Lors de ce travail de thèse, nous nous sommes intéressés à la cognition sociale chez deux espèces d’oiseaux chanteurs, l’étourneau sansonnet (Sturnus vulgaris) et l’étourneau à ailes blanches (Onychognathus nabouroup). La cognition sociale fait référence aux capacités telles que la perception, la catégorisation ou la mémoire qui permettent aux individus d'organiser leurs interactions avec leurs congénères. Ces capacités sont essentielles aux individus puisqu'elles leurs permettent notamment d'être attentifs à leur environnement social et non-social et donc de choisir un partenaire sexuel, d'interagir avec d'autres individus (con- et hétérospécifiques) et de communiquer. Dans un premier temps, nous nous sommes intéressés, chez l’étourneau sansonnet, à l’effet et à l’effet de temps de différentes conditions de vie (captifs en conditions naturalistes, captifs en conditions appauvries) sur les caractéristiques attentionnelles individuelles et avons caractérisé la relation potentiellement existante entre ces caractéristiques attentionnelles et la communication vocale. Pour cela, nous avons enregistré individuellement la communication vocale des étourneaux puis nous avons caractérisé leur attention visuelle grâce à des tests d'attention standardisés où des stimuli visuels ou auditifs, sociaux ou non sociaux leur étaient présentés. Nous avons montré qu’indépendamment de leurs conditions de vie, les individus, en réponse aux stimuli, produisaient plus de coups d’œil (< 1s) que de regards (> 1s) et utilisaient plus leur vision monoculaire que leur vision binoculaire. Les individus élevés dans des conditions appauvries produisaient plus de comportements attentionnels que les individus élevés dans des conditions naturalistes. Nous avons aussi montré que certaines des caractéristiques attentionnelles observées entre et au sein des groupes évoluaient en fonction de la durée d’exposition des oiseaux à leurs conditions de vie respectives. D’autres au contraire, restaient stables. Enfin, il est apparu que les individus élevés dans des conditions naturalistes chantaient plus souvent que ceux élevés dans des conditions appauvries et que les individus ayant un réseau social développé sont également ceux qui sont les plus attentifs Dans un second temps, nous avons développé une méthode nouvelle et originale pour évaluer en milieu naturel et en groupe social, la capacité des oiseaux à discriminer et à catégoriser de manière appropriée les stimuli sociaux / biologiques et non biologiques. Nous avons pour cela étudié en Afrique du Sud une espèce d'oiseau phylogénétiquement apparentée à l'étourneau sansonnet, l'étourneau à ailes pâles, Cette étude a montré que les oiseaux ont accordé plus d'attention aux stimuli d'oiseaux qu’aux stimuli de paysage, aux stimuli non familiers qu’aux stimuli familiers et aux stimuli d’autres espèces d’oiseaux qu’aux stimuli d’étourneaux. Ainsi, la prise en compte des conditions de vie des animaux testés semble primordiale à la réalisation de toutes expériences scientifiques. Celles-ci pouvant en effet influencer les caractéristiques attentionnelles individuelles, caractéristiques qui interviennent dans de nombreux mécanismes (e.x. perception, apprentissage, mémorisation).

Le sujet d'étude de cette thèse concerne l'analyse des arguments au sein des débats politiques. Nous avons utilisé des techniques d'intelligence artificielle pour identifier automatiquement les composants argumentaires au sein des débats politiques. Notre approche de ce sujet est pluridisciplinaire, englobant plusieurs domaines incluant : le traitement du langage naturel, l'extraction d'arguments, et l'analyse de graphes en utilisant les GNNs. Nous commençons par analyser les débats politiques des élections présidentielles françaises en construisant un corpus de débats français. Cela nous permet de mieux comprendre la complexité des tâches d'extraction d'arguments et les raisons pour lesquelles il est difficile de construire de très grands ensembles de données. Par la suite, nous nous sommes penchés sur les méthodes qui tirent parti des structures syntaxiques des phrases pour faciliter la formation de modèles d'IA sur de petits ensembles de données. Pour ce faire, nous avons exploré la théorie des graphes pour exploiter les arbres syntaxiques des phrases. Nous avons ensuite proposé une nouvelle méthode pour faciliter l'utilisation de divers jeu de données ayant des schéma d'annotation similaire lors de la formation d'un modèle pour l'identification des composants argumentaires. Enfin, nous avons développé une nouvelle approche basée sur l'algèbre de Boole pour construire une nouvelle architecture d'apprentissage machine mieux adaptée aux propriétés de dépendance des nœuds.

Introduction : le drainage du liquide pleural infecté est crucial dans la prise en charge des infec-tions pleurales, que ce soit par le biais d'un drain thoracique ou par des ponctions pleurales ité-ratives, en association avec l'utilisation de la fibrinolyse intrapleurale et de la DNase. L'objectif de cette étude est de comparer l'efficacité et la sécurité de ces deux méthodes de drainage pleu-ral. Méthodes : nous avons mené une étude rétrospective multicentrique qui a inclus tous les patients hospitalisés pour une infection pleurale dans les hôpitaux universitaires de Rennes, Brest et Poitiers entre 2012 et 2021, drainés par insertion de drain thoracique ou par ponctions pleurales itératives. Une mise en correspondance par score de propension a été réalisée pour comparer les patients drainés par ponctions pleurales itératives (groupe RTT) et par drain thora-cique (groupe CT) avec fibrinolyse intrapleurale et DNase en complément. Résultats : deux cent vingt-neuf patients atteints d'une infection pleurale ont été inclus. Après mise en correspondance par score de propension, 78 patients ont été inclus dans l'analyse finale, répartis en deux groupes de 39 patients chacun. Les patients du groupe RTT avaient une durée de drainage ré-duite (6 jours [4,3-8] vs 9 [6,5-13], OR = 1,41, IC à 95 % [1,05-1,89]) et une durée de séjour à l'hôpital réduite (15 jours [11,5-21,5] vs 21 [14-30,5], OR = 1,28, IC à 95 % [1,01-1,61]). Il n'y avait pas de différence significative dans les taux de mortalité, les recours secondaires à la chi-rurgie, les rechutes et les complications liées au drainage entre les deux groupes. Conclusion : la prise en charge des infections pleurales par ponctions pleurales itératives avec fibrinolyse intrapleurale et DNase est associée à une réduction de la durée de séjour à l'hôpital et semble aussi sûre que le drainage par drain thoracique. Des essais contrôlés randomisés comparant les ponctions pleurales itératives et le drainage par drain thoracique seraient nécessaires pour con-firmer ces résultats.

Contexte : Les patients porteurs d’une cardiomyopathie hypertrophique sarcomérique présentent souvent des symptômes d’insuffisance cardiaque à FEVG préservée. Actuellement, les traitements proposés dans les recommandations sont restreints. Les inhibiteurs du SGLT2 ont récemment démontré une efficacité majeure dans l'HFpEF. Nous avons donc voulu explorer l'impact de ces traitements (dapagliflozine ou empagliflozine) sur la fonction myocardique et la capacité fonctionnelle. Méthodes : Pour cette étude, nous avons recruté 46 patients atteints de CMH non obstructive d'août 2019 à janvier 2023 ; 18 étaient traités par dapagliflozine ou empagliflozine et 28 témoins ont été inclus. Les données de l'échocardiographie d'effort et de l’épreuve d’effort cardiorespiratoire ont été recueillies avant et après l'introduction du traitement. Nous avons comparé les pics de VO2 moyens avant et après l'introduction des gliflozines. L’objectif principal était d'identifier les paramètres prédictifs d'une amélioration du pic de VO2. Résultats : Quarante-six patients symptomatiques atteints de CMH ont été inclus. Soixante-dix pourcents étaient des hommes, l'âge moyen était de 58,1±12,2 ans, le pic de VO2 moyen était de 21,6±7 ml/kg/min à l’inclusion. Le strain de la paroi libre du ventricule droit est un facteur prédictif significatif d’une amélioration du pic de VO2 chez les patients traités avec des inhibiteurs du SGLT2 (R= 0,76 ; p<0,05). Le strain de la paroi libre du ventricule droit est le seul paramètre échographique présentant une interaction avec le traitement (p d’interaction = 0,05). Le pic de VO2 et les autres paramètres de l’épreuve d’effort cardiorespiratoire n’ont pas significativement variés après 5 mois de traitement. Conclusion : Les inhibiteurs du SGLT2 n’ont pas significativement améliorés la capacité fonctionnelle de tous les patients CMH. Néanmoins, avoir un strain de la paroi libre du VD normal est un facteur prédictif significatif en faveur d’une amélioration du pic de VO2.

Objectif: Décrire les caractéristiques cliniques, radiographiques et microbiologiques des symphysites septiques issus des services de chirurgie et/ou de médecine. Matériel et méthodes: Étude observationnelle, rétrospective et multicentrique. Résultats: 71 patients recueillis dont la majorité avaient une histoire récente de chirurgie pelvienne, de néoplasie pelvienne et/ou d’infection uro-génitale récente. Pubalgie fébrile, douleurs inguinales et boiterie étaient les plaintes les plus fréquemment rapportées. Escherichia coli (25%) et Staphylococcus aureus (22%) étaient les monocultures les plus identifiées, nombreux étaient les prélèvements polymicrobiens. Le scanner et l’IRM étaient les examens d’imagerie privilégiés. La prise en soin thérapeutique associait très souvent l’antibiothérapie à une chirurgie (drainage ou débridement), permettant une rémission dans 47% des cas. La rechute septique concernait plus d’⅓ des patients et la moitié des patients gardait des séquelles mécaniques. Conclusion: Il s'agit de la série la plus large depuis 20 ans, permettant d’actualiser des données sur une infection ostéoarticulaire mal connue.

Le diabète gestationnel, trouble de la tolérance glucidique débutant ou diagnostiqué pendant la grossesse, est un enjeu de santé publique majeur. Lorsque les mesures hygiéno-diététiques échouent (pour environ 30% des patientes), l'insuline est le traitement de référence. Les antidiabétiques oraux, tels que la Metformine ou le Glibenclamide pourraient représenter une alternative intéressante. Cette étude est basée sur une revue systématique de la littérature, visant à évaluer l’efficacité et la sécurité de l’utilisation de ces traitements dans le diabète gestationnel. Une recherche a été effectuée autour des mots clefs “Metformine”, “Glibenclamide”, “Grossesse” et “Diabète gestationnel” dans les bases de données PubMed et Google Scholar de 2013 à 2023. Au total 45 études ont été sélectionnées puis analysées. La Metformine semble combiner efficacité dans le contrôle glycémique avec sécurité maternelle et néonatale. Comparée à l'insuline, elle réduit la prise de poids maternelle, diminue les hypoglycémies maternelles, et montre une tendance à réduire l'hypertension gravidique et la prééclampsie. De plus, les nourrissons de mères sous Metformine sont moins souvent macrosomes, présentent moins d'hypoglycémies néonatales, et nécessitent moins fréquemment une admission en unité de soins intensifs. En revanche, le Glibenclamide semble efficace pour le contrôle glycémique mais est associé à davantage de macrosomie et d'hypoglycémies néonatales. En conclusion, la Metformine semble être une alternative intéressante à l'insuline pour le traitement du diabète gestationnel, tandis que des incertitudes subsistent quant à la sécurité du Glibenclamide.

Cette thèse propose des solutions pour améliorer l'assemblage des génomes à partir de lectures de séquençage de troisième génération (lectures longues). Plus précisément, elle se concentre sur l'amélioration de l'assemblage des (méta)génomes contenant plusieurs haplotypes, comme des génomes polyploïdes ou des souches bactériennes proches. Les assembleurs actuels ont du mal à séparer les haplotypes très similaires, et fusionnent généralement des (parties d')haplotypes, ce qui entraîne la perte de polymorphismes et d'hétérozygotie dans l'assemblage final. Ce travail présente une série de méthodes et de logiciels pour obtenir des assemblages contenant des haplotypes bien séparés. Plus précisément, GenomeTailor et HairSplitter transforment un assemblage obtenu avec des lectures longues erronées en un assemblage phasé, améliorant considérablement l'état de l'art lorsque de nombreuses souches sont présentes. Le logiciel Alice propose une nouvelle méthode, basée sur des nouveaux sketchs ``MSR'', pour assembler efficacement plusieurs haplotypes séquencés avec des lectures de haute fidélité. Enfin, cette thèse propose une nouvelle stratégie de scaffolding Hi-C basée sur le démêlage des graphes d'assemblage qui améliore considérablement les assemblages finaux, en particulier lorsque plusieurs haplotypes sont présents.

Contexte : Après implantation ou remplacement d’un défibrillateur automatique implantable (DAI), les patients sont légalement soumis à une restriction de conduite automobile pour un délai variable suivant l’indication, à savoir 3 mois en cas de prévention secondaire, 1 mois en cas de prévention primaire et une semaine en cas de remplacement de boitier. Dans cette étude, nous avons évalué l’incidence de survenue d’une arythmie ventriculaire durant l’année suivant la procédure d’implantation ou remplacement et confronté nos résultats avec les recommandations actuelles de restriction de conduite. Méthode : Étude de cohorte rétrospective menée au CHU de Rennes, incluant les patients ayant bénéficié d’une implantation de DAI en prévention primaire, secondaire ou d’un remplacement de boîtier de DAI entre 2015 et 2021. Nous avons utilisé la formule de “risk of harm” définissant le seuil acceptable de risque pour reprise de la conduite automobile chez un conducteur porteur d’un DAI, avec un cut-off admis de 5 pour 100 000 (0.005%). Résultats : 914 patients ont été suivis pendant 384±66 jours. Parmi les 438 patients primo-implantés en prévention primaire, 14 ont présenté un évènement au cours du suivi, avec une incidence stable et inférieure à 1% durant chaque trimestre. Parmi les 216 patients primo-implantés en prévention secondaire, 39 patients ont présenté un évènement, dont la majorité durant le premier trimestre (25 patients, 11.5%). Les patients en prévention secondaire ont présenté plus d’arythmies ventriculaires le premier trimestre que ceux en prévention primaire (11.5% vs. 0.92%, p<0.001). Parmi les 260 patients ayant bénéficié d’un remplacement de boîtier, l’incidence de survenue d’une arythmie ventriculaire est restée faible. Le « risk of harm » calculé mensuellement est resté inférieur au seuil accepté de 0.005% dans chacun de ces groupes. Conclusion : Les patients primo-implantés en prévention secondaire présentent un risque de récurrence d’arythmies ventriculaires significativement plus élevés durant le premier trimestre que le reste de l’année, sans jamais dépasser le seuil accepté de « risk of harm ». Les patients primo-implantés en prévention primaire, comme les patients ayant bénéficié d’un remplacement de boitier, présentent un faible risque de survenue d’arythmie ventriculaire, ce qui pourrait conduire à une diminution de leur délai de restriction à la conduite automobile.

Cette thèse explore l'impact des décisions financières et de la conception des contrats sur la performance opérationnelle dans une chaîne d'approvisionnement décentralisée. Plus précisément, l'étude se concentre sur deux aspects financiers : le financement par crédit et les contrats d'options. Le financement par crédit accroît le risque opérationnel, tandis que les contrats d'options sont examinés comme un l'outil de gérer le risque de profit. Cette étude montre que les contrats d'options sont un outil précieux pour atténuer les effets néfastes de la décentralisation de la chaîne d'approvisionnement, surtout dans le cadre de contraintes financières. En transférant une partie du risque lié à la demande entre les membres de la chaîne d'approvisionnement, les contrats d'options peuvent améliorer la performance de l'ensemble du système en réduisant les risques d'inventaire et de faillite. Cette étude considère que les contrats d'options sont proposés en complément des contrats de prix de gros traditionnels pour améliorer la performance globale de la chaîne d'approvisionnement et celle de chaque membre. Ces contrats n'ont pas besoin de remplacer les accords existants, car ils sont déjà établis et évalués sur le marché. Au contraire, proposer des contrats d'options en tant qu'outil supplémentaire peut être plus avantageux. Les détaillants peuvent utiliser les contrats d'options pour gérer leur risque et augmenter leurs propres bénéfices en augmentant leur niveau d'inventaire, tandis que les fournisseurs peuvent les utiliser pour absorber le risque lié à la demande, ce qui leur permet d'améliorer leurs bénéfices. En conclusion, cette thèse offre des perspectives nouvelles sur l'efficacité des approches contractuelles pour améliorer la performance de la chaîne d'approvisionnement et réduire les risques financiers et opérationnels.

Dans cette thèse, les propriétés de transport des porteurs de charge, le processus de croissance des grains, le mécanisme de perte de VOC et les possibilités d'amélioration du rendement des cellules solaires de CZTSSe ont été étudiés. L'importante perte de VOC et le faible facteur de remplissage des cellules solaires CZTSSe sont les principaux défis pour l'amélioration du rendement. Cela est principalement dû à la mauvaise qualité de l'interface arrière, à l'alignement non optimisé des bandes et à la présence des phases secondaires dans l'absorbeur. Trois approaches ont été utilisées dans ce travail pour améliorer le rendement de ce cellules PV. Premièrement, une couche intermédiaire de WO3 a été introduite dans l'interface arrière pour inhiber la réaction indésirable entre la couche d'tungsten et l'absorbeur. Deuxièmement, l'alignement des bandes et la présence de phases secondaires à l'interface avant ont été améliorés en même temps par un traitement de sulfuration à basse température. Enfin, la conception et la réalisation d'une couche absorbeure à double gradient de band-gap en CZTSSe ont facilité la séparation et l'extraction des porteurs de charge. Des cellules solaires en CZTSSe avec un rendement de conversion photovoltaïque de 13,7% ont été obtenues. Ces très bons résultats, obtenus grâce à une meilleure comprehnsion du mécanisme de pertes, pourraient être une excellente base pour des améliorations futures.