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Testicule humain et virus émergents : étude de l’infection par le virus chikungunya et analyse de cellules testiculaires sentinelles


Microbiologie, virologie, parasitologie / 16-10-2025
Cartron Matéo
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Le testicule humain, en tant que site immuno-privilégié, est susceptible d’abriter certains virus bien au-delà de leur élimination systémique. Cette capacité à constituer un réservoir viral, en particulier pour des virus émergents tels que Zika (ZIKV), soulève d’importantes questions en santé publique, notamment en lien avec la transmission sexuelle. Si certains virus, comme le virus des oreillons, déclenchent une réponse inflammatoire aiguë associée à une clairance virale, d’autres comme le ZIKV persistent silencieusement dans les cellules germinales, contribuant à une excrétion prolongée dans le sperme. Dans ce contexte, mon projet de thèse a eu pour objectif d’étudier les interactions entre virus émergents et testicule humain à travers trois axes principaux :(i) l’infection testiculaire par CHIKV dont l’excrétion séminale prolongée a été récemment observée ; (ii) l’exploration des populations immunitaires gonadiques au cours de la vie; (iii) la caractérisation des réponses immunitaires innées des cellules myoïdes péritubulaires (PMCs). J’ai démontré pour la première fois la capacité du CHIKV à infecter le testicule humain ex vivo ainsi que le testicule simien in vivo, avec un tropisme marqué pour les PMCs. En culture, ces cellules se sont révélées fortement permissives à l’infection, contrairement aux cellules germinales non permissives. L’impact de l’infection sur les PMCs suggère un possible effet délétère de l’infection par le CHIKV sur l’homéostasie testiculaire et la fertilité. J’ai également établi un atlas des populations immunitaires gonadiques humaines à partir de données de transcriptomique unicellulaire, identifiant des populations hétérogènes de macrophages dans les gonades. Ces résultats forment un socle indispensable à la caractérisation de leurs fonctions lors d’une infection virale. Enfin, j’ai mis en évidence le rôle de sentinelles des PMCs dans le testicule. Leurs réponses immunes innées différentielles selon les virus et les voies de PRR activées (RIG-I/MDA5/TLR3, TLR2/6, STING) pourraient contribuer à orienter l’issue des infections virales du testicule vers la clairance ou la persistance. Dans l’ensemble, mes travaux apportent un éclairage nouveau sur le tropisme de virus émergents pour le testicule et sur la réponse des cellules testiculaires face à ces infections. Ils ouvrent notamment la voie à des investigations dans des cohortes de patients afin de déterminer l’impact de l’infection CHIKV sur la fertilité masculine. Ils soulignent également la spécificité fonctionnelle des PMCs, et offrent des pistes pour mieux comprendre les mécanismes qui sous-tendent la persistance ou l’élimination virale dans le testicule humain. Ces données sont importantes pour mieux comprendre, anticiper et prévenir les risques liés aux infections virales testiculaires.

Hétérostructures diélectriques-ferroélectriques en couches minces pour dispositifs hyperfréquences reconfigurables à faible impact visuel


Électronique / 14-10-2025
Chaslin Edgar
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Ces travaux portent sur l’élaboration par pulvérisation cathodique RF de couches minces ferroélectriques destinées à des dispositifs hyperfréquences reconfigurables et optiquement transparents. L’étude a d’abord porté sur BaTiO3, dont les performances diélectriques limitées ont conduit à se focaliser sur Ba0,7Sr0,3TiO3 (BSTO). L’optimisation des paramètres de dépôt et l’utilisation de recuits ex-situ ont permis l'élaboration de films accordables agiles en fréquence (A = 8,8%). L’intégration de couches tampon (CeO2, MgO, MgAl2O4) entre le substrat de saphir et la couche ferroélectrique BSTO a permis d'améliorer encore la qualité cristalline et les caractéristiques diélectriques, MgO apparaissant comme la meilleure solution (A = 15,6%). Le dopage au cérium (0,6% molaire) de la couche de BSTO a ensuite permis d’atteindre des performances record, avec une accordabilité A = 20,6% à 10 GHz. Ces hétérostructures diélectriques-ferroélectriques optimisées ont été intégrées dans une antenne boucle à fente micro-maillées (66% de transparence optique), validant la reconfigurabilité en fréquence (ΔF = 250 MHz) à 20 GHz. Ces travaux confirment ainsi le potentiel des couches minces ferroélectriques pour concevoir des dispositifs optiquement transparents et reconfigurables en hyperfréquences.

Géométrisation des matériaux présentant deux échelles caractéristiques


Mathématiques et leurs interactions / 01-10-2025
Crespo Mewen
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Ce manuscrit construit un modèle géométriquement exact de matériau micro-structuré en généralisant la notion de variétés de Riemann--Cartan. Le modèle repose sur l'interaction de deux échelles: une échelle macroscopique et une échelle microscopique. Leur couplage engendre des phénomènes émergents tels que les dislocations (torsion) et les disclinaisons (courbure). Le placement est décrit par un morphisme de fibrés du premier ordre F entre le corps micro-structuré B et l'espace ambiant micro-structuré E, permettant de tirer en arrière la géométrie de Riemann--Cartan de E sur B. Afin de permettre l'apparition de courbure, F n'est en général pas le gradient d'un placement ponctuel. Au cœur du modèle se trouve la notion nouvelle de pseudo-métrique qui, pour une structure microscopique linéaire, fournit simultanément une métrique macroscopique (analogue au tenseur de Cauchy--Green), une métrique microscopique, une forme de soudure couplant les deux échelles et une connexion (potentiellement affine). Une notion d'objectivité (isotropie de l'espace) est formalisée et les invariants associés sont calculés. Via le calcul variationnel, les équations d'Euler-Lagrange sont obtenues en dynamique et en statique. En découlent, dans le cas linéarisé, des EDPs de type Helmholtz reliant courbure et torsion, illustrées par des simulations numériques. Enfin, le modèle est appliqué à la mécanique des poutres élancées. Les modèles classiques de Timoshenko et d'Euler--Bernoulli apparaissent comme cas particuliers et une nouvelle famille continue de modèles obtenus par homogénéisations est proposée.

Verres de chalcogénures dopés terres rares : sources et capteurs environnementaux dans le moyen IR


Sciences des matériaux / 23-09-2025
Ghanawi Taghrid
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Les gammes spectrales du proche et du moyen infrarouge représentent deux domaines clés du spectre électromagnétique, en plein essor technologique. Le proche infrarouge (NIR/SWIR) est particulièrement intéressant pour l’imagerie active, car il permet une observation fiable même en conditions de faible luminosité ou d’obscurité totale, un atout majeur pour les secteurs de la sécurité et de la défense. Toutefois, l’imagerie active nécessite des sources lumineuses à la fois puissantes et à forte luminance, ce que les sources actuelles ne parviennent pas toujours à satisfaire pleinement. Les concentrateurs de lumière offrent une solution particulière permettant la redirection de l’émission spontanée dans une direction préférentielle, répondant ainsi aux contraintes de puissance et de luminance requises par l’imagerie active. Dans cette optique, les verres de chalcogénures dopés aux ions de terres rares se positionnent idéalement. Un deuxième axe majeur de cette thèse concerne le développement de sources moyen infrarouge intégrées sur silicium, également à base de verres de chalcogénures dopés aux ions de terres rares. L’une des applications clés de cette technonlogie concerne les capteurs moyen infrarouge qui permettent un accès direct aux bandes d’absorption fondamentales, ce qui rend possible la détection de faibles concentrations de diverses substances avec une grande spécificité et une interférence minimale. Les plateformes photoniques sur silicium comptent parmi les technologies les plus largement utilisées en photonique intégrée. Les approches actuellement développées pour cette intégration atteignent leurs limites dans le moyen infrarouge. Ainsi, l’intégration des verres de chalcogénures dopés terres rares sur silicium permettrait de relever les défis actuels liés aux sources moyen infrarouge intégrées, en raison de leur large transparence dans le moyen infrarouge et de leur faible énergie de phonon.

L’éternelle simplification de la politique de cohésion de l’UE : Les causes et effets de la perception de la lourdeur administrative en Auvergne Rhône-Alpes


Doctorat de l'université de Rennes spécialité science politique / 22-09-2025
Gal Fabian
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Cette thèse analyse les causes et les effets de la perception de lourdeur administrative dans la mise en œuvre de la politique de cohésion de l’Union européenne, à partir d’une enquête conduite en Auvergne Rhône-Alpes. En mobilisant une approche comportementale et une méthodologie mixte croisant données qualitatives et quantitatives, elle montre que cette perception ne résulte pas uniquement d’une charge administrative objective, mais se construit progressivement tout au long du cycle de la politique publique : depuis sa formulation, en passant par sa mise en œuvre, jusqu’à sa réception par les bénéficiaires. Malgré l’ambition affichée de simplification, des exigences rigides inscrites dans le cadre réglementaire, combinées à certaines dynamiques de mise en œuvre, engendrent des situations d’ambiguïté, une charge administrative élevée pour les porteurs de projet et des délais importants dans l’instruction et le paiement des subventions. L’analyse de la variabilité de cette perception permet d’éclairer les facteurs qui y contribuent, en fonction des caractéristiques des bénéficiaires, du contexte institutionnel et de la nature des projets financés. La lourdeur administrative n’est pas sans conséquences : elle tend à renforcer les inégalités d’accès, à affaiblir l’utilité perçue des fonds européens et à fragiliser la capacité de mise en œuvre des porteurs. En restituant l’expérience des bénéficiaires, cette thèse propose une lecture renouvelée des tensions à l’œuvre dans la mise en œuvre d’une politique publique européenne.

Exposition aux substances per- et polyfluoroalkylées (PFAS) et santé cardiométabolique des préadolescents


Épidémiologie, analyse de risque, recherche clinique / 18-09-2025
Lejeune Naomi
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Cette thèse s’intéresse aux effets des substances per- et polyfluoroalkylées (PFAS) sur la santé cardiométabolique des enfants, à partir de la cohorte mère-enfant PELAGIE. Trois études ont été menées à partir de données cliniques recueillies à l’âge de 12 ans, combinant des mesures d’exposition aux PFAS à deux périodes sensibles : la période prénatale et la période péripubertaire. L’analyse porte sur un large panel d’indicateurs cardiométaboliques et hépatiques : données anthropométriques, marqueurs lipidiques, glycémiques, hormonaux et enzymes hépatiques. Les résultats révèlent des associations différenciées selon le sexe, le statut pubertaire et le moment de l’exposition. Chez les filles post-ménarche, certaines expositions prénatales sont associées à des profils métaboliques plus favorables, tandis que des profils plus défavorables sont observés chez les filles préménarches et les garçons prépubères. Enfin, l’étude hépatique met en évidence une sensibilité particulière du foie aux PFAS, avec des réponses divergentes selon le sexe. Ces travaux soulignent l'importance d’étudier les effets des expositions environnementales précoces sur la santé des enfants, en tenant compte du moment de l’exposition et des caractéristiques développementales.

Élaboration de coques de nanoparticules d'or par voie émulsion : vers des nanorésonateurs plasmoniques


Sciences des matériaux / 11-07-2025
Nour Mahamoud Mouktar
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Cette thèse investigue le potentiel de l'auto-assemblage de nanoparticules d'or (AuNPs) par l'effet Ouzo afin de concevoir des nanorésonateurs plasmoniques aux interactions optiques optimisées. Les structures obtenues, des nanocoques sphériques d'AuNPs, présentent une interaction amplifiée avec les composantes électrique et magnétique de la lumière, ouvrant ainsi des perspectives pour la conception de métamatériaux et métasurfaces fonctionnelles. L'objectif central de cette étude est d'élaborer des architectures de résonateurs optiques exprimant du magnétisme optique, via une méthode d'assemblage colloïdale simple. Après une analyse approfondie des émulsions Ouzo formulées avec différentes conditions (mélange par vortex ou par mélangeurs rapides) et trajectoires de mélange, différentes stratégies d'échange de ligands et de formulation des nanocoques ont été examinées. La thèse se concentre sur l’étude des paramètres moléculaires du système ouzo et des nanoparticules d’or ainsi que sur le procédé pour la fabrication de nanocapsules hybrides d'or-polymère. Finalement, les propriétés optiques des nanocoques sont étudiées par diffusion statique de lumière polarisée. Les résultats mettent en évidence l'importance des paramètres expérimentaux dans la formulation et la stabilisation des nanocoques et suggèrent des voies d'amélioration pour leur structuration et leur assemblage en métasurfaces. Des perspectives sont également envisagées, notamment l'extension de l'effet Ouzo à des concentrations plus élevées pour des applications en formulation pharmaceutique, ainsi que le développement de stratégies de stabilisation mécanique des nanocoques pour leur intégration dans des dispositifs photoniques avancés.

Cristaux liquides photoactifs en optique non-linéaire pour le stockage d’information


Chimie moléculaire et macromoléculaire / 11-07-2025
Nicolas Prescillia
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Dans le contexte actuel du développement de dispositifs de mémoire optique à haute densité, les matériaux combinant bonnes propriétés mésogènes, activité en optique non-linéaire et réactivité photo-induite présentent un potentiel considérable. Ce travail de thèse s’inscrit dans cette thématique en explorant de explorant de nouveaux systèmes à base de cristaux liquides photoactifs visant le contrôle spatio-temporel des propriétés optique non-linéaire, telle que la génération de seconde harmonique. Ces matériaux permettent notamment d’envisager des dispositifs de stockage d’information en trois dimensions, basés sur une écriture réversible par absorption à deux photons (2PA) et une lecture non destructive par microscopie SHG. L’approche développée repose sur la conception de chromophores multipolaires intégrant des cœurs bipyrimidine ou pyrimidine fonctionnalisés par des unités pro-mésogènes et des entités photodimérisables. L’étude des propriétés thermiques, d’optique linéaire et non-linéaire, ainsi que des processus de photodimérisation des différents composés ciblés a permis d’identifier les relations structure/propriété clés pour atteindre les objectifs du projet. Enfin, cette étude a permis de mieux comprendre les mécanismes impliqués dans la modulation de la réponse SHG au sein de matrices cristal liquide pour concevoir des matériaux de nouvelle génération adaptés au stockage optique 3D.

Prise en charge de l’asthme de l’enfant de moins de 6 ans : pertinence d’un support pédagogique pour le médecin généraliste


Médecine / 10-07-2025
Drouet Marine
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INTRODUCTION : L’asthme de l’enfant de moins de 6 ans constitue une pathologie fréquente et parfois difficile à aborder en médecine générale. Malgré un rôle central dans le suivi, le médecin généraliste dispose de peu d’outils adaptés à sa pratique pour accompagner les familles dans la gestion quotidienne de la maladie. Les plans d’action écrits, bien qu’ils soient recommandés, restent peu utilisés et ne répondent pas toujours aux besoins de la consultation de premier recours. Les facteurs qui favoriseraient leur utilisation sont encore insuffisamment étudiés. Dans ce contexte, cette étude explore l’intérêt d’un support pédagogique conçu pour s’intégrer concrètement à la pratique du généraliste. MÉTHODE : Une étude qualitative a été menée auprès de médecins généralistes en Bretagne, après plusieurs mois d’utilisation d’un support conçu pour la prise en charge de l’asthme chez les enfants de moins de 6 ans. Les données issues d’entretiens semi-dirigés ont été analysées par une méthode thématique mixte, combinant une approche déductive et inductive. RÉSULTATS : Quatre grands axes ont émergé : les apports du support pédagogique, les freins à son utilisation, les leviers facilitant son intégration et les pistes d’amélioration envisagées. Ces résultats mettent en évidence des effets positifs sur l’organisation de la consultation, la communication avec les parents et leur engagement dans la prise en charge, tout en soulignant les conditions nécessaires à une appropriation durable de l’outil. CONCLUSION : Cette étude suggère qu’un support pédagogique adapté à la médecine générale peut être pertinent pour structurer la consultation, renforcer l’explication thérapeutique et favoriser l’implication des parents. Ce travail constitue une première étape et appelle une phase de validation de l’outil. Par ailleurs, une évaluation centrée sur les parents permettrait de mieux cerner l’impact du support sur leur compréhension, leur adhésion au traitement et leur participation au suivi de l’asthme.

Carcinome rénal de la famille MiTF/TFE : un groupe de tumeurs de profil histologique et moléculaire très hétérogène : à propos d'une cohorte rétrospective de 60 cas issus du CHU de Rennes et du réseau INCa CARARE.


Anatomie et Cytologie Pathologiques / 10-07-2025
Roué Clémence
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Contexte : Les carcinomes rénaux (RCC) représentent 2% des cancers avec une incidence en hausse mais une mortalité relativement stable. Le carcinome rénal à cellules claires (ccRCC) est le plus fréquent, mais d’autres sous-types, notamment les RCC avec altérations moléculaires comme les TFE3 RCC et TFEB RCC, ont été introduits progressivement dans les classifications OMS depuis 2004. État des lieux : Le diagnostic des TFE3 RCC et TFEB RCC peut être complexe, du fait de leur hétérogénéité morphologique et de leur ressemblance avec d'autres types de RCC comme les ccRCC ou les pRCC, rendant leur diagnostic difficile sans outils spécifiques comme l’immunohistochimie ou la FISH. De plus, en situation métastatique, ces tumeurs ne présentent pas de recommandations thérapeutiques officielles. Dans ce contexte, l’étude du micro-environnement tumoral, en particulier angiogénique et immunitaire, permettrait d’identifier des cibles thérapeutiques potentielles, notamment pour orienter vers des traitements anti-angiogéniques ou une immunothérapie. Étude : Cette étude rétrospective incluait 60 cas (31 TFE3 RCC et 29 TFEB RCC) issus du CHU de Rennes et du réseau national CARARE. Elle visait à déterminer leurs caractéristiques histologiques et leur micro-environnement tumoral. Concernant l’aspect morphologique, les TFE3 RCC montraient une architecture très hétérogène, majoritairement mixte, avec la présence fréquente de calcifications et un phénotype cellulaire mixte (cellules claires et éosinophiles). Les TFEB RCC présentaient une architecture mixte ou solide, des cellules principalement éosinophiles, et une nécrose tumorale plus fréquente. En ce qui concerne le micro-environnement tumoral, la majorité des cas présentait une architecture vasculaire mixte. Toutefois, seuls les TFE3 RCC montraient parfois un phénotype hautement angiogénique (vaisseaux courts, fins, peu ramifiés), suggérant une sensibilité possible aux thérapies anti-angiogéniques. Aucun TFEB RCC ne présentait ce profil. Sur le plan immunitaire, les scores CPS et TPS moyens étaient relativement élevés dans les deux sous-types, avec des scores moyens plus élevés dans les TFEB RCC. Ces résultats soulignent que les TFEB RCC présentent un profil plutôt immunitaire, et les TFE3 RCC un profil plus hétérogène, avec des implications thérapeutiques potentielles. Cette étude met en évidence la nécessité d’une prise en charge personnalisée, fondée sur les caractéristiques morphologiques, immunohistochimiques et sur le micro-environnement de chaque tumeur.

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