Les campylobactérioses sont les principales zoonoses en Europe et sont principalement attribuées à la consommation de viandes de volailles contaminées par la bactérie Campylobacter. Pour réduire le risque d’infections humaines, la vaccination des volailles contre Campylobacter est un moyen de lutte envisagé mais à ce jour aucun vaccin n’existe sur le marché malgré le nombre important de travaux. De récentes études ont rapporté des interactions entre le système immunitaire et le microbiote caecal du poulet en réponse à la colonisation par Campylobacter chez le poulet de chair. L’objectif général de ce travail de thèse est de rechercher quels paramètres immunologiques peuvent être impliqués dans la protection des poulets de chair suite à la vaccination contre Campylobacter ainsi que l’impact du microbiote caecal sur l’induction de cette protection (et vice versa) pour améliorer le protocole vaccinal contre ce pathogène. Des essais in vivo ont été réalisés avec certains candidats vaccins identifiés par vaccinologie inverse précédemment afin de tester différents paramètres de vaccination (nature du candidat vaccin, fréquence et voie d'inoculation). Tous les protocoles d'immunisation testés ont induit des réponses immunitaires innées, humorales et/ou cellulaires, ainsi qu’ une modulation du microbiote caecal. Toutefois, un seul protocole a induit une réduction significative de la colonisation de Campylobacter (1,3 log10). Des études supplémentaires sont nécessaires pour mettre au point un vaccin efficace contre Campylobacter chez les poulets de chair, par exemple en testant d'autres candidats vaccins.

Lors de ce travail de thèse, nous nous sommes intéressés à la cognition sociale chez deux espèces d’oiseaux chanteurs, l’étourneau sansonnet (Sturnus vulgaris) et l’étourneau à ailes blanches (Onychognathus nabouroup). La cognition sociale fait référence aux capacités telles que la perception, la catégorisation ou la mémoire qui permettent aux individus d'organiser leurs interactions avec leurs congénères. Ces capacités sont essentielles aux individus puisqu'elles leurs permettent notamment d'être attentifs à leur environnement social et non-social et donc de choisir un partenaire sexuel, d'interagir avec d'autres individus (con- et hétérospécifiques) et de communiquer. Dans un premier temps, nous nous sommes intéressés, chez l’étourneau sansonnet, à l’effet et à l’effet de temps de différentes conditions de vie (captifs en conditions naturalistes, captifs en conditions appauvries) sur les caractéristiques attentionnelles individuelles et avons caractérisé la relation potentiellement existante entre ces caractéristiques attentionnelles et la communication vocale. Pour cela, nous avons enregistré individuellement la communication vocale des étourneaux puis nous avons caractérisé leur attention visuelle grâce à des tests d'attention standardisés où des stimuli visuels ou auditifs, sociaux ou non sociaux leur étaient présentés. Nous avons montré qu’indépendamment de leurs conditions de vie, les individus, en réponse aux stimuli, produisaient plus de coups d’œil (< 1s) que de regards (> 1s) et utilisaient plus leur vision monoculaire que leur vision binoculaire. Les individus élevés dans des conditions appauvries produisaient plus de comportements attentionnels que les individus élevés dans des conditions naturalistes. Nous avons aussi montré que certaines des caractéristiques attentionnelles observées entre et au sein des groupes évoluaient en fonction de la durée d’exposition des oiseaux à leurs conditions de vie respectives. D’autres au contraire, restaient stables. Enfin, il est apparu que les individus élevés dans des conditions naturalistes chantaient plus souvent que ceux élevés dans des conditions appauvries et que les individus ayant un réseau social développé sont également ceux qui sont les plus attentifs Dans un second temps, nous avons développé une méthode nouvelle et originale pour évaluer en milieu naturel et en groupe social, la capacité des oiseaux à discriminer et à catégoriser de manière appropriée les stimuli sociaux / biologiques et non biologiques. Nous avons pour cela étudié en Afrique du Sud une espèce d'oiseau phylogénétiquement apparentée à l'étourneau sansonnet, l'étourneau à ailes pâles, Cette étude a montré que les oiseaux ont accordé plus d'attention aux stimuli d'oiseaux qu’aux stimuli de paysage, aux stimuli non familiers qu’aux stimuli familiers et aux stimuli d’autres espèces d’oiseaux qu’aux stimuli d’étourneaux. Ainsi, la prise en compte des conditions de vie des animaux testés semble primordiale à la réalisation de toutes expériences scientifiques. Celles-ci pouvant en effet influencer les caractéristiques attentionnelles individuelles, caractéristiques qui interviennent dans de nombreux mécanismes (e.x. perception, apprentissage, mémorisation).