|
|
Informatique
/ 30-11-2020
Roussanaly Victor
Voir le résumé
Voir le résumé
Les automates temporisés sont souvent utilisés pour modéliser des systèmes en temps réel. Le problème d'accessibilité est notamment étudié puisqu'il permet de vérifier des propriétés de sûreté mais aussi de générer des contrôleurs pour réaliser une tâche. Bien que ce problème soit déjà résolu depuis plus de 25 ans et implémenté dans plusieurs outils, nous proposons des algorithmes pour accélérer ces méthodes dans des cas particuliers. Pour le problème de sureté nous proposons des méthodes basées sur des abstractions de zones temporelles, surestimant les parties accessibles. Ces abstractions sont ensuite successivement raffinées grâce à une boucle CEGAR. Pour le problème de génération de contrôleur, nous proposons des algorithmes basées sur des exploration heuristiques et A*. Nous présentons aussi des implémentations de ces algorithmes, ainsi que des résultats sur des différents exemples.
|
|
Sciences des matériaux
/ 27-11-2020
Guy Kévin
Voir le résumé
Voir le résumé
Ces travaux de recherche portent sur la synthèse de nitrures et carbures de molybdène (Mo2N, Mo5N6, Mo2C) pour la catalyse hétérogène de la réaction de Water-Gas Shift : CO + H2O --> CO2 + H2. Ils s’inscrivent dans une collaboration entre l’Université de Rennes 1, le CNRS, Saint-Gobain Research Provence et le NIMS-LINK (Japon). Une voie de synthèse originale mettant en jeu des composés à cluster de métaux de transition a été mise au point. L’utilisation de cette nouvelle gamme de précurseurs permet l’obtention de nitrures et carbures de molybdène avec des surfaces spécifiques plus élevées et des tailles de particules plus faibles que celles relevant de voies plus classiques. L’impact de cette voie de synthèse sur les propriétés physico-chimiques se répercute sur l’activité catalytique des nitrures et carbures de molybdène. La phase Mo5N6 a montré des propriétés catalytiques adaptées pour une utilisation telle que les piles à combustible pour véhicule.
|
|
Santé publique
/ 27-11-2020
Dubreil Estelle
Voir le résumé
Voir le résumé
Les colorants de la famille des triarylméthanes sont interdits en aquaculture à cause de leur toxicité. Malgré cela, ils sont toujours utilisés en aquaculture du fait de leurs propriétés antiseptiques et antifongiques, de leurs faibles coûts et de leur disponibilité en tant que produits chimiques pour certaines industries. Afin de protéger les consommateurs, la réglementation européenne impose des contrôles stricts des résidus de substances interdites dans les denrées d’origine animale. En France, pour les colorants à activité pharmacologique, ce contrôle est ciblé sur la présence de résidus de vert de malachite, de cristal violet et de vert brillant dans les produits d’aquaculture, incluant leurs résidus marqueurs métabolisés sous forme de leuco-bases. Pour anticiper le futur de la surveillance des colorants face à d’éventuelles nouvelles pratiques d’usages, cette thèse a exploré différentes approches reposant sur l’analyse du métabolome par chromatographie liquide couplée à la spectrométrie de masse à Haute Résolution et des méthodologies in vitro et in vivo. Les résultats de ce projet apportent des données i) sur le comportement et le devenir de colorants dans les poissons et ii) sur leurs effets, en vue de proposer des marqueurs de traitement issus de l’endo-métabolome et/ou de le xéno-métabolome. Nous avons pu observer une perturbation biologique sur la production d’acides biliaires après traitement au vert de malachite et au victoria pure blue bo (VPBO). Par ailleurs, un métabolite direct issu du traitement de truites au VPBO, le dééthyl-leuco-VPBO, a été souligné comme un résidu marqueur approprié dans le muscle et la peau de poisson. Enfin, une méthode analytique de détection étendue à d’autres familles de colorants, et incluant de nouveaux résidus marqueurs de traitement, a été développée par chromatographie liquide couplée à la spectrométrie de masse en tandem.
|
|
Photonique
/ 27-11-2020
Guionie Marie
Voir le résumé
Voir le résumé
Cette étude porte sur les lasers à fibres bifréquences bipolarisations. Le contrôle de la différence de fréquence de ces lasers représente un enjeu important en photonique microonde. En effet, maîtriser le battement permettrait la réalisation de sources compactes et à faible bruit visant des applications de métrologie ou télécom. Nous travaillons ici sur des sources émettant à 1,5 μm, de type DFB ou DBR, soit dopés Er soit co-dopés Er-Yb. Ils présentent une fréquence de battement d'environ 1 GHz pour les DFB, et 100 MHz pour les DBR. Les objectifs de la thèse ont été, d'abord de stabiliser le battement, puis d'explorer différentes méthodes pour modifier la biréfringence de la fibre et ainsi accroître la fréquence de battement. Nous avons d'abord utilisé la méthode de stabilisation par boucle à verrouillage de phase pour asservir le battement sur une fréquence de référence. En nous servant de la diode de pompe comme actuateur, nous avons réussi à stabiliser des battements entre 300 MHz et 10 GHz pendant plusieurs jours. Ensuite, nous avons mis en place une méthode de stabilisation par réinjection optique décalée en fréquence. Un modèle théorique basé sur des équations-bilan couplées a été utilisé et a permis de retrouver les observations expérimentales. En stabilisant le battement sur une référence extérieure, différents régimes dynamiques ont été observés. Dans la zone stable, on réduit le bruit de phase jusqu'à −100 dBc/Hz à 1 kHz de la porteuse. Puis, nous avons couplé le montage de la réinjection optique a une ligne à retard, afin de stabiliser efficacement le battement sur lui-même. Enfin, nous avons étudié plusieurs pistes pour augmenter la fréquence de battement des lasers DBR pour répondre aux besoins des applications. Nous avons pu suivre en temps réel la modification de biréfringence photo-induite par un faisceau UV. Nous avons aussi étudié une méthode de modification réversible de la biréfringence, en exploitant l'effet élasto-optique. Quelque soit la méthode employée, nous avons observé un accroissement de la fréquence de battement depuis 100 MHz jusqu'à plus de 10 GHz dans le meilleur des cas.
|
|
Medecine d'urgence
/ 27-11-2020
Boulidard Etienne
Voir le résumé
Voir le résumé
Introduction : l’arrêt cardiaque extrahospitalier ( ACREH ) est un problème de santé publique majeur car il est fréquent et doté d’une morbi-mortalité élevée. Son pronostic repose essentiellement sur le déclenchement de la chaine de survie, elle-même basée sur l’identification de l’ACREH. Cette dernière peut être mise en défaut lorsque l’ACREH n’est pas identifié ou lorsqu’il l’est trop tardivement. Des systèmes d’aide pourraient augmenter le taux d’ACREH reconnus au premier appel et raccourcir ces délais. Le champ de l’intelligence artificielle pourrait en constituer un. Un modèle d’apprentissage automatique basé sur le contenu sémantique a déjà été développé pour prédire l’ACREH. Le contenu phonatoire probablement discriminant reste quant à lui inexploité. Objectif : l’objet de cette étude est, à partir d’une comparaison de deux populations ACREH et non ACREH, de créer et d’évaluer des modèles prédictifs d’ACREH s’appuyant sur l’analyse du spectre vocal de l’appelant lors d’un appel au 15. Matériel et méthodes : 2000 enregistrements ont été extraits de la base de données du SAMU 35 sur une période de janvier 2015 à juin 2019. 1578 enregistrements ont été inclus. 747 dans le groupe ACREH. 831 dans le groupe NON ACREH. Deux modèles statistiques ont été expérimentés pour construire l’algorithme. Le premier reposant sur une régression logistique binaire. Le deuxième reposant sur une méthode d’apprentissage automatique à partir d’un réseau de neurones profonds. Résultats : les deux groupes ACREH et non ACREH présentaient des différences significatives concernant plusieurs variables issues de l’analyse de la phonation. Ces variables nous ont permis de construire deux modèles prédictifs, tous les deux performants pour identifier l’ACREH. Avec respectivement 71,2 % de réponses correctes pour la régression et une aire sous la courbe ROC de 0,779 pour le réseau de neurones profonds. Conclusion : cette étude montre la possibilité de prédire l’ACREH avec des algorithmes prédictifs basés sur des paramètres phonatoires. Mais les performances de ces algorithmes dans cette étude sont cependant insuffisantes pour envisager de les laisser seuls décideurs. La construction de modèles intégrant en plus des données phonatoires, des données sémantiques et visuelles pourraient en améliorer l’efficience.
|
|