Alors que les mécanismes impliqués dans la tolérance à la dessiccation (TD) restent partiellement incompris, les osmolytes capables d'échanger des liaisons hydrogène, tels que les disaccharides, les acides aminés et les acides organiques, semblent jouer un rôle crucial. Ces osmolytes sont également de plus en plus utilisés en chimie verte comme composants clés des solvants eutectiques naturels profonds (NaDES). Nous présentons ici des preuves expérimentales soutenant l'hypothèse selon laquelle les NaDES pourraient former une troisième phase liquide dans les tissus des graines, où ils pourraient solubiliser et protéger les macromolécules pendant la déshydratation. Après avoir identifié les composants présumés des NaDES, appelés DESmolytes, leur colocalisation et leurs interactions préférentielles au sein des compartiments des graines ont été révélées par imagerie par spectrométrie de masse (MSI). En se basant sur ces résulats, des NaDES reconstitués in vitro ont montré une capacité à protéger les protéines contre la dessiccation et le stress thermique ainsi qu'à solubiliser des métabolites spécialisés des graines de colza. En persepctive, ces résultats doivent être validés dans d'autres organismes, tels que le pollen, afin de confirmer davantage la formation de NaDES dans les cellules vivantes.

Les foules denses représentent des environnements complexes où les interactions physiques peuvent conduire à des situations dangereuses. Cette thèse développe un cadre de simulation physique pour modéliser la récupération d'équilibre humain dans les foules denses et leur rôle dans l'apparition de phénomènes large échelle. Trois approches sont proposées : une méthode de contrôle basée sur des principes biomécaniques pour simuler les stratégies de pas ; des méthodes d'apprentissage par imitation utilisant l'apprentissage par renforcement pour améliorer la généralité ; et une extension multi-agents via l'apprentissage par transfert, introduisant une heuristique pour les contacts des mains. Les résultats démontrent que notre approche reproduit les comportements observés expérimentalement, à un niveau de détail jamais exploré auparavant dans la simulation de foule, ouvrant de nouvelles perspectives pour la sécurité publique et l'urbanisme.

L'ingénierie système est un domaine de l'ingénierie qui traite de la conception, du développement et de l'exploitation de systèmes tels que les avions, les engins spatiaux, les automobiles, etc. Ce domaine implique de nombreuses parties prenantes qui adressent de multiples aspects d'un système (architecture, simulation, gestion des exigences, etc.) tout au long de son cycle de vie. Au fil du temps, la complexité des systèmes augmente constamment, émergeant désormais non seulement des parties elles-mêmes mais aussi des interactions entre les différents composants du système. Parallèlement, les pratiques d'ingénierie ont évolué du développement de systèmes à partir de zéro vers la réutilisation et l'amélioration de composants existants pour construire de nouvelles versions de systèmes. De plus, un nombre croissant de normes telles que les standards environnementaux ou de sécurité doivent être respectées, nécessitant leur validation par rapport au système pour identifier leurs impacts éventuels. Cependant, les pratiques d'ingénierie système reposent fortement sur des documents informels rédigés en langage naturel pour décrire le système et ses différents aspects. Elles dépendent également de processus séquentiels (par exemple conception, ingénierie, intégration, validation, exploitation) tout au long du cycle de vie du système, avec une prise de décision synchrone. Ces processus ont été initialement conçus pour gérer correctement la complexité du système et les injonctions contradictoires interdisciplinaires en cloisonnant les différentes disciplines impliquées. Néanmoins, ils empêchent désormais le domaine de gérer correctement les besoins des systèmes actuels. En effet, cela nécessite plus de flexibilité, des cycles d'itération plus courts, une prise de décision asynchrone, et davantage de travail interdisciplinaire et transdisciplinaire malgré l'hétérogénéité inhérente des experts, des disciplines et de la nature physique des systèmes eux-mêmes. Pour relever ces défis, l'ingénierie système transite vers deux paradigmes complémentaires. Premièrement, l'ingénierie système basée sur les modèles (ISBM) a été proposée pour remplacer les documents par des modèles intégrés explicites. Ces modèles représentent les préoccupations du système à un niveau d'abstraction donné décrit à travers des langages de modélisation dédiés. L'utilisation de ces langages permet de réduire l'ambiguïté et de fournir des capacités de vérification formelles et automatiques tout en offrant un environnement de modélisation riche pour la gestion des modèles. L'ISBM fournit ainsi une réponse dans l'espace technique aux défis en permettant de connecter différentes préoccupations du système, conduisant à une meilleure compréhension du système. Concernant l'espace méthodologique, l'ingénierie système adopte des méthodes d'ingénierie continue. Le domaine vise à faire exécuter les différentes phases du cycle de vie de manière itérative, avec une intégration, des tests et un déploiement continus tout au long du processus de développement. Cela permet des cycles d'itération plus courts, un retour d'information précoce et une meilleure réactivité aux exigences changeantes. De nombreuses approches existent tant dans la littérature que dans la pratique pour assister ces transitions. La plupart d'entre elles se concentrent sur un seul des deux paradigmes : soit des outils basés sur les modèles pour soutenir les parties prenantes et connecter les données d'ingénierie, soit de nouvelles méthodes d'ingénierie continue adaptées à l'ingénierie système. Cependant, ces approches sont insuffisantes pour relever les défis du domaine. Premièrement, les experts indiquent que les ateliers de modélisation sont difficiles à utiliser et présentent une faible utilisabilité au niveau individuel. Cela impacte la productivité des experts car ils doivent passer du temps à apprendre et utiliser les outils plutôt qu'à se concentrer sur leurs préoccupations d'ingénierie principales, ce qui devient un goulot d'étranglement pour atteindre des cycles d'itération plus rapides. Deuxièmement, les espaces techniques et méthodologiques ne sont pas décorrélés : un changement technique peut impacter les choix méthodologiques, et vice versa. Par exemple, la modification d'un modèle par une partie prenante peut impacter les modèles d'autres disciplines, les obligeant à modifier leurs propres modèles pour assurer la cohérence du système. Cela appartient à l'espace méthodologique et constitue un défi au niveau collectif. Dans cette thèse de doctorat, nous proposons des approches d'ingénierie augmentée pour assister la transition vers l'ingénierie système basée sur les modèles et l'ingénierie continue tout en considérant à la fois l'utilisabilité de l'environnement de modélisation au niveau individuel et la corrélation entre espaces technique et méthodologique au niveau collectif. Notre contribution se divise en deux parties principales adressant ces niveaux respectifs. Premièrement, au niveau individuel, nous proposons une nouvelle approche pour améliorer l'utilisabilité des ateliers de modélisation en intégrant des fonctionnalités interactives adaptées aux langages. Ces fonctionnalités sont spécialisées pour un langage dédié (DSL \emph{Domain-Specific Language}) et améliorent la lisibilité, la navigation et l'édition des modèles. Pour atteindre cet objectif, nous proposons d'étendre les ateliers de conception de langages, qui sont des outils conçus pour développer systématiquement des environnements de modélisation pour les experts de domaine. Plus spécifiquement, nous proposons un nouveau méta-langage pour définir de telles fonctionnalités. Ce nouveau méta-langage s'appuie sur les autres métamodèles du DSL conçu, tels que la syntaxe abstraite et la syntaxe concrète, pour permettre la définition de telles fonctionnalités dédiées. Deuxièmement, au niveau collectif, nous proposons une approche pour soutenir la collaboration sociotechnique en ingénierie système en adressant les aspects techniques et méthodologiques de la transition vers l'ingénierie continue. Plutôt que de fournir de nouveaux outils et méthodes, notre approche cherche à combler le fossé entre ces deux dimensions en connectant les outils existants aux méthodes existantes. L'approche comprend trois composants interconnectés qui décrivent les données collaboratives, l'intégration des outils impliqués dans le processus de collaboration et les workflows (flux de travaux) de collaboration eux-mêmes. Il permet la spécification de phases d'orchestration qui définissent les dépendances entre modèles, de phases de contribution qui établissent les conditions d'acceptation pour les nouvelles versions de modèles, et de phases d'intégration qui valident la cohérence des modèles composés. À travers cette approche, nous pouvons décrire différents workflows de collaboration augmentés par des outils pour permettre une prise de décision asynchrone et un développement parallèle à travers des disciplines d'ingénierie hétérogènes tout en maintenant la traçabilité entre les modèles d'architecture système, les exigences et les modèles de simulation. Nous évaluons les deux contributions à travers des cas d'usage représentatifs. Pour la contribution sur l'interactivité, nous démontrons la faisabilité à travers deux études de cas : un petit DSL personnalisé et SysML v2, un standard industriel pour l'ingénierie système. Ces études de cas montrent que notre approche passe à l'échelle des langages simples aux langages complexes. L'évaluation des performances confirme que les fonctionnalités interactives restent réactives même dans des environnements de modélisation distribués. Pour la contribution sur la collaboration, nous proposons un protocole d'évaluation basé sur le système AIDA de l'IRT Saint Exupéry, un système cyber-physique réaliste intégrant plusieurs disciplines d'ingénierie. Ce protocole valide la capacité de l'approche à supporter des workflows de collaboration séquentiels et parallèles tout en maintenant la continuité entre les modèles d'architecture, les exigences et les simulations. À l'état actuel du travail, l'évaluation est encore en cours.

L'une des questions clés en astrophysique de laboratoire consiste à comprendre comment la complexité moléculaire se développe dans les environnements astrophysiques. Ce travail explore les processus physiques et chimiques présumés en phase gazeuse, à basse température. Les expériences ont été menées à l'aide de la technique CRESU (Cinétique Réactive en Écoulement Supersonique Uniforme) combinée à la spectrométrie de masse, et complétés par des calculs ab initio. Une première partie est consacrée à l'étude des réactions ion-molécule à basse température (jusqu'à 24 K) à l'aide d'une variante équipée d'une source d'ions sélective. Nous avons confirmé que les collisions avec Ar⁺, comme d'autres ions de gaz nobles, conduisent à la fragmentation des petits hydrocarbures CH₄ et C₂H₄. En revanche, nous avons démontré que CH₃⁺ favorise la croissance moléculaire lorsqu'il réagit avec CH₄, C₂H₂, C₂H₄ et, dans une moindre mesure, C₃H₄. L'impact de l'intégration des données dans un modèle chimique d'un nuage interstellaire dense reste toutefois limité. Une deuxième partie se concentre sur l'étude des processus de nucléation en phase gazeuse à l'aide de l'instrument CRESUSOL, qui combine la méthode CRESU avec le rayonnement synchrotron. Nous avons montré ici qu'un excès de propane C₃H₈ accélère la nucléation du benzonitrile C₆H₅CN. Plusieurs mises à jour expérimentales du CRESU-SIS sont ensuite décrites. De nouveaux développements instrumentaux, notamment basés sur une source d'ions Aerospike, sont proposés. Enfin, les perspectives de rechercher, centrés sur la chimie des anions, sont évoquées.

Nos travaux portent sur le développement de modèles d’apprentissage profond pour la détection de spoofing vocal, dans le but d’améliorer la vérification du locuteur et de prévenir les usurpations d’identité. Nous commençons par définir le domaine dans lequel s’inscrit cette thèse, avec un focus particulier sur la parole, puis présentons un état de l’art permettant d’identifier les limites actuelles que nous avons cherché à dépasser. Nos contributions se concentrent sur l’exploration de représentations issues de modèles de fondation en parole comme front-end pour l’extraction de caractéristiques, ainsi que sur leur interaction avec des modèles back-end à l’état de l’art afin d’apprendre à distinguer les signaux authentiques des spoofings. Enfin, nous simplifions la chaîne de traitement en réduisant la taille du back-end tout en obtenant de meilleures performances que des modèles de plus grande capacité. Nous concluons par une synthèse de nos travaux et de nos résultats, avant de proposer des perspectives permettant de repousser les limites rencontrées au cours de cette thèse.

Introduction – Le cancer du sein triple-négatif (CSTN) est un sous-type moléculaire moins fréquent mais plus agressif de cancer du sein que l’on retrouve notamment chez des patientes plus jeunes. S’il ne possède pas de cible thérapeutique spécifique, la découverte de sa forte immunogénicité a permis le développement de nouvelles thérapeutiques sous forme d’immunothérapie, y compris en situation néoadjuvante. Néanmoins, pour mieux comprendre et prédire la réponse aux traitements, une meilleure caractérisation immune est nécessaire. Méthodes – Après une caractérisation de 91 CSTN par cytométrie en flux (CMF), 19 de ces tumeurs ont été caractérisées par IHC multiplexe par technique Hyperion et 25 par analyse transcriptomique. En parallèle, un modèle murin a été développé tout comme une étude radiomique prospective. Résultats – Après caractérisation des sous-populations immunes par CMF, seuls les lymphocytes CD4+ (LT CD4+) Th2 avaient une valeur pronostique pour la survie sans récidive et globale, notamment plus forte que les TILs. Les tentatives de validations orthogonales ont permis de retrouver des valeurs de leucocytes CD45+, LT CD4+, voire CD 8+, corrélées en IHC et transcriptomique mais ont manqué de puissance pour que cela puisse être le cas pour les Th2. Par ailleurs, pour une meilleure corrélation aux schémas néoadjuvants actuels, un modèle murin a été créé permettant l’étude des sous-populations immunes et une analyse radiomique a été menée sur une cohorte prospective. Conclusion – Les LT CD4+ Th2 mesurés par CMF ont une valeur pronostique en adjuvant mais celle-ci, tout comme celle prédictive, restent à prouver en néoadjuvant par différentes techniques utilisables en pratique clinique.

Des enquêtes européennes ont révélé la présence de quantités excessives d'ammoniums quaternaires et de chlorates, notamment dans le lait et les produits laitiers. Si pour les AQs, la contamination est liée à leur usage, la problématique des chlorates vient de l’utilisation de désinfectants à base de chlore qui engendre la formation de ces sous-produits chlorés. En conséquence, le consommateur pourrait les ingérer et être exposé à un risque toxicologique. Par ailleurs, les méthodes d'autocontrôle actuellement utilisées dans l'industrie ne respectent pas la limite maximale de résidus (100 µg/kg) autorisée. Pour répondre à ces problématiques, des biocapteurs enzymatiques électrochimique et colorimétrique pour la détection des ammoniums quaternaires dans une solution tampon ont été développés. Pour les chlorates, dans l’eau du robinet, une méthode spectrophotométrique a été développée et validée. Les résultats de cette thèse montrent que les (bio)capteurs sont des outils analytiques prometteurs pour l’autocontrôle, car ce sont des outils portables, rapides, peu onéreux et qui atteignent la LMR.

Les produits biocides jouent un rôle crucial dans la protection de la santé humaine et animale contre les agents biologiques pathogènes susceptibles de pénétrer dans la chaîne alimentaire. Les produits biocides, contenant une ou plusieurs substance(s) active(s), sont couramment utilisés dans la chaîne alimentaire pour diverses applications en tant que produits désinfectants, produits de protection et produits de lutte contre les organismes nuisibles. À ce jour, la présence de résidus de substance active biocide dans les denrées est très peu documentée. Quelques études font état de la présence de ces résidus dans les denrées dépassant dans certains cas les limites maximales de résidus (LMR) fixées pour ces substances. En raison des nombreux usages de ces produits dans la chaîne alimentaire, l'évaluation de la présence de ces résidus dans les denrées est loin d'être exhaustive. Il semble nécessaire de développer des stratégies analytiques permettant d’évaluer la contamination des denrées par les produits biocides. Récemment, de nouveaux outils et méthodologies analytiques utilisant la spectrométrie de masse à haut pouvoir résolutif (LC-HRMS) ont été utilisés dans le but d’explorer sans a priori l’espace chimique auquel nous sommes exposés quotidiennement. Ce projet de recherche s’inscrit dans ce contexte dans le but 1) d’identifier et prioriser les substances actives biocides utilisées dans la chaîne alimentaire, 2) d’évaluer la contamination des denrées d’origine animale par les produits biocides et 3) d’étudier le devenir d’un résidu de substance active biocide dans le lait de vache sous l’effet de la chaleur. Pour répondre à ces objectifs, une méthodologie de classement des risques a été utilisée pour prioriser les substances actives biocides utilisées dans la chaîne alimentaire pour les denrées d’origine animale. Une méthode analytique utilisant la LC-HRMS a été mise au point pour rechercher ces substances actives dans le muscle de poulet et le lait de vache afin d’évaluer la contamination de ces denrées par les produits biocides. Par ailleurs, des approches de screening semi-ciblé et non-ciblé ont été développés pour ouvrir le champ de détection à d’autres contaminants chimiques présents dans les denrées. L’applicabilité de la méthode a été réalisée sur une sélection de denrées provenant de diverses sources dans le commerce mais aussi lors d’un essai inter laboratoire organisé dans le cadre du projet PARC (WP4.3.4.b_Y2_F02). Pour finir, l’évaluation de l’exposition aux substances chimiques se concentre généralement sur le composé en lui-même ignorant l’impact des procédés industriels (chauffage, congélation) pouvant générer des produits de transformation. L’effet de ces procédés peut induire une modification par transformation ou dégradation de l’état structurel des composés parents et donc de générer de nouveaux contaminants indésirables encore inconnus. Cette étude a permis d’étudier le devenir de l’AMPD dans le lait de vache suite à un traitement thermique. L’analyse ciblée utilisant la LC-MS/MS a permis d’observer un abattement de concentration en AMPD avant et après chauffage. Cet abattement de concentration serait à l’origine d’un produit de transformation observé lors d’analyse non-ciblée menée en LC-HRMS.

La littérature s’accorde sur le caractère mitigé du bilan des réformes engagées sous le prisme du Nouveau Management Public (Weller & Woods, 1999). Si les causes d’échec ont été largement étudiées, on sait peu de choses sur les interactions et la hiérarchisation des facteurs de succès ou d’échec (Stimec & Combes-Joret, 2019). C’est pourquoi la présente recherche se penche sur les facteurs d’efficacité du Nouveau Management Public (NMP). La démarche d’étude de cas multiples (Yin, 2009) permet d’identifier sept variables pour évaluer huit réformes camerounaises entre 2000 et 2025. Elle mobilise les théories des parties prenantes (Freeman, 1984) et de la traduction (Callon, 1986). À partir d’une analyse documentaire et de contenu de 49 entretiens semi-directifs, l’approche cognitive interprétativiste montre que seules trois des huit réformes sont relativement efficaces, grâce à la structure bureaucratique. Ce résultat peut sembler contradictoire, car on pensait que la bureaucratie était inefficace (Hood, 1976), ce qui avait conduit à l’adoption du NMP. Pourtant, la bureaucratie n’a pas été rejetée, mais a plutôt été hybridée, révélant une variété d’adaptations contextuelles. Ainsi, le succès des réformes inspirées du Nouveau Management Public dépendrait de la combinaison d’une bureaucratie flexible à la mode « libérale » et du rôle joué par les « traducteurs » des réformes. Ce résultat contraste avec la littérature et replace la bureaucratie au cœur du processus des réformes.

Les Lois Fondamentales d’Ancien Régime demeurent encore aujourd’hui relativement insaisissables. Elles n’en restent pas moins le soubassement juridique qui aura favorisé la prospérité de la monarchie Capétienne pendant près de huit cent ans. A la convergence de ces deux constats, il apparaît intéressant d’interroger leur capacité à dépasser leur ancien cadre historique pour appréhender la pensée libérale moderne. Cette démarche, essentiellement prospective, répond en réalité à la nature profonde de ces Lois du Royaume. Essentiellement coutumières, elles procèdent en effet d’une philosophie particulière qui appelle la règle de droit à s’adapter en permanence à l’environnement sur lequel elle se déploie. Sur le plan institutionnel cela peut revenir à questionner leur propension à assimiler les critères juridiques du constitutionnalisme. Relativement insoluble, cette problématique ne reste toutefois pas sans offrir quelques pistes de réponses. D’abord en appréhendant la complexité politique et sociale de l’ancienne France, puis en la confrontant à notre riche histoire constitutionnelle. S’il reste effectivement possible de déceler certains germes de modernité au sein de l’ancien ordre public, c’est sans doute à travers l’étude des Constitutions écrites et du regard de ceux qui les ont faites entre 1791 et 1958.