Tri :
Date
Titre
Auteur
|
|
Psychiatrie
/ 04-12-2020
Moulin Louis
Voir le résumé
Voir le résumé
Contexte : Les troubles neuro-fonctionnels (TNF) sont fréquents et sévères. Sur le plan physiopathologique, des études d’imagerie et des études cognitives suggèrent qu’il existe une perturbation de l’initiation motrice. Ce paramètre peut être étudié par la tâche de Libet via l’obtention d’un jugement d’intention (reflet de l’intention motrice) et un intervalle inter-jugement (mesure indirecte de son altération). Sur le plan thérapeutique, une amélioration clinique suite à un traitement par rTMS (stimulation magnétique trans-crânienne répétitive) a pu être observée dans la littérature. Nous faisons l’hypothèse qu’une modification de l’intention motrice et des intervalles inter-jugement peut-être observée en post-rTMS chez les patients souffrants de TNF. Méthode : Sept patients souffrants de TNF hospitalisés au CHU de Rennes ont été inclus. L’évaluation initiale avant rTMS, nous permettait de décrire cette population et d’obtenir des scores de référence clinique, psychiatrique et cognitif avec la tâche de Libet. Ces scores étaient ensuite comparés avec les scores obtenus lors de la réévaluation à 1 mois de la rTMS . Résultats : Six patients ont complétés la tâche. Quatre présentaient une comorbidité dépressive et anxieuse ainsi que des antécédents de traumatismes dans l’enfance (n=3). Les résultats post-rTMS sur le critère de jugement principal ne permettaient pas d’observer des modifications des jugement d’intention ou des intervalles inter-jugement. Les scores cliniques post rTMS n’étaient pas en faveur d’une amélioration. Conclusion : L’absence de modification du jugement d’intention et la population incluse ne nous permet pas de conclure sur notre objectif principal. Les données obtenues via l’échelle de Libet ne peuvent pas être associées aux échelles cliniques de façon homogène. Les scores cliniques post-rTMS ne sont pas en faveur d’une efficacité de celle-ci. Des études ultérieures sont nécessaires afin d’établir des paramètres de rTMS optimaux et de tester à nouveau notre hypothèse.
|
|
Sciences de la terre et de l'environnement
/ 04-12-2020
Westerweel Jan
Voir le résumé
Voir le résumé
Résumé : L'orogène Himalayen-Tibétain, formé principalement par la collision Inde-Asie, représente une interaction complexe de la tectonique, du climat et des processus environnementaux. Cependant, l’évolution paléogéographique et la chronologie de la collision, restent l'objet d'un débat intense. Cette controverse est en partie le résultat d'une sous-étude de la partie orientale de l'orogène Himalayen. L’histoire paléogéographique du Terrane de Birmanie (Myanmar) est particulièrement incertaine mais importante pour une meilleure compréhension de la collision Inde-Asie. C'est pourquoi cette thèse présente des données uniques de paléomagnétisme sur des roches du Crétacé au Miocène de la région du Myanmar. Avec les données sédimentologiques et géochronologiques, ces résultats ont été incorporés dans des reconstructions de la tectonique des plaques pour élucider l'histoire paléogéographique du Terrane de Birmanie lors de la collision Inde-Asie. Les trois principaux résultats sont: (1) le Terrane de Birmanie était situé dans une position équatoriale très éloignée de l'Asie du Crétacé au Paléocène, (2) il a été incorporé à la plaque Indienne au cours du Paléocène, et (3) il s'est ensuite déplacé vers le nord avec la plaque Indienne. Ce déplacement latitudinal explique pourquoi le Myanmar n’enregistre pas de déformation compressive majeure avant la fin de l'Oligocène - début du Miocène. Par contre les bassins sédimentaires du Myanmar reçoivent les produits de l’érosion de la zone de collision. Une exhumation très rapide au niveau de la Syntaxe Est-Himalayenne est mise en évidence dans les sédiments du Miocène inférieur. L'ensemble des données permet de proposer un modèle de collision Inde-Asie avec un Arc Trans-Téthysien, qui comprend le Terrane de Birmanie formé à partir de fragments crustaux du Gondwana. Ce modèle invite à une réévaluation critique de nombreux aspects de l'histoire tectonique régionale et des paléoenvironnements.
|
|
Informatique
/ 04-12-2020
Lecompte Lolita
Voir le résumé
Voir le résumé
Les variants de structure (SVs) sont des réarrangements génomiques de plus de 50 paires de base et restent encore aujourd'hui peu étudiés malgré les impacts importants qu'ils peuvent avoir sur le fonctionnement des génomes. Récemment, les technologies de séquençage de troisième génération ont été développées et produisent des données de longues lectures qui s'avèrent très utiles car elles peuvent chevaucher les réarrangements. À l'heure actuelle, les méthodes bioinformatiques se sont concentrées sur le problème de la découverte de SVs avec des données de longues lectures. Aucune méthode n'a cependant été proposée pour répondre spécifiquement à la question du génotypage de SVs avec ce même type de données. L'objectif du génotypage de SVs vise pour un ensemble de SVs donné à évaluer les allèles présents dans un nouvel échantillon séquencé. Cette thèse propose une nouvelle méthode pour génotyper des SVs avec des longues lectures et repose sur la représentation des séquences des allèles. Notre méthode a été implémentée dans l'outil SVJedi. Nous avons testé notre outil à la fois sur des données simulées et réelles afin de valider notre méthode. SVJedi obtient une précision élevée qui dépasse les performances des autres outils de génotypage de SVs, notamment des outils de détection de SVs et des outils de génotypage de SVs de lectures courtes.
|
|
Informatique
/ 04-12-2020
Tran Van-Hoang
Voir le résumé
Voir le résumé
Le nuage informatique est devenu de plus en plus un standard pour réduire les coûts et permettre l'élasticité. Alors que les fournisseurs de nuages élargissent leurs services, les préoccupations relatives à la sécurité des données externalisées empêchent une adoption généralisée des technologies des nuages. Pour y remédier, le chiffrement est généralement utilisé pour protéger les données confidentielles stockées et traitées sur des nuages non fiables. Le chiffrement des données externalisées diminue toutefois les fonctionnalités des applications parce que la prise en charge de certaines fonctions fondamentales sur les données chiffrées est encore limitée. Cette thèse se concentre sur le problème de la prise en charge des requêtes d'intervalle sur des données chiffrées stockées dans les nuages. De nombreuses études ont été introduites dans ce domaine. Néanmoins, aucun des schémas précédents ne montre des performances satisfaisantes pour les systèmes modernes, qui exigent non seulement des réponses à faible latence, mais aussi une haute évolutivité. En particulier, la plupart des solutions existantes souffrent soit d'un traitement inefficace des requêtes d'intervalle, soit d'un manque de confidentialité. Même si certaines peuvent assurer à la fois une protection élevée de la vie privée et un traitement rapide, elles ne satisfont pas aux exigences d'évolutivité, à savoir un haut débit d'ingestion, une surcharge de stockage pratique et des mises à jour légères. Pour surmonter ces limites, nous proposons des solutions évolutives sur le traitement des requêtes d'intervalle sécurisées tout en préservant l'efficacité et une sécurité forte. Nos contributions sont les suivantes : (1) Nous adaptons l'une des solutions de pointe au contexte de haut débit de données entrantes qui crée souvent des goulets d'étranglement. En d'autres termes, nous introduisons et intégrons la notion de modèle d'index dans l'une des solutions de pointe afin qu'elle puisse s'adapter au contexte cible. (2) Nous développons un cadre d'ingestion intensive dédié au traitement de requêtes d'intervalle sécurisée sur des données chiffrées. En particulier, nous reconcevons l'architecture de la première contribution pour la rendre entièrement distribuée. Une présentation des données et une méthode asynchrone sont ensuite introduites. Ensemble, elles augmentent significativement la capacité de réception du système. En outre, nous adaptons le cadre à un type d'adversaires plus forts (par exemple, les attaquants en ligne) et améliorons son aspect pratique. (3) Nous proposons un schéma pour le traitement des requêtes d'intervalle privées sur des ensembles de données externalisés. Ce schéma répond au besoin d'une solution évolutive en termes d'efficacité, de haute sécurité, de surcharge de stockage pratique et de nombreuses mises à jour, qui ne peuvent être pris en charge par les protocoles existants. À cette fin, nous développons notre solution basée sur des conteneurs de données de taille égale et des index sécurisés. Le premier permet de protéger la confidentialité des données contre l'adversaire, tandis que le second permet l'efficacité. Pour permettre des mises à jour légères, nous proposons de découpler les index sécurisés de leurs conteneurs en utilisant des bitmaps de taille égale.
|
|
Signal, image, vision
/ 04-12-2020
Carlo Diego Di
Voir le résumé
Voir le résumé
La plupart des méthodes de traitement du signal audio considèrent la réverbération et en particulier les échos acoustiques comme une nuisance. Cependant, ceux-ci transmettent des informations spatiales et sémantiques importantes sur les sources sonores et des méthodes essayant de les prendre en compte ont donc récemment émergé.. Dans ce travail, nous nous concentrons sur deux directions. Tout d’abord, nous étudions la manière d’estimer les échos acoustiques à l’aveugle à partir d’enregistrements microphoniques. Deux approches sont proposées, l’une s’appuyant sur le cadre des dictionnaires continus, l’autre sur des techniques récentes d’apprentissage profond. Ensuite, nous nous concentrons sur l’extension de méthodes existantes d’analyse de scènes audio à leurs formes sensibles à l’écho. Le cadre NMF multicanal pour la séparation de sources audio, la méthode de localisation SRP-PHAT et le formateur de voies MVDR pour l’amélioration de la parole sont tous étendus pour prendre en compte les échos. Ces applications montrent comment un simple modèle d’écho peut conduire à une amélioration des performances.
|
|
Médecine
/ 03-12-2020
Rogel Arthur
Voir le résumé
Voir le résumé
L'utilisation d'exosquelettes au travail intéresse un nombre croissant d'entreprises afin de prévenir le risque de survenue de troubles musculo-squelettiques (TMS). Si les données actuelles tendent à montrer une diminution de l'effort musculaire local lors de leur utilisation, il n'existe pas de preuve de leur efficacité pour la prévention du risque TMS lui-même. Il est nécessaire de conseiller les entreprises lors de l’utilisation de ces dispositifs, afin d'évaluer le bénéfice réel en situation de travail. Nous avons mesuré l'effet sur la charge physique de travail d'un exosquelette non robotisé des membres supérieurs, développé pour les techniciens d'intervention de travaux sous haute tension A. Nos résultats montrent une amélioration de la perception de l’effort général, des épaules et des bras, sans augmentation de l'astreinte cardiaque, mais l'acceptation du dispositif par les utilisateurs semblait plutôt faible. Ceci pourrait être expliqué par les contraintes ressenties lors de l'utilisation de l'exosquelette (inconfort, encombrement), ainsi que par d’autres facteurs de risques de TMS (organisationnels et psychosociaux), à résoudre en priorité avant l'intégration effective d'un exosquelette au travail.
|
|
Medecine
/ 03-12-2020
Guellaff Hélène
Voir le résumé
Voir le résumé
Introduction : Des questions se posent sur la ré-organisation des soins primaires afin de palier au déficit de médecins généralistes dans certaines zones (blanches), une des solutions serait la mise en place d'assistants médicaux dans les cabinets libéraux de médecine générale. Ce nouveau métier est peu connu. Comment les médecins généralistes perçoivent-t-il la place des assistants médicaux dans leur pratique ? Objectif : Explorer le ressenti des médecins généralistes sur l'intérêt des assistants médicaux. Méthode : Étude qualitative par entretiens individuels semi-dirigés auprès de dix médecins costarmoricains. Résultats : Différentes compétences semblent importantes à acquérir pour l'assistant médical, celles-ci étant variables selon les besoins du médecin : rôle administratif et de coordination, savoir réaliser un interrogatoire minimal, réaliser quelques actes cliniques et para-cliniques. Le profil de l'assistant médical reste donc difficile à définir. Les freins majeurs semblent être la nécessité de disposer d'une pièce supplémentaire pour cet assistant ainsi que la crainte de perte la relation singulière médecin-patient et le problème du financement. Une meilleure information des médecins sur la proposition faite par l'assurance maladie paraît nécessaire. L'objectif quantitatif de l’assurance maladie semble loin de l'objectif qualitatif ressenti par les médecins. Discussion : Cette étude permet d'entrevoir les attentes des médecins généralistes sur les assistants médicaux. Les systèmes de santé dans les pays voisins sont différents avec un accès aux spécialistes plus limités mais les médecins généralistes semblent avoir un bagage technique plus important. Cette médecine générale n'est pas enseignée dans nos facultés. Conclusion : Les médecins généralistes restent mitigés sur l'intérêt de travailler en binôme avec un assistant. Celui-ci est difficilement intégrable dans le système de santé actuel où beaucoup de professionnels tentent de trouver leur place. Il semble important de garder un système pluri-modal où chacun puisse avoir sa pratique de la médecine générale.
|
|
Sciences pharmaceutiques
/ 03-12-2020
Pham Thu Ha
Voir le résumé
Voir le résumé
Le cancer du sein (CS) est le cancer le plus fréquent chez les femmes. Pour le CS triple-négatif et le CS résistant à l’hormonothérapie, l’option de traitement est limitée. L’objectif de ces travaux de thèse est d’étudier le potentiel thérapeutique des molécules naturelles, les glycéollins et l’apigénine, contre ces différents sous-types de CS. Les glycéollins sont des phytoalexines produits dans le soja lors de l’exposition à certains éliciteurs. Nous avons montré, pour la première fois, que glycéollin I (GI) et glyceollin II (GII) sont les ligands du récepteur aux hydrocarbures aromatiques (AhR). Ils sont capables de se lier à l’AhR et de présenter des effets agonistes et antagonistes partiels envers ce récepteur. D’autre part, GI et GII inhibent la migration des cellules de CS triple-négatif, MDA-MB-231, en modifiant l’expression des gènes codant pour des facteurs majeurs de la migration et de l’invasion cellulaire telles que la N-cadhérine ou la chimiokine CCL2. L’apigénine (Api) est une flavone trouvée dans plusieurs aliments végétaux. Afin d'étudier l'effet de l'Api dans un contexte de cellules cancéreuses mammaires hormono-résistantes, nous avons surexprimé, de manière stable, une forme constitutivement active de la protéine Akt dans la lignée MCF-7 (appelé clone MCF-7/Akt). Comme attendu, la croissance du clone MCF-7/Akt est partiellement indépendante de l'œstradiol et, contrairement aux cellules parentales MCF-7, il présente une réponse incomplète à l'anti-œstrogène 4-hydroxytamoxifène, démontrant sa résistance à l'hormonothérapie. Nous avons montré que l’Api a un effet anti-prolifératif sur le clone MCF-7/Akt. De plus, l’Api diminue l’expression de la protéine FOXM1, une protéine impliquée dans le cycle cellulaire, la prolifération cellulaire et la résistance endocrine. L’Api modifie également l’expression des gènes régulés par FOXM1, notamment des gènes du cycle cellulaire, en particulier dans le clone MCF-7/Akt. Ensemble, nos résultats renforcent le potentiel thérapeutique des glycéollins et de l’apigénine. Ces molécules méritent d’être étudiées davantage pour devenir des traitements contre le CS.
|
|
Sciences de la terre et de l'environnement
/ 03-12-2020
Hubert Antoine
Voir le résumé
Voir le résumé
Dans les environnements souterrains, un grand nombre de réactions bio-géo-chimiques ont une cinétique essentiellement contrôlée par des bactéries. Dans ces milieux, les flux de nutriments et les concentrations de solutés peuvent être fortement variables dans l'espace et le temps. Ces variations peuvent générer des cinétiques de réaction bio-géo-chimiques qui différent de manière significative des cas mesurés dans les modèles environnementaux homogènes. L’objectif général de ce travail est, à partir d’expériences microfluidiques et en se fondant uniquement sur des observables physiques, de quantifier les couplages entre hétérogénéité de l’écoulement, transport/mélange de solutés, réactions et activité biologique. Nos expériences associées à des modélisations numériques démontrent le couplage du transport de nutriments avec la croissance en surface des bactéries. Des observations à l’échelle des cellules bactériennes et à haut taux d’acquisition démontrent l’effet des gradients de vitesse sur les motifs de colonisation des surfaces par les bactéries dans les premières phases de développement d’une population soumise à un écoulement laminaire. Nous mettons également en évidence une dépendance des caractéristiques de l’attachement des bactéries aux surfaces vis-à-vis de la contrainte cisaillante qu’elles subissent. Cette adaptation influence leur taux de croissance. Enfin, nous développons un cadre d’étude analytique décrivant l’amélioration d’une cinétique de réaction par les processus de mélange.
|
|
Radiologie
/ 02-12-2020
Mehier Clément
Voir le résumé
Voir le résumé
Introduction : Un algorithme de traitement récent suggère que les ruptures proximales du ligament croisé antérieur (LCA) avec une bonne qualité tissulaire résiduelle peuvent faire l'objet d'une réparation primaire. Cette étude a pour objectif principal d’évaluer la capacité de l'IRM à déterminer la localisation exacte de la rupture et la qualité tissulaire du LCA résiduel, en utilisant l'arthroscopie comme référence. Matériels et méthodes : Cette étude est une analyse rétrospective multicentrique. Dans un premier échantillon de 71 patients ayant bénéficié d’une chirurgie du LCA (réparation ou reconstruction), la précision diagnostique de l'IRM a été évaluée en utilisant l'arthroscopie comme référence. Chaque rupture du LCA a été classée selon les classifications arthroscopiques de Sherman pendant l'intervention chirurgicale. Les IRM ont été relues rétrospectivement en aveugle des résultats arthroscopiques et en consensus avec deux radiologues ostéo-articulaires. La localisation des lésions et la qualité tissulaire ont été classées selon les échelles suivantes : MRI Sherman tear location (MSTL), MRI Sherman tissue quality (MSTQ) et simplified MRI Sherman tissue quality (S-MSTQ). Un second échantillon de 77 patients a été utilisé pour évaluer les reproductibilités intra et inter-observateurs. La précision diagnostique des classifications IRM a été comparée par les tests de McNemar. Les accords intra et inter-observateurs entre deux lecteurs ont été évalués à l'aide du coefficient Kappa de Cohen. Résultats : Concernant la localisation des lésions, basée sur la classification MSTL, la précision diagnostique de l’IRM était de 50/71 (70%) patients. En ce qui concerne la qualité tissulaire, la précision diagnostique était de 15/29 (52 %) selon la classification MSTQ et de 26/29 (90 %) selon la classification S-MSTQ (p = 0,003). La reproductibilité inter-observateurs était bonne pour la classification MSTL (κ= 0,78) et modérée à bonne pour les classifications MSTQ et S-MSTQ (κ= 0,44 et 0,63 respectivement). Conclusion : L'IRM est capable de classer efficacement l'emplacement des déchirures et la qualité des tissus. La classification IRM de Sherman simplifiée concernant la qualité des tissus semble plus efficace mais reste modérée à bonne en termes de reproductibilité intra et inter observateur.
|
|