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Analyse et traitement de l'information et des images médicales
/ 31-03-2026
Bories Mathilde
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La caractérisation de l’exposition médicamenteuse hospitalière constitue un enjeu méthodologique majeur, dans un contexte marqué par la complexité croissante des prescriptions. En pratique, l’exposition est le plus souvent appréhendée à travers l’évaluation de déterminants de prescription tels que la polypharmacie (PP), l’hyperpolypharmacie (HPP), les interactions médicamenteuses (DDI) et les médicaments potentiellement inappropriés (PIM), généralement mesurés à des temps définis du séjour. Ces approches ne permettent toutefois pas de décrire la dynamique temporelle ni la charge médicamenteuse cumulée supportée par les patients au cours de l’hospitalisation.
Cette thèse propose une approche méthodologique pour caractériser l’exposition médicamenteuse à partir de données de santé en vie réelle et développer des métriques d’exposition cumulée. La première partie repose sur une étude incluant 57 960 patients atteints de cancer, exploitant l’appariement entre le SNDS et des entrepôts de données de santé au sein de la cohorte HUGOSHARE. La seconde partie décrit le développement de deux métriques originales, la Cumulative Drug Exposure (CDE) et la Cumulative Drug Exposure Density (CDED), construites à partir des données d’administration hospitalière. La troisième partie évalue ces métriques chez 339 patients greffés de cellules souches hématopoïétiques. Ce travail montre que les métriques cumulatives permettent de décrire finement l’exposition médicamenteuse hospitalière et d’analyser des profils d’exposition associés aux réhospitalisations et à la mortalité. Il met en évidence l’apport de métriques intégrant la dimension temporelle de l’exposition et ouvre des perspectives pour leur mobilisation dans les systèmes d’information hospitaliers à des fins d’analyse et de suivi des prescriptions.
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Neurosciences, éthologie
/ 27-03-2026
Mosinski Francis
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L’étude des états affectifs chez les animaux non-humains s’est grandement développée aux cours des dernières décennies, ce qui a conduit aujourd’hui à voir les animaux comme des êtres sensibles, avec une vie intérieure riche. Si les états négatifs ont été largement étudiés, les états positifs n’ont reçu de l’attention que récemment. Leur compréhension est pourtant essentielle au bien-être. Cela est d’autant plus vrai chez les oiseaux, dont les capacités émotionnelles ont été peu étudiées par rapport aux mammifères. Cette thèse vise à décrire l’expression émotionnelle positive d’une espèce connue en recherche sur le comportement, la caille japonaise. Nous avons observé l’expression émotionnelle de cailles dans plusieurs contextes positifs. En anticipation d’une récompense alimentaire, nous avons relevé un redressement des plumes de la gorge, ainsi qu’une fréquence de cris d’offrande plus élevée chez les mâles. Des variations similaires ont été retrouvées chez des mâles anticipant un contact sexuel, suggérant que l’angle des plumes de la gorge et les cris d’offrande sont des marqueurs d’émotions positives. Dans une troisième étude, nous avons validé une procédure de dosage de la mésotocine, puis l’avons appliquée lors d’une situation de bain de poussière, un comportement de maintenance supposé positif. Les résultats ont montré une augmentation de la mésotocine après le bain de poussière, ce qui en fait un potentiel marqueur physiologique d’émotions positives. Cette thèse met en avant plusieurs potentiels indicateurs d’émotions positives chez la caille japonaise et contribue à une meilleure compréhension de ses capacités émotionnelles.
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Cancérologie
/ 24-02-2026
Brousse Susie
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Introduction – Le cancer du sein triple-négatif (CSTN) est un sous-type moléculaire moins fréquent mais plus agressif de cancer du sein que l’on retrouve notamment chez des patientes plus jeunes. S’il ne possède pas de cible thérapeutique spécifique, la découverte de sa forte immunogénicité a permis le développement de nouvelles thérapeutiques sous forme d’immunothérapie, y compris en situation néoadjuvante. Néanmoins, pour mieux comprendre et prédire la réponse aux traitements, une meilleure caractérisation immune est nécessaire. Méthodes – Après une caractérisation de 91 CSTN par cytométrie en flux (CMF), 19 de ces tumeurs ont été caractérisées par IHC multiplexe par technique Hyperion et 25 par analyse transcriptomique. En parallèle, un modèle murin a été développé tout comme une étude radiomique prospective. Résultats – Après caractérisation des sous-populations immunes par CMF, seuls les lymphocytes CD4+ (LT CD4+) Th2 avaient une valeur pronostique pour la survie sans récidive et globale, notamment plus forte que les TILs. Les tentatives de validations orthogonales ont permis de retrouver des valeurs de leucocytes CD45+, LT CD4+, voire CD 8+, corrélées en IHC et transcriptomique mais ont manqué de puissance pour que cela puisse être le cas pour les Th2. Par ailleurs, pour une meilleure corrélation aux schémas néoadjuvants actuels, un modèle murin a été créé permettant l’étude des sous-populations immunes et une analyse radiomique a été menée sur une cohorte prospective. Conclusion – Les LT CD4+ Th2 mesurés par CMF ont une valeur pronostique en adjuvant mais celle-ci, tout comme celle prédictive, restent à prouver en néoadjuvant par différentes techniques utilisables en pratique clinique.
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Électronique
/ 19-12-2025
Selmi Rafika
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Cette thèse de doctorat porte sur le développement d’une technologie de transfert de capteurs conçus pour être intégrés dans des environnements de géométrie ou de nature complexe. L’objectif est de maximiser leur conformabilité pour les reporter sur des surfaces 3D, et limiter leur intrusivité pour mesurer des paramètres physiques, de type température ou déformation au cœur des matériaux. La première partie de cette thèse explore le transfert de ces capteurs sur des objets aux formes complexes en utilisant la sérigraphie et optimisant la technologie pour garantir un report précis et fiable des capteurs. La seconde partie constitue une extension de cette approche, appliquée cette fois à des matériaux composites, en fibres de verre imprégnées d’époxy, par une méthode d’intégration directe des capteurs lors du processus de fabrication du composite. Cette stratégie a permis de suivre en temps réel la température et la déformation au cœur des matériaux, et a conduit, via une forte inclusion dans le matériau, à une amélioration significative des performances des capteurs développés : facteur de gauge amplifier de 15 à 30, surveillance précise de la température de composites et une sensibilité à l’humidité multipliée par 4,5. Les résultats ouvrent la voie à une approche innovante d’autosurveillance et de suivi du durcissement des composites, particulièrement prometteuse pour des applications industrielles.
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Doctorat de l'université de Rennes 1 spécialité sciences de gestion
/ 18-12-2025
Ahouangansi Mauriac
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Cette thèse analyse les transformations du conflit social dans un contexte où le droit de grève est unilatéralement restreint par le pouvoir politique. L’étude s’appuie sur le cas du secteur de la manutention portuaire au Bénin, où ce droit a été supprimé depuis 2018. Mobilisant la théorisation ancrée (Paillé) et croisant plusieurs cadres conceptuels le modèle Exit-Voice-Loyalty (Hirschman), la notion de grève froide inversée (Pélisse) et la théorie des coûts cachés (Savall et Zardet) la recherche met en lumière la recomposition des formes d’expression du conflit social. Ces tensions ne se manifestent plus par des actions collectives traditionnelles, mais plutôt par des comportements informels, un retrait stratégique et des tactiques subtiles d’évitement.
L’approche méthodologique est qualitative et interprétative, s’appuyant sur des entretiens, des observations de terrain et des documents internes, en cohérence avec la version Paillé de la théorie ancrée.
Le travail révèle une canalisation du conflit social par des mécanismes institutionnels et relationnels, aboutissant à une pacification apparente. Cependant, cette pacification dissimule une conflictualité réorientée, diffuse, et potentiellement coûteuse pour l’organisation.
En restituant ces signaux faibles de tension, cette thèse propose une lecture renouvelée des relations professionnelles en contexte contraint, et souligne la nécessité d’intégrer ces formes discrètes dans l’analyse du conflit au travail.
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Biologie moléculaire et structurale, biochimie
/ 18-12-2025
Touchais Gaël
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Les produits biocides jouent un rôle crucial dans la protection de la santé humaine et animale contre les agents biologiques pathogènes susceptibles de pénétrer dans la chaîne alimentaire. Les produits biocides, contenant une ou plusieurs substance(s) active(s), sont couramment utilisés dans la chaîne alimentaire pour diverses applications en tant que produits désinfectants, produits de protection et produits de lutte contre les organismes nuisibles. À ce jour, la présence de résidus de substance active biocide dans les denrées est très peu documentée. Quelques études font état de la présence de ces résidus dans les denrées dépassant dans certains cas les limites maximales de résidus (LMR) fixées pour ces substances. En raison des nombreux usages de ces produits dans la chaîne alimentaire, l'évaluation de la présence de ces résidus dans les denrées est loin d'être exhaustive. Il semble nécessaire de développer des stratégies analytiques permettant d’évaluer la contamination des denrées par les produits biocides. Récemment, de nouveaux outils et méthodologies analytiques utilisant la spectrométrie de masse à haut pouvoir résolutif (LC-HRMS) ont été utilisés dans le but d’explorer sans a priori l’espace chimique auquel nous sommes exposés quotidiennement. Ce projet de recherche s’inscrit dans ce contexte dans le but 1) d’identifier et prioriser les substances actives biocides utilisées dans la chaîne alimentaire, 2) d’évaluer la contamination des denrées d’origine animale par les produits biocides et 3) d’étudier le devenir d’un résidu de substance active biocide dans le lait de vache sous l’effet de la chaleur. Pour répondre à ces objectifs, une méthodologie de classement des risques a été utilisée pour prioriser les substances actives biocides utilisées dans la chaîne alimentaire pour les denrées d’origine animale. Une méthode analytique utilisant la LC-HRMS a été mise au point pour rechercher ces substances actives dans le muscle de poulet et le lait de vache afin d’évaluer la contamination de ces denrées par les produits biocides. Par ailleurs, des approches de screening semi-ciblé et non-ciblé ont été développés pour ouvrir le champ de détection à d’autres contaminants chimiques présents dans les denrées. L’applicabilité de la méthode a été réalisée sur une sélection de denrées provenant de diverses sources dans le commerce mais aussi lors d’un essai inter laboratoire organisé dans le cadre du projet PARC (WP4.3.4.b_Y2_F02). Pour finir, l’évaluation de l’exposition aux substances chimiques se concentre généralement sur le composé en lui-même ignorant l’impact des procédés industriels (chauffage, congélation) pouvant générer des produits de transformation. L’effet de ces procédés peut induire une modification par transformation ou dégradation de l’état structurel des composés parents et donc de générer de nouveaux contaminants indésirables encore inconnus. Cette étude a permis d’étudier le devenir de l’AMPD dans le lait de vache suite à un traitement thermique. L’analyse ciblée utilisant la LC-MS/MS a permis d’observer un abattement de concentration en AMPD avant et après chauffage. Cet abattement de concentration serait à l’origine d’un produit de transformation observé lors d’analyse non-ciblée menée en LC-HRMS.
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Archéologie
/ 18-12-2025
Faye Abdoul Kader
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En Sénégambie, les milliers de monuments funéraires dispersés sur le territoire ont attiré depuis l’aube du XXe siècle, des amateurs aux chercheurs les plus reconnus aujourd’hui. Cette évolution des acteurs dans la recherche s’est accompagnée d’une approche méthodologique qui a elle aussi beaucoup évolué sur beaucoup de points. C’est dans le sillage de ce changement de paradigme, impulsé par la Mission SEPSEN notamment dans la nécropole mégalithique de Wanar, que s’est inscrite cette recherche doctorale. Dans une approche archéologique qui s’adapte au contexte africain, nous avons convoqué les sources matérielles et la tradition orale encore vivante sur place, le tout, dans une perspective de complémentarité, pour une contribution objective dans la compréhension des ruines funéraires monumentales actuelles de la Sénégambie.
Ce travail de thèse illustre encore plus la complexité des pratiques funéraires monumentales sénégambiennes. La présence de « maison » construite en contexte funéraire s’y précise. Cette pratique montre notamment une convergence des données archéologiques et celles ethnographiques. Elle révèle en outre, une certaine conception qui pouvait être faite de la mort au sein des sociétés sénégambiennes. Un façonnage de la mort qui a alimenté en vestiges d’architectures distinctes, des paysages et dont l’analyse archéologique nous a permis au moins, de se rapprocher des dispositifs d’origine.
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Sciences économiques
/ 18-12-2025
Thélissaint Josué
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Les marchés actions et obligataires mondiaux offrent un mécanisme éprouvé d’allocation des ressources financières à l’échelle planétaire. Ce vaste réseau permet aux différents agents de satisfaire leurs besoins de financement et d’investissement dans une logique qui soutient la productivité et s’exerce en toute confiance. La finance décentralisée aspire à une notoriété et une adoption comparables, ce qui exige un effort partagé visant à établir la nature de ses fondements, les cryptomonnaies initiant un système monétaire et financier alternatif. Comprendre les interconnexions et construire une base de connaissances solide sur les fondamentaux des prix et sur les forces qui régissent les anticipations et la dynamique du risque dans les cryptomonnaies est indispensable : c’est là la contribution que cette thèse entend apporter. L’efficience informationnelle constitue une question centrale, car le prix d’un actif est un vecteur d’information essentiel à la décision financière. Lorsqu’il devient peu fiable, il engendre de l’ambiguïté et impose un constant réajustement, générant un coût économique, financier et cognitif. L’information que le prix est censé refléter concerne avant tout les risques. L’étude s’attache également aux interdépendances, afin de mettre en évidence les vases communicants qui servent de leviers à la systémisation des perturbations initialement localisées. Chaque manquement ou défaillance a des implications lourdes, que l’on met en évidence tout en instruisant une orientation de dépassement.
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Biologie cellulaire, biologie du développement
/ 16-12-2025
Guillouzouic Joan
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L’exposition aux polluants environnementaux tels que les hydrocarbures aromatiques polycycliques (HAP) constitue un enjeu majeur de santé publique. Parmi eux, le Benzo[a]Pyrène (B[a]P), considéré comme le prototype de ces composés, est le seul HAP classé cancérigène avéré. Cette thèse visait à explorer les réponses cellulaires de la lignée endothéliale humaine HMEC-1 exposée à une concentration réaliste de B[a]P. Les résultats montrent qu’à cette dose, le B[a]P perturbe l’homéostasie mitochondriale sans induire immédiatement la mort cellulaire. Il déclenche une phase transitoire d’élongation mitochondriale et de surproduction d’ATP, caractéristiques du phénomène de Stress-Induced Mitochondrial Hyperfusion (SIMH), mécanisme adaptatif de résistance, possiblement régulé par le facteur de transcription NRF2. La seconde partie du travail révèle que les cellules HMEC-1 sécrètent physiologiquement des vésicules extracellulaires (VE) contenant des mitochondries entières (Mito-VE), dont la sécrétion est amplifiée par le B[a]P. Cette induction des Mito-VE est possiblement liée à l’élimination des mitochondries altérées, un processus appelé mitophagie sécrétoire. Par ailleurs, deux sous-populations de Mito-VE ont été identifiées, renfermant respectivement des mitochondries polarisées ou dépolarisées et régulées différemment par un mécanisme dépendant du récepteur P2X7 (rP2X7). Enfin, les VE produites par les cellules HMEC-1 contiennent et produisent de l’ATP, suggérant une boucle autocrine ATP/rP2X7 pouvant renforcer leur biogenèse, mais aussi promouvoir une réponse pro-inflammatoire. Ces résultats révèlent la dynamique mitochondriale et la libération de Mito-VE comme des marqueurs précoces du stress endothélial induit par le B[a]P, reliant le contrôle de qualité mitochondriale, la communication intercellulaire et la vectorisation de la toxicité des polluants via les VE.
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Automatique, productique et robotique
/ 16-12-2025
Gavilán Rojas Alvaro
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Dans cette thèse, nous nous intéressons à la simulation du contrôle non destructif (CND) par ondes guidées, méthode utilisée pour évaluer l’état d’intégrité des structures élancées –appelées guides d’ondes– tels que pipelines et rails. Le travail porte d’abord sur la modélisation et la simulation de la propagation des ondes guidées dans des guides 1D-périodiques ainsi que leur interaction avec les défauts, et repose sur la méthode des éléments finis ondulatoires, avec des stratégies de réduction de modèle par approches modales, ondulatoires et paramétriques. Une seconde partie du travail porte sur la caractérisation expérimentale de ces ondes guidées et s’appuie sur des mesures par déflectométrie optique et vibrométrie laser, tandis que l’identification des propriétés des ondes est basée sur des méthodes de sous-espaces. Ces approches ont pour but d’entraîner par données synthétiques des réseaux de neurones artificiels pour la reconnaissance automatique de défauts tels que la corrosion des pipelines.
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