Les cellules T invariantes associées aux muqueuses (MAIT) sont des lymphocytes T non conventionnels exprimant un TCR invariant spécifique de ligands dérivés du microbiote et notamment du métabolisme de la riboflavine (5-OP/OE-RU). Les MAIT s'accumulent progressivement au cours de l'enfance pour devenir très abondants chez l'adulte, cependant les mécanismes sous-jacents ne sont pas compris. Dans cette thèse, nous explorons dans le modèle souris le rôle du microbiote et de l'exposition aux pathogènes dans le développement et l'accumulation des MAIT. L'exposition aux pathogènes ne semble pas impacter la fréquence des MAIT. En revanche les MAIT s'accumulent avec le temps chez les souris hébergées dans des conditions sans pathogènes. Cette accumulation est abrogée chez les souris axéniques et restaurée par mono-colonisation avec Escherichia coli, qui produit le 5-OP/OE-RU. Le 5-OP-RU, constamment produit par les bactéries intestinales, traverse la barrière intestinale en moins d'une minute et circule dans le sang sous forme libre. Nos données suggèrent que l'abondance des lymphocytes MAIT est contrôlée par le 5-OP-RU dérivé du microbiote.