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Sciences de la terre et des planètes
/ 14-12-2018
Kebi-Tsoumou Sage Paterne Chandrich
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Le propos de cette thèse est d’étudier le rift de l’Atlantique sud au Congo, en se focalisant sur (1) la dynamique des reliefs amont du rift (les épaulements de rift), (2) l’architecture stratigraphique du remplissage sédimentaire et (3) le routage sédimentaire ante- à syn-rift. L’etude de terrain a permis de reconstituer la géométrie des paléovallées, le cadre sédimentaire et stratigraphique du remplissage sédimentaire et de discuter des implications géodynamiques de ces paleovalleys en termes de dynamique du rift et de contrôle des systèmes sédimentaires. Ces paléovallées ont été incisées dans le substratum précambrien du Mayombe par des rivières alluviales pendant la phase d'étirement du rifting et remplies par des sédiments d’âge Aptien moyen de la Formation de Chéla. Le remplissage sédimentaire de ces paléovallées consiste en des faciès gravitaires sousaquatiques interdigités dans les argiles lacustres riches en matière organique, recouvrant en discordante le socle Précambrien du Mayombe. Ces depôts s'organisent en une séquence transgressive, caractérisée par l’empilement des séquences élémentaires de type finning-up . L’analyse sédimentologique de carottes a permis de caractériser les environnements de dépôts des Formations de Pointe-Noire, Pointe-indienne et de Chéla, correspondant à la phase d’hyperextension (sag) de l’evolution du rift. La Formation de Pointe-Noire d’âge Barrémien moyen est constituée des faciès gravitaires de cônes sous-lacustres profonds à dominance argileux et riches en matière organique dans lesquels s’intercalent localement des faciès carbonatés de plate-forme peu profonde et gravitaires resédimentés du membre de Toca, accumulés au cours d'une importante transgression associée à un évènement anoxique général. La Formation de Pointe-indienne d’âge Barrémien supérieur à Aptien inferieur est caracterisée par variations latérales et verticales de faciès. Elle comprend des faciès gravitaires gréso-argileux (membre Mengo) de cônes sous-lacustres profonds, surmontés par des faciès mixtes silicoclastiques et carbonatés de rampe interne à moyenne dominée par des vagues de tempêtes (Membre des Argiles vertes) passant progressivement vers le haut à des faciès deltaïques de Tchibota. La formation de Chéla d’âge Aptien moyen se caractérise par des variations latérales et verticales de faciès. Elle comprend des faciès sous-aquatiques de delta alluvionnaire passant latéralement aux faciès gravitaires sous-lacustres, suivi par des faciès de baies mixtes lacustres -marine, surmontés par des faciès de sabkha (membre Vembo) recourvets par les evaorites de Loémé. Les facies de sebkha au sommet de la Formation de Chéla témoignent d’une incursion marine avant la mise en place des évaporites. Les corrélations stratigraphiques entre puits ont permis de subdiviser la succession sédimentaire de la phase d’hyper-extension (sag) en trois principales séquences de dépôt montrant respectivement des tendances rétrogradante, progradante et rétrogradante. La datation des zircons et apatites détritiques a permis de reconstituer le routage sédimentaire ante- à syn-rift et l’évolution de reliefs en amant du rift. Les résultats montrent des changements spatio-temporels de sources de sediments et deux régions de provenance de sédiments. Les sédiments ante-rift (Formation de Vandji) d’age Berriasien proviennent des sources lointaines, confirmant l’existence d’un système pre-rift – et donc d’un bassin antérieur au système rift du segment central de l’Atlantique sud, alimenté de l’ouest à sud-ouest par des sources angolaise et brésilienne. Les sédiments syn-rift (Formation de Djéno) d’age Barremien inférieur et Sag (Formation de chéla) d’age Aptien moyen proviennent des sources locales (massif du Mayombe), ce qui implique un changement majeur de sources et de reliefs entre les phases pre-rift et syn-rift et l’existance des reliefs en amont de la faille bordière pendant les phases d’étirement et d’hyper-extension du rift.
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Droit privé et sciences criminelles
/ 14-12-2018
Dinh Mai-Lan
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Considéré, à juste titre, comme l’une des constructions prétoriennes les plus célèbres du droit privé, l’enrichissement injustifié vient de faire son entrée dans le Code civil. Mais, derrière l’énoncé rassurant de conditions désormais classiques, que l’ordonnance du 10 février 2016 s’est pour l’essentiel contentée de reprendre (enrichissement et appauvrissement corrélatif, absence de justification, subsidiarité, etc.), de nombreuses incertitudes demeurent. L’analyse du contentieux relatif à l’enrichissement injustifié révèle en effet que ces conditions font l’objet d’applications divergentes, qui amènent les magistrats à adopter des solutions diamétralement opposées en présence de faits similaires. Le premier objectif de cette étude est de dépasser ces incertitudes, en fournissant, au-delà du simple énoncé des règles, des guides sûrs pour leur application. Mais aux doutes du passé, que la réforme s’est contentée de reconduire, s’ajoutent de nouvelles interrogations, nées des règles nouvelles adoptées par l’ordonnance (revalorisation de l’indemnité, prise en compte de la mauvaise foi de l’enrichi, de la faute de l’appauvri, etc.). Cette étude a également pour ambition de favoriser leur acclimatation, en identifiant leurs principales difficultés d’application, et en envisageant les pistes pour les surmonter. En prenant appui sur les enseignements du contentieux, et plus spécifiquement du contentieux au fond, ce sont tour à tour les conditions (Première partie) et la sanction (Seconde partie) de l’enrichissement injustifié que la thèse se propose de revisiter.
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Chirurgie dentaire
/ 14-12-2018
Jehanin Thomas
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La présence de taches blanches au niveau des surfaces lisses dentaires peut occasionner chez certains patients une gêne esthétique importante. Autrefois traitées par des techniques invasives de fraisage et/ou par facettes, ces taches peuvent désormais être masquées par effet optique grâce à la technique d’érosion/infiltration résineuse. Ce travail de thèse a pour objectif de proposer une iconographie de plusieurs cas cliniques traités au centre de soins dentaires de Rennes. Les quatre patients sélectionnés pour cette étude ont pu être traités par cette technique non invasive. Bien que les patients furent ravis du résultat esthétique immédiat obtenu, un recul clinique de plusieurs années serait intéressant afin d’obtenir une base scientifique solide sur l’évolution esthétique et mécanique de cette thérapeutique avec le temps.
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Chirurgie dentaire
/ 14-12-2018
Bourges Paul
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La présence de taches blanches au niveau des surfaces lisses dentaires peut occasionner chez certains patients une gêne esthétique importante. Autrefois traitées par des techniques invasives de fraisage et/ou par facettes, ces taches peuvent désormais être masquées par effet optique grâce à la technique d’érosion/infiltration résineuse. Ce travail de thèse a pour objectif de proposer une iconographie de plusieurs cas cliniques traités au centre de soins dentaires de Rennes. Les quatre patients sélectionnés pour cette étude ont pu être traités par cette technique non invasive. Bien que les patients furent ravis du résultat esthétique immédiat obtenu, un recul clinique de plusieurs années serait intéressant afin d’obtenir une base scientifique solide sur l’évolution esthétique et mécanique de cette thérapeutique avec le temps.
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Immunologie
/ 14-12-2018
Pignarre Amandine
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La génération de plasmocytes (PC) à longue durée de vie sécrétant des anticorps hautement affins spécifiques de l’antigène, caractéristique de la réponse immune adaptative, est l’étape ultime de la différenciation des lymphocytes B au sein des centres germinatifs des organes lymphoïdes secondaires. La transition d’un lymphocyte B naïf vers un PC est associée au passage d’un programme transciptionnel des gènes de l’identité B vers l’expression des gènes de l’indentité plasmocytaire. Ce travail de thèse s’est concentré sur la caractérisation de cette étape terminale de la différenciation lymphocytaire B humaine tant au niveau transcriptomique qu’épigénétique. A l’aide d’un modèle de différenciation in vitro à partir de lymphocytes B naïfs humains, nous avons identifié les cellules engagées dans ce processus. Ces précurseurs des plasmablates sont notamment caractérisés par une répression de la voie de signalisation de l’IL-4 aboutissant à la perte du marqueur CD23, le récepteur de faible affinité à l’IgE mais aussi à l’apposition de 5hmC, l’hydroxyméthylcytosine, au niveau des gènes de l’identité PC. L’étude de cette marque épigénétique dans un contexte pathologique, le myélome multiple, a fait l’objet du second axe de recherche de notre projet et a révélé le rôle du gène FAM72D dans la prolifération cellulaire.
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Neurosciences, éthologie
/ 14-12-2018
Batail Jean-Marie
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Le but de ce travail est d’étudier deux dimensions sémiologiques, identifiées dans la littérature comme associées au trouble dépressif résistant, l’anxiété et l’apathie. Ces marqueurs cliniques et leurs corrélats radiologiques seront ensuite testés dans une analyse longitudinale du pronostic à 6 mois d’une cohorte de patients souffrant de dépression. Les données originales de ce travail sont issues de la cohorte LONGIDEP. Cette étude prospective, naturalistique, a été menée chez des patients souffrant d’un épisode dépressif majeur qui bénéficiaient, dans le cadre des soins courants, d’une évaluation clinique, neuropsychologique et d’une imagerie cérébrale à l’inclusion. Une nouvelle évaluation a été proposée à 6 mois de l’inclusion. Cette étude nous a permis de montrer que 1) l’apathie dans la dépression est associée à un profil clinique et physiopathologique spécifique, 2) l’analyse catégorielle et sémiologique de l’anxiété dans une population de sujet déprimés résistants n’étaient pas concordantes. Les déprimés résistants présentaient une hyperperfusion amygdale centro-médiane, 3) l’anxiété trait, un pattern cognitif associé à la mémoire visuo-spatiale étaient prédictifs d’une évolution péjorative de la dépression. Des anomalies structurales de régions impliquées dans la régulation émotionnelle et plus précisément l’adaptation au danger/peur, étaient associées à une évolution péjorative de la dépression. Des deux dimensions sémiologiques étudiées, l’anxiété apparaît être impliquées dans le pronostic de la dépression. L’étude des liens entre l’anxiété et les troubles de la motivation est une perspective de recherche pour la dépression résistante.
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Pharmacie
/ 14-12-2018
Foulquier Jean-Baptiste
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Objectifs : L'ofloxacine est un des antibiotiques recommandés dans le traitement des infections ostéo-articulaires (IOA). L’efficacité des fluoroquinolones est évaluée par le rapport AUC0-24h/CMI. Une estimation précise de l’exposition pourrait être avantageuse pour le suivi thérapeutique pharmacologique (STP) de l'ofloxacine. Le but de ce travail est de décrire la pharmacocinétique de l'ofloxacine administré par voie orale puis, à partir du modèle obtenu, d'établir un schéma de prélèvement limité (LSS) permettant d’estimer l'AUC0-τ compatible avec une demi-journée d’hospitalisation ainsi que de proposer une optimisation a priori du schéma posologique chez les patients atteints d’IOA. Méthodes : La pharmacocinétique de l'ofloxacine a été décrite par modélisation compartimentale par approche de population. Les méthodes par D-optimalité, bayésienne et par régression linéaire multiple ont été utilisées pour déterminer le LSS entre 0 et 4h. Pour l'optimisation de la posologie, des simulations de Monte-Carlo ont permis de calculer les probabilités d’atteinte de la cible (PTA) de 10 posologies différentes en utilisant les cibles d' AUC0-24h/CMI de 115 h, 230 h et 393 h. Résultats : Trente patients atteints d'IOA ont été inclus dans l'étude Fluo-Pop (NCT02357407). La pharmacocinétique de l'ofloxacine a été décrite par un modèle bicompartimental associé à une élimination d'ordre 1 et un modèle de transit pour l'absorption. La pharmacocinétique de l'ofloxacine présentait une grande variabilité interindividuelle. Le CKD-EPI et le sexe avaient une influence significative sur la clairance totale apparente. Les résultats des trois méthodes pour déterminer le LSS étaient similaires. Le schéma le plus performant pour prédire l'AUC0-τ se limitait aux temps 0, 1h et 3h (R² ajusté = 95,5%). Les résultats d'optimisation ont mis en avant la difficulté d'atteinte de la cible d' AUC0-24h/CMI au site infectieux. Conclusion : Cette étude constitue la première description de la pharmacocinétique de l'ofloxacine chez des patients atteints d'IOA. Le LSS déterminé par approche bayésienne permettrait de réaliser dans la pratique, un suivi thérapeutique pharmacologique de l'ofloxacine basé sur l'AUC0-24h chez les patients atteints d’IOA
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Informatique
/ 14-12-2018
Cabon Gurvan
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La quantité croissante de données traitées par les logiciels rend légitime le besoin de garanties de confidentialité. La propriété de non-interférence assure qu'un programme ne fuite pas de données privées vers une sortie publique. Nous proposons une méthode pour construire, une multisémantique annotée capable de capturer la propriété de non-interférence pour aider à prouver formellement des analyseurs. Nous fournissons un théorème prouvé indiquant que les annotations capturent correctement la non-interférence. Le théorème de correction permet de prouver un analyseur sans s'appuyer sur la définition de non-interférence mais sur les annotations.
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Biologie moléculaire et structurale, biochimie
/ 14-12-2018
Damodaran Arun Prasath
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Aurora-A est une sérine/thréonine kinase connue pour réguler les événements mitotiques dans les cellules. Sa surexpression dans les tumeurs favorise la survie cellulaire en modulant la prolifération cellulaire et en inhibant l’apoptose. Auparavant, il avait été montré qu'Aurora-A était important pour la stabilité d'une protéine riche en sérine / arginine (SR), ASF/SF2, modifiant ainsi l'épissage alternatif des gènes liés à l'apoptose. En cohérence avec ce rôle dans l'épissage, nous avons découvert que l'interactome d'Aurora-A contient un grand nombre de composants du spliceosome - des protéines spliceosomales centrales et non essentielles. Mon travail de thèse a consisté à caractériser la fonction de Aurora-A dans l'épissage pré-ARNm et à étudier sa fonction au niveau moléculaire. J’ai montré qu'Aurora-A interagissait directement avec des facteurs d'épissage, tels que les protéines SR et les protéines hnRNP, et phosphorylait également quelques-unes d'entre elles in vitro. J’ai démontré qu'Aurora-A est important pour la stabilité de ASF/SF2 et de nombreuses autres protéines SR. En utilisant la microscopie à immunofluorescence, j’ai démontré en outre qu'Aurora-A localise vers les taches nucléaires, les sites où les protéines d'épissage sont stockées, ainsi qu'à la périphérie des taches nucléaires où une majorité d'épissage de pré-ARNm est connue. L'ajout d'Aurora-A recombinant améliore notamment l'efficacité d'épissage du pré-ARNm de la bêta-globine in vitro. En analysant la méthode RNA-seq à l'aide de l'outil VAST, j'ai identifié 414 événements d'épissage alternatifs qui sont modifiés lors de l'inhibition de Aurora-A. De manière surprenante, les protéines kinases SR importantes, CLK1 et CLK4, sont également identifiées comme étant épissées de manière alternative d'une manière dépendante de Aurora-A. Dans l’ensemble, mes travaux révèlent le rôle important et novateur d’Aurora-A dans l’épissage des ARNm et suggèrent des voies moléculaires permettant à Aurora-A de moduler les facteurs d’épissage et d’épissage.
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Chirurgie dentaire
/ 13-12-2018
Simon Tiffany
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La greffe de cellules souches hématopoïétiques est de plus en plus répandue pour traiter certains cancers hématologiques chez l’enfant. L’une des conséquences de ce traitement est l’apparition de la maladie du greffon contre l’hôte (GVHD). Elle a incidence variable qui peut aller jusqu’à 66 % chez l’enfant. Une mortalité liée à cette pathologie et une diminution de la qualité de vie est alors observée chez ces patients. La GVHD peut être caractérisée par des répercussions buccales qui participent à la morbidité de la maladie. Un grand nombre de symptômes peut apparaître et notamment au niveau de la cavité orale. Les chirurgiens-dentistes ont un rôle clé à jouer dans son diagnostic et dans la prise en charge de ces jeunes patients pour améliorer leur qualité de vie. Cette étude a pour but d’expliquer les mécanismes biologiques des répercussions buccales de la GVHD,d’énoncer les facteurs de risque associés à la GVHD, de répertorier les répercussions buccales de la maladie du greffon contre l’hôte, leur diagnostic et leur traitement.
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