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<title>Toutes les thèses  > Coquet Jean</title>












	

	<description>Auteurs</description>




<link>https://syntheses.univ-rennes1.fr/search-theses/</link>
<pubDate>Sun, 15 Mar 2026 17:24:31 GMT</pubDate>














        
                <item>

                        
                        
                        
                                                
                                                

                                                
                                                

                                                

                                        
                                                
                                                                
                                                                        
                                                                        
                                                                        
                                                                        
                                                                        
                                                                        
                                                                        
                                                                
                                                
                                                
                                                        <title>Étude exhaustive de voies de signalisation de grande taille par clustering des trajectoires et caractérisation par analyse sémantique</title>
                                                
                                        
                                        



                                                
                            
                                                        
                                                
                                                
                                        

                                        
                                                
                                                
                                        
                                        

                                
                                                
                                                

                                                
                                                

                                                

                                        
                                                
                                                
                                        
                                        



                                                
                            
                                                        
                                                
                                                
                                        

                                        
                                                
                                                        
                                                                
                                                                
                                                                
                                                                        

                                                                                
                                                                                        
                                                                                        
                                                                                
                                                                        

                                                                        

                                                                
                                                        
                                                                
                                                                
                                                                
                                                                        

                                                                                
                                                                                        
                                                                                        
                                                                                
                                                                        

                                                                        

                                                                
                                                        
                                                
                                                
                                                        <description>Les voies de signalisation décrivent les réponses d&#039;une cellule à des stimuli externes. Elles sont primordiales dans les processus biologiques tels que la différentiation, la prolifération ou encore l&#039;apoptose. La biologie des systèmes tentent d&#039;étudier ces voies de façon exhaustive à partir de modèles statistiques ou dynamiques. Le nombre de solutions expliquant un phénomène biologique (par exemple la réaction d&#039;une cellule à un stimulus) peut être très élevé dans le cas de grands modèles. Cette thèse propose, dans un premier temps, différentes stratégies de regroupement de ces solutions à partir de méthodes de clustering et d&#039;analyse de concepts formels. Puis elle présente la caractérisation de ces regroupements à partir de web sémantique. Ces stratégies ont été appliquées au réseau de signalisation du TGF-beta, un stimulus extra-cellulaire jouant un rôle important dans le développement du cancer, ce qui a permis d&#039;identifier cinq grands groupes de trajectoires participant chacun à des processus biologiques différents. Dans un second temps, cette thèse se confronte au problème de conversion des données hétérogènes provenant de différentes bases dans un formalisme unique afin de pouvoir généraliser l&#039;étude précédente. Elle propose une stratégie permettant de regrouper les différents réseaux de signalisation provenant d&#039;une base de données en un modèle unique et ainsi permettant de calculer toutes les trajectoires de signalisation d&#039;un stimulus.</description>
                                                
                                        
                                        

                                
                                                
                                                

                                                
                                                        
                                                                
                                                                
                                                                
                                                                        
                                                                        
                                                                        
                                                                
                                                        
                                                                
                                                                
                                                                
                                                                        
                                                                        
                                                                        
                                                                
                                                        
                                                                
                                                                
                                                                
                                                                        
                                                                        
                                                                        
                                                                
                                                        
                                                
                                                
                                                        <author>Coquet Jean</author>
                                                

                                                

                                        
                                                
                                                
                                        
                                        



                                                
                            
                                                        
                                                
                                                
                                        

                                        
                                                
                                                
                                        
                                        

                                
                                                
                                                

                                                
                                                

                                                

                                        
                                                
                                                
                                        
                                        



                                                
                            
                                                        
                                                
                                                
                                        

                                        
                                                
                                                
                                        
                                        

                                
                                                
                                                

                                                
                                                

                                                

                                        
                                                
                                                
                                        
                                        



                                                
                            
                                                        
                                                
                                                
                                        

                                        
                                                
                                                
                                        
                                        

                                
                                                
                                                

                                                
                                                

                                                

                                        
                                                
                                                
                                        
                                        



                                                
                            
                                                                
                                                                        
                                    
                                                
                                            
                                                                                
                                                
                                                
                                                                
                                                        
                                                        
                                                                <pubDate>Tue, 19 Dec 2017 23:00:00 GMT</pubDate>
                                                        
                                                
                                                
                                        

                                        
                                                
                                                
                                        
                                        

                                
                                                
                                                

                                                
                                                

                                                

                                        
                                                
                                                
                                        
                                        



                                                
                            
                                                        
                                                
                                                
                                        

                                        
                                                
                                                
                                        
                                        

                                
                                                
                                                

                                                
                                                

                                                

                                        
                                                
                                                
                                        
                                        



                                                
                            
                                                        
                                                
                                                
                                        

                                        
                                                
                                                
                                        
                                        

                                

                        
                        

                        
                        
                                
                                
                                        
                                
                        
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