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Microbiologie, virologie, parasitologie
/ 20-12-2018
Frouard Julie
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Le sperme est le principal vecteur de dissémination du VIH. La muqueuse colorectale exposée au sperme infecté lors de rapports anaux, aussi bien chez l’homme que chez la femme, représente le plus fort risque d’infection parmi toutes les voies de transmission sexuelle. Un nombre croissant d’études suggèrent que la transmission sexuelle du VIH via les cellules infectées présentes dans les sécrétions génitales du donneur serait plus efficace que par les particules virales libres. A ce jour, le rôle et les mécanismes de transmission des cellules infectées du sperme ont été peu étudiés. De plus, l’effet potentiel du liquide séminal (LS) sur cette transmission est mal connu. Dans ce contexte, mes travaux de thèse ont permis de démontrer une transmigration active et rapide: (i) de leucocytes sanguins à travers la barrière colorectale, et un effet inhibiteur du LS sur ce
phénomène, sans altération de la barrière épithéliale. (ii) de leucocytes séminaux. Des analyses par cytométrie de flux ont permis de mettre évidence à la fois des particularités et des similitudes quant à l’équipement protéique des cellules séminales et de leurs équivalents sanguins. Ce travail fournit de nouvelles données sur la transmission du VIH par les cellules infectées du sperme, et sur l’effet du sperme sur la transmission colorectale. La démonstration de la transmigration de leucocytes séminaux suggère que ces cellules jouent un rôle dans la transmission du VIH au niveau colorectale qui nécessite d’être pris en compte dans les stratégies de prévention. Les mécanismes en jeu et ceux responsables de l’effet du LS restent à élucider et devrait permettre à terme de dégager de nouvelles cibles thérapeutiques.
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Mathématiques et leurs interactions
/ 20-12-2018
Keraval Pierig
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La thèse consiste en l’étude spectrale d’opérateurs partiellement semi-classiques. Quand la géométrie du problème suggère une localisation anisotrope des fonctions propres associées aux basses énergies (bord du domaine, lieu d’annulation du champs magnétique), le développement local de l’opérateur amène naturellement à une structure à double échelle. Il s'agit, via un schéma de réduction "à la Born-Oppenheimer", utilisant le formalisme du calcul pseudodifférentiel pour des symboles à valeur opérateur, de montrer l’existence d’un opérateur effectif à symbole scalaire. On en déduit ensuite des formules de Weyl pour le comptage des basses valeurs propres. Cette stratégie est appliquée : au Laplacien de Robin sur un domaine borné, en dimension quelconque et au Laplacien magnétique dans R², dans le cas où le champ magnétique s’annule sur une courbe fermée.
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Sciences de la terre et de l’environnement
/ 20-12-2018
Guillaumot Luca
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Les systèmes aquifères constituent la partie souterraine du cycle hydrologique. Ils transfèrent les pluies infiltrées à travers les sols sur des distances variables. Après un temps caractéristique de l’ordre du mois au millier d’années, les eaux souterraines regagnent la surface en alimentant les rivières et en satisfaisant en partie l’évapotranspiration. Les aquifères sont ainsi une ressource en eau majeure pour l’Homme et les écosystèmes. La prédiction de leur réponse aux pressions anthropiques et climatiques se heurte à deux difficultés (1) la faible densité d’informations directes sur les milieux géologiques et leur grande hétérogénéité (2) la complexité des échanges entre la surface et la profondeur. L’enjeu est donc de développer des modèles représentant au mieux les processus aux différentes échelles spatiotemporelles. Pour aborder cette question, nous étudions le contenu informatif de différents types d’observables (piézométrie, débit de rivière, déformation de surface...) afin de déterminer comment ils peuvent améliorer la paramétrisation des modèles. Notre travail s’appuie sur la modélisation hydrologique du site de Ploemeur (échelle locale) et du bassin du Rhin (échelle continentale). Dans les deux cas, des modèles simples sont développés en utilisant des solutions analytiques et numériques. Le modèle ModFlow a également été couplé à un modèle hydrologique. À petite échelle, les résultats illustrent l’intérêt de différents types de données transitoires pour contraindre les processus. À grande échelle, le modèle développé ainsi que les observables permettent d’affiner le rôle des systèmes aquifères dans la disponibilité de l’eau en surface. Les deux approches illustrent un contrôle des flux à différentes échelles par la topographie, la géologie et l’hétérogénéité.
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Signal, image, vision
/ 20-12-2018
Georgi Nawras
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Grâce au progrès de la médecine et à l’essor des technologies, l’espérance de vie ne cesse de progresser, cette augmentation s’accompagnant d’une apparition de besoins spécifiques pour les seniors. Sachant que huit français sur dix souhaitent continuer à vivre à domicile en cas de perte d’autonomie, équiper les seniors d’une solution de suivi de leur état de santé à distance pourrait le leur permettre et ce dans de bonnes conditions. Dans ce contexte, nous avons identifié trois verrous que nous avons cherché à lever au cours de cette thèse. Le premier concerne l’interopérabilité des capteurs de santé qui se trouve mise à mal par l’adoption massive des protocoles propriétaires par les fabricants. Pour y remédier, nous proposons une passerelle facilitant la communication avec les capteurs de santé, qu’ils soient médicaux ou de bien-être, en faisant abstraction des multitudes de protocoles de communication propriétaires et standards. Le deuxième obstacle concerne l’erreur de mesure due à la manipulation d’un capteur de santé par des personnes non initiées en absence d’un professionnel de santé. Nous illustrons cette problématique à travers l'exemple d'un tensiomètre de poignet pour lequel nous proposons une méthode permettant de guider l’utilisateur dans son bon positionnement en respectant les recommandations des fabricants grâce à l'apport d'une montre connectée. Le dernier challenge a trait à la question de la multimodalité et plus précisément à la contextualisation de la mesure. Il s'agit ici de la fusion de données provenant d’un ensemble d’objets connectés dans un système de télésuivi décliné sous l'angle de la prise de la tension artérielle dans l'objectif de placer l’usager en situation d'effectuer une mesure de tension conforme aux recommandations des sociétés savantes. L'expérimentation qui a été conduite a permis d’évaluer l’acceptabilité du système proposé.
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Sciences des matériaux
/ 20-12-2018
Wu Yiming
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La thèse est divisée en trois chapitres distincts. Le premier chapitre, introductif, présente les propriétés générales des verres et fibres en verres de chalcogénures ainsi que leurs intérêts, notamment dans le développement de sources supercontinuum générant des longueurs d’onde de 2 à 12 μm (source large bande issue de phénomènes optiques non linéaires). Ce domaine de longueur d’onde est très apprécié dans le domaine de la spectroscopie, car c’est dans ce domaine que l’on retrouve la majorité des signatures infrarouges des toutes les substances chimiques et biologiques. Le deuxième chapitre exploite, la photosensibilité des verres de chalcogénures pour la réalisation de guides d’onde photo-inscrits.Dans ce chapitre, 3 différentes compositions ont été étudiées mais ont présenté un comportement différent voire contradictoire. Le dernier chapitre explore la réalisation de fibres optiques nouvelles à base de verre de chalcogénures. Les premières fibres étudiées sont les fibres réalisées avec des compositions à base de tellure, afin d’augmenter la fenêtre de transmission des fibres vers les grandes longueurs d’onde. La deuxième partie du chapitre présente une méthode originale qui pourrait permettre de réaliser des fibres en verres de chalcogénures à gradient d’indice. Puis la dernière partie est consacrée au développement de fibres hybrides en verres de silice et verres de chalcogénures.
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Santé publique
/ 19-12-2018
Charuaud Lise
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La Directive Cadre sur l’Eau (2000) fait état de la dégradation du bon état chimique des eaux superficielles et des eaux souterraines. Parmi les polluants émergents mis en cause figurent les résidus de médicaments qui représentent une menace diffuse et potentiellement persistante dans les hydro-systèmes. A ce jour, peu d’études se sont intéressées spécifiquement aux résidus médicamenteux vétérinaires (RMV). En France, la Bretagne est une région d'élevage intensif. 75% des eaux destinées à la consommation humaine (EDCH) sont issues d’eau de surface particulièrement vulnérables. Dans ce contexte, les objectifs de cette thèse sont de (i) sélectionner les sites à risque et les RMV d’intérêt, (ii) développer une méthode d’analyse pour la liste de composés retenus, (iii) acquérir des premières données d’occurrence par les RMV dans les EDCH en Bretagne et (iv) identifier les sources des RMV à l’aide de l’étude de la contamination fécale associée dans les eaux brutes. Cette thèse est constituée de trois chapitres : une synthèse bibliographique des connaissances relatives aux RMV dans les eaux brutes et les eaux traitées, ainsi qu’une synthèse sur les outils existant pour étudier la contamination fécale ; les matériels et méthodes incluant la stratégie d’échantillonnage, le choix des RMV d’intérêt et les méthodes d’analyse développées sur cette base; les données d’occurrence des RMV dans les EDCH bretonnes. Ces travaux se concluent sur un contexte plus large avec des perspectives pour mieux comprendre les facteurs impactant ces occurrences et pour évaluer l’exposition de la population.
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Pharmacie
/ 19-12-2018
Le Pichon Margaux
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L’hypercholestérolémie familiale résulte d’une mutation génétique pathogène transmise de génération en génération. Elle engendre une élévation excessive du taux de LDL-C sanguin responsable de maladies cardiovasculaires athéromateuses graves et prématurées. Dans la plupart des pays, la maladie est sous-diagnostiquée et sous-traitée. Un diagnostic précoce ainsi que le traitement des patients et de leurs familles pourraient significativement réduire la morbidité et la mortalité associées à l'HF. Malgré l’efficacité des traitements actuels, de très nombreux patients ne les tolèrent pas ou n’atteignent pas les taux cibles de LDL-C. La découverte de la proprotéine subtilisine/kexine-9 (PCSK9) en 2003 et de son rôle clef dans le métabolisme du cholestérol ouvre la voie à de nouvelles perspectives de traitement efficace contre l’hypercholestérolémie. Les anticorps monoclonaux sont les premiers inhibiteurs de PCSK9 à obtenir une autorisation de mise sur le marché démontrant une baisse significative des taux de LDL-C et un bénéfice sur le plan cardiovasculaire. D’autres médicaments sont en cours de développement.
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Neurosciences, éthologie
/ 19-12-2018
Gautier Yentl
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L’exposition au régime occidental (Western diet, WD) pendant les périodes critiques du développement est considérée comme un facteur majeur dans l’apparition de l’obésité, notamment morbide, dont le traitement de référence lorsque toutes les autres stratégies (e.g. régime) ont échoué reste la chirurgie bariatrique. Mais la lourdeur de la procédure, associée à certains risques et échecs, justifie le développement de thérapies alternatives. Pour cela, il est essentiel de bien connaître les phénotypes neurocognitifs régulant le comportement alimentaire. L’objectif de cette thèse était d’étudier la dynamique neuro-comportementale hédonique et cognitive d’individus jeunes adultes ayant été exposés au WD soit pendant la période périnatale (projet SLK), soit à l’adolescence (projet HOS), à la fois sur le miniporc (SLK+HOS) et chez l’Homme (HOS). Pour le projet HOS, les tests ont été menés sur des individus normopondéraux (humain et porc), obèses (porc), puis après une perte de poids induite par une restriction calorique associée ou non à un bypass gastrique (porc). Nous avons utilisé des approches psycho-comportementales (tests, questionnaires) et de l’imagerie cérébrale (TEP, SPECT, IRMf). Chez le miniporc, l’exposition périnatale au WD confère un phénotype cérébral « obèse » et augmente la susceptibilité des descendants au stress, tandis que l’exposition à l’adolescence induit un phénotype cérébral évoquant les troubles addictifs tout en altérant la mémoire de travail. L’étude pilote humaine a permis d’identifier les aires cérébrales recrutées en situation de choix alimentaire posant un dilemme, en particulier le cortex cingulaire et le fusiforme-occipital. L’obésité provoque des attitudes anxio-dépressives associées au grignotage. La perte de poids rétablit un comportement normal et montre une régulation attentionnelle cérébrale en réponse au sucre. Une modulation neuronale par les hormones digestives et/ou le microbiote est fortement soupçonnée. Les analyses physiologiques, histologiques et métabolomiques programmées en perspective de ce travail de thèse devraient apporter des réponses précieuses pour comprendre comment l’axe microbiote-intestin-cerveau est impliqué dans ces modulations neurocognitives induites par le régime et les variations de poids.
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Écologie et évolution
/ 19-12-2018
Cavé-Radet Armand
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Cette étude vise à explorer les mécanismes de tolérance des plantes aux xénobiotiques organiques de la famille des HAPs (phénanthrène), à travers l’analyse de l’impact des évènements de spéciation par hybridation et duplication génomique (allopolyploïdie). Nous avons pour cela mené une approche comparative sur un modèle de spéciation allopolyploïde récente, constitué des espèces parentales hexaploïdes S. alterniflora et S. maritima, et de l’allopolyploïde S. anglica qui résulte de la duplication du génome de leur hybride F1 S. x townsendii. Une approche intégrative basée sur des analyses physiologiques et moléculaires nous a permis de montrer que chez Spartina l’hybridation et le doublement du génome augmentent la tolérance aux xénobiotiques. Le parent paternel S. maritima se montre particulièrement sensible au phénanthrène par rapport au parent maternel S. alterniflora. Différentes analyses transcriptomiques ont permis l’identification de novo de transcrits spécifiquement exprimés en condition de stress, et l’annotation des petits ARNs (miARNs, leurs gènes cibles, et siARNs) agissant en tant que régulateurs de l’expression des gènes et la régulation des éléments transposables. Les analyses d’expression différentielle en réponse au stress ont permis de générer un modèle de régulation (miARN/gènes cibles) en réponse aux HAPs, testé par validation fonctionnelle en système hétérologue chez Arabidopsis. Un travail exploratoire de profilage du microbiome de la rhizosphère des spartines exposées au phénanthrène a été réalisé pour préciser les mécanismes de dégradation des xénobiotiques dans l’environnement en vue d’une application dans les stratégies de remédiation verte.
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Chirurgie dentaire
/ 19-12-2018
Schlumberger Michael
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La Prothèse Amovible Complète garde une place importante dans l'arsenal thérapeutique du chirurgien-dentiste. Dans cette optique, des fiches pédagogiques portant sur la réalisation des empreintes primaires, des porte-empreintes individuels et des empreintes secondaires avaient été réalisées en 2013. Il a été décidé de poursuivre ce projet avec la réalisation de trois nouvelles fiches pédagogiques portant sur la confection de la base d'occlusion maxillaire, la confection de la base d'occlusion mandibulaire et sur le montage conventionnel esthétique et fonctionnel des dents maxillaires sur cire. L'ensemble de ces fiches sont consultables par les étudiants via l'espace numérique de travail (ENT). Elles constituent ainsi pour les étudiants de quatrième année un support dans l'apprentissage de cette discipline lors des séances de Travaux Pratiques.
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