Le domaine du calcul haute performance (HPC) vise à fournir aux scientifiques des systèmes capables de répondre aux exigences d'applications scientifiques complexes. Ces systèmes, les supercalculateurs, sont en constante évolution afin de relever de nouveaux défis et de répondre à de nouvelles exigences. Cependant, bien que la puissance de calcul de ces plateformes soit généralement le principal critère pour les définir, des infrastructures entières doivent passer à l'échelle pour atteindre les performances visées. En particulier, ces dernières années le volume de données traitées par le HPC a connu une augmentation drastique, et en retour, les exigences et les limites des systèmes de stockage à grande échelle ont pris une place centrale. Il est ainsi fondamental d'obtenir des connaissances suffisantes sur la manière dont les applications utilisent ces ressources et sur la manière de répondre à une large variété de cas d'utilisation afin d'obtenir de meilleures performances. Dans cette thèse, nous présentons une méthode pour acquérir de telles connaissances : permettre une meilleure simulation des systèmes de stockage complexes, afin de faciliter l'exploration rapide et en profondeur d'un large éventail de politiques de gestion, de choix de conception ou d'atténuation des goulots d'étranglement propres au HPC.

Au 1er janvier 2019, 1,6 million de personnes en France vivaient dans des structures sanitaires et sociales, dont un tiers en EHPAD. Cette étude examine les pratiques bucco-dentaires des aides-soignants dans une institution pour personnes âgées à Caen, en vue d’évaluer l’impact d’une formation sur l'amélioration de ces pratiques. Matériels et Méthodes : L'étude se déroule en trois phases : une observation initiale des pratiques bucco-dentaires avec un questionnaire, suivis d’une formation théorique des aides-soignants avec un groupe test (n=23) et un groupe témoin (n=22), et pour finir une seconde observation pour comparer les deux groupes. Les critères d'inclusion concernent les aides-soignants adultes réalisant la toilette des résidents. Les données sont analysées statistiquement à l'aide d'un test de Fisher pour évaluer les différences entre les pratiques conformes et non conformes. Résultats : L'étude montre une amélioration significative des pratiques d'hygiène bucco-dentaire chez les professionnels formés, avec un passage de 9% à 61% de pratiques conformes, contre 14% à 36% chez les non formés. Le test de Fisher a confirmé cette différence significative entre les deux groupes (p < 0.05). Conclusion : L’étude souligne l'impact bénéfique d'une formation sur les pratiques d'hygiène bucco-dentaire malgré les défis persistants liés aux ressources matérielles.

Introduction : Au 1er janvier 2019, 1,6 million de personnes en France vivaient dans des structures sanitaires et sociales, dont un tiers en EHPAD. Cette étude examine les pratiques bucco-dentaires des aides-soignants dans une institution pour personnes âgées à Caen, en vue d’évaluer l’impact d’une formation sur l'amélioration de ces pratiques. Matériels et Méthodes : L'étude se déroule en trois phases : une observation initiale des pratiques bucco- dentaires avec un questionnaire, suivis d’une formation théorique des aides-soignants avec un groupe test (n=23) et un groupe témoin (n=22), et pour finir une seconde observation pour comparer les deux groupes. Les critères d'inclusion concernent les aides-soignants adultes réalisant la toilette des résidents. Les données sont analysées statistiquement à l'aide d'un test de Fisher pour évaluer les différences entre les pratiques conformes et non conformes. Résultats : L'étude montre une amélioration significative des pratiques d'hygiène bucco- dentaire chez les professionnels formés, avec un passage de 9% à 61% de pratiques conformes, contre 14% à 36% chez les non formés. Le test de Fisher a confirmé cette différence significative entre les deux groupes (p < 0.05). Conclusion : L’étude souligne l'impact bénéfique d'une formation sur les pratiques d'hygiène bucco-dentaire malgré les défis persistants liés aux ressources matérielles.

Cette thèse présente des spectres à haute résolution de l’éthylène entre 1.6 et 1.7 μm obtenus par spectroscopie par temps de déclin d’une cavité optique dans des expansions supersoniques. Ces conditions de refroidissement en jet conduisent à un régime fortement hors-équilibre, permettant de mesurer des spectres rotationnellement froids en affectant peu la température vibrationnelle initiale. Trois spectres en jet de l’éthylène ont d’abord été enregistrés depuis un réservoir à température ambiante, en utilisant une fente à ouverture réglable conçue au laboratoire. Ensuite, des jets hypersoniques ont été produits avec une tuyère de Laval en graphite couplée à une source haute enthalpie, portant la température de stagnation à 650 et 850 K, en conservant une basse température rotationnelle, pour détecter les bandes chaudes. Les spectres et ont été analysées en détail grâce aux prédictions TheoReTS et aux relations de combinaison de différence de l’état fondamental. Le modèle théorique a été amélioré itérativement pour augmenter le nombre d’identifications. A ce jour, 838 transitions ont été attribuées dans 23 bandes froides et 218 dans 5 bandes chaudes. L’analyse des spectres enregistrés avec les plus hautes températures rotationnelle et de stagnation devrait permettre d’attribuer davantage de transitions dans les bandes froides et chaudes de l’éthylène. Ce travail fournit des données spectroscopiques haute résolution pour l’éthylène à des températures pertinentes pour les atmosphères des Jupiters tièdes et chauds.

Le carcinome rénal à cellules claires (ccRCC) est le cancer du rein le plus commun, comportant une proportion importante de patients considérés comme à faible risque de rechute qui finiront par rechuter. L'hétérogénéité cellulaire intra-tumorale (HIT) est un déterminant crucial de la prise en charge thérapeutique, et l'une des principales raisons de la faible survie des patients métastatiques. L’'HIT a été décrite dans de nombreux types de tumeurs avec des approches de transcriptomique à l’échelle de la cellule unique, permettant d’identifier l’ensemble des clones tumoraux composant la tumeur. Pour centraliser et comparer ces données en uro-oncologie, UncoVer a été développé, permettant la visualisation et l’analyse intégrative des données de scRNA-seq. A partir d’une étude du laboratoire visant à décrire l’HIT dans le ccRCC, un modèle de déconvolution prédictif de la survie des patients a été développé afin d’améliorer la stratification des patients classés à «faible risque» de rechute. Mon travail inclut également l’étude de l’effet de thérapies ciblées sur le ccRCC par scRNA-seq, afin d’identifier des populations de cellules sensibles ou résistantes, dans le but de mieux prédire la réponse thérapeutique des patients. Enfin, l’intégration de plusieurs études de scRNA-seq permettra de mieux comprendre l’évolution tumorale et d’identifier d’autres populations prédictives de la survie

Le principal objectif de cette thèse est d’examiner au niveau de la firme les déterminants de la productivité totale des facteurs pour 14 les entreprises moyennes et grandes du secteur manufacturier en Ethiopie. A cette fin, je mène dans un premier temps (chapitre 2) une analyse approfondie des différents facteurs qui affectent la productivité totale des facteurs au niveau firme. En utilisant un panel long (25 ans) de données d’enquête annuelle collectées par le Central Statistical Service éthiopien auprès des entreprises grandes et moyennes du secteur manufacturier et en appliquant le modèle classique développé par Olley et Pakes, puis étendu par Levinsohn et Petrin, j’estime une fonction de production Cobb-Douglas afin de pouvoir prédire la productivité totale des facteurs des firmes. Je réalise ensuite différentes estimations (modèle à effet fixe, modèle à effet aléatoire, Sys-GMM) pour identifier les différents déterminants de la productivité totale des facteurs. Les résultats montrent que l’ouverture au marché international, le niveau de qualification de la main d’oeuvre, la propriété privée et les incitations données aux employés ont un impact positif significatif sur la productivité totale des facteurs. En revanche, les prêts bancaires ont un effet significativement négatif sur la productivité total des facteurs. Ceci suggère que des politiques encourageant l’ouverture internationale et la propriété privée des entreprises (privatisations, notamment) amélioreraient la productivité. D’un autre côté, il est crucial de créer un environnement propice à l’accès aux prêts bancaires permettant aux entreprises manufacturières de bénéficier du prêt. Par la suite (chapitre 3), j’utilise une version modifiée du modèle d’Olley et Pakes incluant l’export dans l’estimation de la fonction de production et donc dans la prédiction de la productivité totale des facteurs pour étudier de manière plus approfondie le lien entre productivité et export dans les firmes éthiopiennes. Cette analyse mobilise des méthodes économétriques appropriées (matching et difference-in-difference) pour contrôler pour l’auto-sélection et isoler l’effet d’apprentissage par les exportations (learning-by-exporting). Je mets ainsi en évidence à la fois de l’auto-sélection et de l’apprentissage par les exportations dans le cas des entreprises manufacturières éthiopiennes. L’effet d’apprentissage par les exportations persiste dans le temps et débute avant même que la firme commence à exporter, ce qui reflète probablement les efforts de la firme pour satisfaire les attentes de ses nouveaux clients étrangers afin (et avant) de pouvoir leur vendre ses produits. Enfin, dans le chapitre 4, je poursuis en mobilisant la méthodologie des modèles à mélanges finis (finite mixture modiii els) l’analyse de l’hétérogénéité des firmes en matière de productivité totale des facteurs en décomposant celle-ci en un premier composant lié au choix de technologie de la firme et un second composant lié à l’habileté avec laquelle la firme utilise la technologie qu’elle a choisie. Les résultats montrent que ces deux composants sont l’un et l’autre importants pour comprendre la variation de la productivité entre les firmes. Je montre que si toutes les firmes sélectionnaient la meilleure technologie et l’utilisaient au mieux, leur production augmenterait en moyenne de 178 pour cent. L’analyse conduit à identifier un nombre de technologies allant de une à trois selon les secteurs, la plupart des secteurs comportant plusieurs technologies.

Le volume cellulaire est une caractéristique fondamentale des cellules vivantes. Chez les eucaryotes, la taille des cellules est un trait phénotypique hautement contrôlé qui module la biochimie intracellulaire, délimite l'interaction des cellules avec leur environnement et joue un rôle dans la taille des organismes multicellulaires. Le volume cellulaire est intimement lié à la prolifération, et de nombreux processus couplant la taille des cellules et la progression du cycle cellulaire ont été identifiés, assurant ainsi l'homéostasie du volume des cellules à l’échelle de la population. Cependant, malgré la conservation des mécanismes centraux de régulation du cycle de division, la taille des cellules peut varier de plusieurs ordres de grandeur entre les espèces. Le volume cellulaire pourrait donc être le produit de contraintes évolutives tout en contribuant directement aux stratégies d'adaptation des cellules eucaryotes. Au cours de ma thèse, j'ai étudié si le volume initial d'une cellule joue un rôle dans sa trajectoire évolutive dans des environnements délétères. À cette fin, j'ai utilisé un modèle unique chez la levure de fission me permettant de générer des populations distinctes de cellules génétiquement identiques mais avec des volumes cellulaires moyens différents. En utilisant un stress hyperosmotique comme modèle de pression de sélection, j'ai combiné cette approche avec des méthodes d'évolution expérimentale pour déterminer l'influence de la taille des cellules sur l'évolution de ces populations. De manière remarquable, mes études ont révélé une interaction entre le volume cellulaire et l'adaptation aux niveaux phénotypique, génétique et mécanistique. Mes résultats démontrent ainsi que la taille des cellules peut être un facteur clé d'adaptation, avec des implications pour les trajectoires évolutives des cellules eucaryotes exposées à des environnements défavorables.

Le but de cette thèse est d'étudier les conséquences comportementales d'une attention limitée dans les processus de prise de décision. J'examine les effets de l'attention limitée sur les choix de transport et explore en outre son impact sur la prise de décision dans les contextes individuels, sociaux et les scénarios dépourvus d'incitations monétaires. Composée de cinq chapitres, cette thèse contribue à la littérature sur la recherche en transport, la prise de décision dans le risque et l'incertitude.

Cette thèse s’intéresse aux déterminants et conséquences de l’étendue de la déclaration d’assurance de durabilité (EDAD). Trois articles sont présentés, chacun abordant des facettes distinctes et interconnectées de l’EDAD. J'ai utilisé un échantillon d’entreprises appartenant à l’indice FTSE 350 du Royaume-Uni au 31 décembre 2020 et dont le rapport de durabilité a fait l’objet d’une assurance pendant la période 2012-2021. Le premier article se concentre sur les déterminants de l’étendue de la déclaration. Les résultats montrent que les vérificateurs comptables (vs non comptables), une divulgation plus grande d’information durable, et l’utilisation conjointe de différentes normes d’assurance de durabilité sont associés à une EDAD plus élevée. Le deuxième article examine la relation entre l’EDAD et l’asymétrie de l’information. Les résultats montrent qu’une étendue plus élevée est associée à une réduction de l’asymétrie de l’information. Cependant, l’ancienneté de l’auditeur atténue l’impact de l’EDAD sur la réduction de l’asymétrie de l’information. Les résultats montrent que la longueur de la durée du mandat des auditeurs peut compromettre leur indépendance, affaiblissant ainsi l’impact de l’EDAD dans l’atténuation de l’asymétrie d’information. Le troisième article examine la relation entre l’EDAD et le découplage entre pratiques et communication durables. Les résultats indiquent que l’étendue est significativement et négativement associée au découplage. Les résultats montrent également qu’en présence de controverses sur la durabilité, les entreprises ont tendance à augmenter l’étendue de la déclaration pour signaler leur engagement de transparence en matière de durabilité. Collectivement, ces articles enrichissent la littérature sur l’assurance de la durabilité et offrent des informations pratiques précieuses aux gestionnaires d’entreprise, aux investisseurs et aux décideurs intéressés par l’amélioration de la crédibilité et de l’efficacité des divulgations en matière de durabilité.

Cette thèse discute de la conception d'algorithmes utilisant des méthodes d'apprentissage profond pour aborder trois questions clés dans le domaine de l'épilepsie. Premièrement, nous avons conçu un algorithme de détection automatique de l'épilepsie basé sur le Transformer et la fonction de perte LDAM afin d'aider les neurologues à identifier avec précision les signaux EEG épileptiques à partir d'enregistrements EEG de longue durée. Deuxièmement, nous avons proposé un algorithme de prédiction automatique de l'épilepsie basé sur l'apprentissage par transfert et la fusion de plusieurs caractéristiques, visant à émettre des avertissements d'épilepsie avant que les crises ne surviennent, minimisant ainsi ou évitant les dommages causés par les crises épileptiques. Enfin, nous avons introduit un algorithme de localisation des sources EEG épileptiques basé sur l'apprentissage multi-échelle et dirigé par la simulation pour analyser les signaux EEG du cuir chevelu et identifier avec précision les foyers épileptiques sur le cortex cérébral.