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Biologie
/ 15-12-2016
Leclair Mélanie
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Les associations symbiotiques entre microorganismes et eucaryotes sont omniprésentes dans le monde vivant. Ces microorganismes peuvent jouer un rôle crucial dans l’évolution et l’écologie de leurs porteurs en modifiant leur phénotype. Ces symbiotes étant le plus souvent héritables, les phénotypes étendus résultant de ces associations symbiotiques peuvent se transmettre aux générations suivantes. Certains microorganismes vont permettre l’accès à une ressource alimentaire, d’autres conférer une protection contre un ennemi. Une telle protection symbiotique est rencontrée chez le puceron du pois (Acyrthosiphon pisum) en interaction avec la bactérie Hamiltonella defensa. Cette symbiose confère au puceron une résistance face à l’attaque de son principal ennemi : le parasitoïde Aphidius ervi. Les populations de ce ravageur des Légumineuses sont structurées en biotypes (populations spécialisées sur des plantes hôtes). La distribution du symbiote protecteur au sein des populations de pucerons est singulière. De nombreux individus vivant sur la luzerne, la bugrane ou les genêts abritent ce symbiote alors qu’il est peu fréquent dans les populations d’autres biotypes d’A. pisum comme le pois ou le trèfle. Nous avons cherché à comprendre pourquoi H. defensa n’était pas retrouvé chez tous les biotypes du puceron du pois. Afin de prédire la dynamique de la symbiose protectrice et le potentiel de résistance dans les populations aphidiennes naturelles, nous nous sommes intéressés à plusieurs processus écologiques et évolutifs. L’incidence de la pression des parasitoïdes sur la composition des populations symbiotiques a été mesurée chez trois biotypes (luzerne, pois et trèfle) à travers une approche terrain. La distribution du symbiote H. defensa dans les populations est directement dépendante de la variabilité du phénotype associé exprimé dans les différentes populations, j’ai identifié les phénotypes associés au symbiote pour des pucerons issus de différents biotypes ainsi que l’influence du contexte local sur ces phénotypes. L’absence d’H. defensa chez certains individus peut s’expliquer par la redondance d’une fonction protectrice en place chez ces biotypes comme un alternative symbiotique autre que H. defensa ou encore une immunité forte. Enfin, nous avons testé si le cumule des protections symbiotiques conférées par deux bactéries du cortège du puceron du pois pouvaient se cumuler créant ainsi des super-organismes. Mon travail met en évidence l’implication de nombreux facteurs dans la prédiction des fréquences symbiotiques d’une bactérie facultative dans les populations d’hôte.
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MEDECINE GENERALE
/ 15-12-2016
Le Pimpec Fanny
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But : La participation au dépistage organisé du cancer colorectal est très insuffisante en France. Le remplacement depuis avril 2015 du test Hemoccult™ par le test immunologique OC-Sensor™ laisse espérer une meilleure participation de la population ciblée par ce dépistage. L’objectif de cette étude a été d’identifier et d’analyser chez des sujets n’ayant jamais participé au dépistage avant 2015 dans le département d’Ille et Vilaine, les motifs de leur participation au dépistage avec le nouveau test. Patients & Méthodes: Parmi des sujets n’ayant jamais réalisé le test Hemoccult™, alors qu’ils y avaient été invités à au moins 2 campagnes successives, nous avons identifié 551 personnes ayant réalisé le test immunologique rapidement après un premier courrier d’invitation. De ce groupe, nous avons tiré au sort 300 personnes après ajustement sur le sexe, l’âge et le lieu d’habitation, parmi lesquelles 170 ont accepté de répondre à un questionnaire visant à analyser les raisons de leur soudaine participation, mais aussi leurs caractéristiques sociodémographiques et les freins à la participation avec le test Hémoccult™. Résultats : Parmi les raisons déclarées de leur nouvelle participation, un des motifs principaux était le fait d’avoir trouvé son médecin traitant plus convainquant (31%), en particulier en milieu rural (p<0,05), la simplicité du nouveau test (30%), le prélèvement de selles unique (29%), le fait d’être plus concerné en raison de l’âge (21%). Seul un tiers de la population d’étude déclarait avoir été informée que le test de dépistage était plus performant que le précédent, et parmi ces personnes, 71% déclaraient que cela avait motivé leur décision. Les principales raisons de non-participation avant 2015 étaient la réalisation du test sur 3 selles successives (28%), en particulier chez les femmes (p<0,05), le fait d’avoir estimé la réalisation du test trop compliquée (24%) et la négligence (19%). Par comparaison avec la population INSEE des sujets âgés de 55 à 75 ans, la population des nouveaux participants était constituée d’une majorité d’hommes (54,1% vs. 47,6%, p<0,01) et de plus de ruraux (45,9% vs. 28,3%, p<0,001).Le temps passé par le médecin traitant à parler du dépistage et la qualité des explications reçues étaient corrélés au fait de trouver le médecin plus convainquant et de faire le test (p<0,05). Conclusions : La simplification du test et l’intervention du médecin traitant sont les principales raisons de participation au dépistage du cancer colorectal avec le test immunologique de personnes jusque-là non répondeuses. Ces éléments, ainsi que la plus grande fiabilité du test, sont à prendre en compte dans la communication faite autour du dépistage du cancer colorectal afin d’augmenter la participation.
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Informatique
/ 15-12-2016
Sridharan Aswinkumar
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Dans cette thèse, nous nous sommes concentrés sur l'interférence aux ressources de la hiérarchie de la mémoire partagée : cache de dernier niveau et accès à la mémoire hors-puce dans le contexte des systèmes multicœurs à grande échelle. À cette fin, le premier travail a porté sur les caches de dernier niveau partagées, où le nombre d'applications partageant le cache pourrait dépasser l'associativité du cache. Pour gérer les caches dans de telles situations, notre solution évalue l'empreinte du cache des applications pour déterminer approximativement à quel point elles pourraient utiliser le cache. L'estimation quantitative de l'utilitaire de cache permet explicitement de faire respecter différentes priorités entre les applications. La seconde partie apporte une prédétection dans la gestion de la mémoire cache. En particulier, nous observons les blocs cache pré-sélectionnés pour présenter un bon comportement de réutilisation dans le contexte de caches plus grands. Notre troisième travail est axé sur l'interférence entre les demandes à la demande et les demandes de prélecture à l'accès partagé à la mémoire morte. Ce travail est basé sur deux observations fondamentales de la fraction des requêtes de prélecture générées et de sa corrélation avec l'utilité de prélecture et l'interférence causée par le prélecteur. Au total, deux observations conduisent à contrôler le flux de requêtes de prélecture entre les mémoires LLC et off-chip.
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Biologie et sciences de la santé
/ 14-12-2016
Lévêque Manuella
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Les macrophages sont en première ligne de la défense innée et jouent un rôle important dans l’initiation de la réponse immunitaire puisque régulant l’inflammation et permettant la clairance des pathogènes. Dans la mucoviscidose, ces phénomènes sont exacerbés et deviennent chronique sans pouvoir être résolus. Les objectifs de cette thèse ont été de déterminer des cibles potentielles responsables des altérations du macrophage dans la mucoviscidose. Dans le contexte inflammatoire, la forme soluble du CD14 (sCD14), dont la sécrétion est augmentée par les macrophages de patients atteints de la mucoviscidose, est caractérisé comme un DAMP puisqu’il contribue à l’entretien de l’inflammation au niveau tissulaire. Dans le contexte infectieux, l’activité de TRPV2, impliqué dans la phagocytose, est altérée. Dans la mucoviscidose, l’inflammation et l’infection sont aussi intimement liées par l’intermédiaire d’une altération des microstructures de la membrane plasmique impliquée dans la production du sCD14 et dans le processus de phagocytose. En conclusion, les modifications des fonctions du macrophage affaiblissent la défense innée des patients atteints de mucoviscidose et peuvent être impliqués dans la progression de la maladie. Par conséquent, les interventions visant à réduire l’inflammation et l’infection pourraient être bénéfiques afin de préserver la fonction pulmonaire des patients. Ainsi, les approches thérapeutiques visant à corriger les dysfonctions du macrophage de patients atteints de mucoviscidose pourrait fournir une meilleure résolution de l'infection et l'inflammation.
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Biologie et sciences de la santé
/ 14-12-2016
Warembourg Charline
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Depuis plusieurs décennies, le rôle des expositions environnementales dans l’apparition des anomalies de la reproduction suscite l’intérêt de la communauté scientifique. La période prénatale est une phase critique du développement et l’exposition à des substances chimiques au cours de la grossesse pourrait avoir des conséquences sur la santé de l’enfant et de l’adulte. De nombreuses études chez l’animal ont mis en évidence que diverses molécules chimiques étaient toxiques pour la reproduction et le développement et que certaines d’entre elles étaient capables d’interférer avec le système endocrinien. Chez l’Homme, les effets de l’exposition prénatale à des substances susceptibles d’altérer l’équilibre hormonal du fœtus restent mal documentés. L’objectif de ce travail de thèse est d’étudier l’effet de l’exposition prénatale à certains polluants chimiques en s’intéressant à deux indicateurs d’anomalie du développement du système reproducteur à la naissance : les niveaux d’hormones sexuelles et les malformations congénitales de l’appareil génital du garçon. Ce travail s’appuie sur les données issues de cohortes mère-enfants françaises ayant recruté des femmes enceintes au cours de leur grossesse et pour lesquelles des prélèvements biologiques ont permis la mesure de l’exposition. Les classes chimiques plus spécifiquement étudiées dans cette thèse comprennent les polluants organiques persistants (polychlorobiphényles, pesticides organochlorés et retardateurs de flamme bromés) et les éthers de glycol, une classe de solvants oxygénés. Les études menées mettent en évidence des effets sur le développement du système reproducteur, potentiellement associés à des mécanismes de perturbation endocrinienne, en lien avec l’exposition prénatale aux deux familles de polluants étudiées. Des modifications des niveaux d’hormones sexuelles sont observées en association avec l’exposition prénatale à divers polluants organiques persistants. L’exposition prénatale à certains éthers de glycol est associée à une augmentation du risque d’hypospade ainsi qu’à des modifications des niveaux d’hormones sexuelles. Ces résultats mettent en évidence les effets d’expositions prénatales à des polluants chimiques ubiquitaires, sur le système endocrinien du fœtus.
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Chirurgie dentaire
/ 14-12-2016
Brilleaud Baptiste
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La dépose d’ancrages radiculaires reste difficile pour beaucoup de praticiens et une nouvelle morphologie de clavette d’inlay-core facilement déposable, pourrait encourager les praticiens à réaliser des retraitements orthograde après dépose de ces ancrages. Ce travail a pour but de prouver qu’un ancrage fileté possède des caractéristiques de fixités suffisantes par rapport à des ancrages lisses, tout en présentant une facilité de dépose plus importante. Des tests ont été réalisés sur ancrages filetés et lisses, dans un premier temps en torsion pour dévisser ces mêmes ancrages. Puis ensuite de traction jusqu’à rupture complète de l’ancrage. Ce protocole reste soumis à amélioration mais a permis de mettre en évidence sur un faible échantillon, une facilité de dépose supérieure lors du démontage d’un ancrage fileté par rapport à un ancrage lisse ce qui est encourageant dans l’optique de créer une nouvelle morphologie plus aisément déposable.
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Physique
/ 14-12-2016
Girault Pauline
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Les micro-résonateurs (MRs) sont devenus des éléments clés de la conception de capteurs optiques intégrés, car étant plus miniaturisés que l’existant, ils s’intègrent mieux dans des systèmes ''lab-on-chip'', ce qui permet aussi de réduire le volume des molécules à détecter. Les MRs sont de plus très sensibles à la variation d’indice effectif provoquée par la présence de molécules dans le milieu de détection. Dans cette thèse, nous avons utilisé deux types de matériaux différents: les polymères et le silicium poreux. Les polymères, facilement réalisables avec des méthodes de fabrication peu onéreuses, sont dans un premier temps utilisés pour valider les outils de simulation développés pour l’étude des caractéristiques des MRs pour l’application capteur basée sur la détection par évanescence. Le silicium poreux permet d'exploiter un autre mode de détection, la détection en volume. Les molécules présentes dans le milieu de détection s'infiltrent dans le matériau et réagissent de manière directe avec la lumière. En utilisant les outils de simulation développés et en adaptant le procédé de photolithographie classique utilisé pour la fabrication de MRs en polymères, des premiers MRs constitués de guides ridges à base de silicium poreux sont mis en œuvre et caractérisés. Ces travaux de thèse démontrent expérimentalement la possibilité de détecter des concentrations de glucose avec une meilleure sensibilité que l'état de l'art pouvant atteindre les 600 nm/RIU, pour les domaines utilisant la détection et l'analyse de molécules (santé-agro, défense-sécurité, environnement).
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Chimie
/ 14-12-2016
Brisset Nicolas
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Ce travail de thèse repose sur deux axes d'étude : (i) l'influence des éléments légers solides, B et C sur la stabilité des phases binaires U-Si, et (ii) la recherche de nouvelles phases et leurs caractérisations physiques dans le système ternaire U-Pt-Si. Des ajouts mineurs de carbone ou de bore au sein d'échantillons U-Si ont montré que la formation de la phase de composition U₅Si₄ était corrélée à la présence de ces éléments légers, conduisant à mettre en doute son existence au sein du système binaire U-Si. Afin d'étudier le potentiel du bore comme simulant des non-métaux de la seconde période (C, N, O), la section isotherme à 927 °C du diagramme de phases ternaire U-Si-B a été tracée, révélant des équilibres entre les axes U-B et U-Si majoritairement et l'existence d'une nouvelle phase U₂₀Si₁₆B₃ isotype du composé ternaire au carbone. Ces résultats tendent à montrer les spécificités physico-chimiques de chacun de ces éléments légers sur le diagramme de phase U-Si. L'étude du diagramme de phases ternaire U-Pt-Si a été effectuée pour la section isotherme à 900 °C. Elle a abouti à la découverte de 14 nouvelles phases, dont U₃Pt₆Si₄ et U₃Pt7Si, présentant des arrangements structuraux inédits. Au préalable de cette étude, un examen du système U-Pt a été entrepris pour la zone de composition 30-70 at.% Pt, conduisant à une nouvelle évaluation du diagramme de phases binaire, intégrant le nouveau composé U₃Pt₄. La température des transformations a été mesurée par ATD. Nos résultats couplés aux données de la littérature ont permis une modélisation par la méthode Calphad. Les caractérisations physiques du nouveau composé binaire U₃Pt₄, indique un comportement de fermion lourd ordonné ferromagnétiquement en dessous de Tc = 7(1)K. En parallèle de ces travaux, l'étude de la famille U₃TGe₅ de type structural anti-Hf₅CuSn₃ a permis la découverte de neuf nouveaux composés pour T = V, Cr, Mn, Zr, Nb, Mo, Hf, Ta et W en plus du composé U₃TiGe₅ déjà répertorié. Leurs propriétés magnétiques et électroniques ont été évaluées, révélant des composés aux corrélations électroniques modérés avec des comportements évoluant en fonction du nombre d'électrons de valence du métal de transition d. Pour les composés avec T = Ti et V des corrélations entre ondes de densités de spin et de charge sont suspectées en dessous de la température d'ordre magnétique.
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Chimie
/ 14-12-2016
Tian Jianghao
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L'objectif de la thèse est de caractériser des populations bactériennes susceptibles de dégrader la lignine des résidus de culture afin d'optimiser la biodisponibilité du compartiment holocellulosique. L'originalité du sujet réside dans la recherche de bactéries ligninolytiques en utilisant des approches combinant à la fois de l'isolement de souches, des techniques de biologie moléculaire et de la mise en œuvre de ces micro-organismes à l'échelle de réacteur pilote, dans le cadre de prétraitements des résidus de culture. Les travaux de recherche ont été réalisés pour mettre en évidence et identifier des micro-organismes potentiellement intéressants et caractériser leurs systèmes enzymatiques susceptibles d'intervenir dans la dégradation de la lignine. Suite à l'isolement de plusieurs souches d'intérêts et à la mise en place de réacteurs, des expérimentations ont été réalisées afin de suivre l'effet des prétraitements biologiques sur la dégradation de la biomasse et notamment par l'étude des transformations biochimiques, de l'accessibilité à la cellulose ainsi que de l'évolution des communautés microbiennes. Les résultats de ces travaux ont montré que la communauté endogène joue un rôle primordial dans la biodégradation de la paille de colza. Bien que l'inoculation de bactéries exogènes ait eu peu d'influence, il est possible d'améliorer l'accessibilité à cellulose par un mélange de lignine et des sels minéraux permettant d'enrichir la communauté endogène active. Cette thèse s'articule autour de plusieurs analyses multi-échelles et complémentaires permettant de développer un prétraitement biologique de résidu de culture, d'améliorer sa mise en œuvre et son utilisation pour la digestion anaérobie par voie sèche ou la production de bioéthanol.
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Sciences des matériaux
/ 14-12-2016
Gharbi Amina
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Ce travail de thèse porte sur le développement des nouveaux verres bioactifs de comblement osseux. Ils sont élaborés par fusion dans le système quaternaire : SiO2-CaO-Na2O-P2O5. Deux éléments chimiques (bore et fluor), ont été incorporés au sein du réseau vitreux. L’effet de la quantité des éléments ajoutés dans le verre, sur le comportement physico-chimique, mécanique et physiologique a été mené par plusieurs techniques originales. L’intégration du bore ou du fluor au sein de la matrice vitreuse, influe sur les caractéristiques thermiques des verres synthétisés. Les performances mécaniques en termes de résistance mécanique, module de Young, module de cisaillement, rigidité et dureté ont été développé par l’incorporation du fluor dans la structure vitreuse. L’effet inverse a été manifesté pour les verres à base du bore. Des essais ''in vitro'' ont prouvé que la présence du bore accélère la dissolution de la matrice vitreuse, la cinétique et la cristallisation de la couche d’hydroxyapatite. Tandis que l’ajout du fluor retarde ces phénomènes physiologiques.
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