Université de Rennes 1 The clonal plant microbiota : assembly rules, heritability and influence on host phenotype Le microbiote des plantes clonales : règles d'assemblage, héritabilité et influence sur le phénotype de l'hôte Plantes clonalesMicrobioteChampignons Mycorhiziens à ArbusculesHolobiontInteractions plante-planteAssemblage des communautés Clonal plantsMicrobiotaArbuscular Mycorrhizal FungiHolobiontPlant-plant interactionsCommunity assembly Microflore Thèses et écrits académiques Mycorhizes Thèses et écrits académiques Relations plante-microorganisme Thèses et écrits académiques Assemblage des communautés (écologie) Thèses et écrits académiques Plantes -- Adaptation Thèses et écrits académiques Les plantes vivent en association avec une grande diversité de microorganismes qui forment son microbiota. Ce microbiote fournit des fonctions clés qui influencent tous les aspects de la vie d'une plante, de l'établissement à la croissance jusqu'à la production. Cette thèse a pour intention de déterminer les règlent d'assemblage du microbiote et ses conséquences pour le phénotypel l'adaptation et l'évolution des plantes. Pour atteindre cet objectif nous avont utilisé différentes approches expérimentales comprenant des plantes clonales comme organismes modèles ainsi que des mésocosmes prairiaux pour analyses à l'échelle des communautés. Nos résultats ont démontré i) que les Champignons Mycohiziens à Arbuscules induisent d'important es variations phénotypiques pour les traits des plantes clonales impliqués dans l'exploration de l'espace et l'exploitation des ressources. Ces changements dépendent de l'identité des symbiontes et altèrent les capacités des plantes à développer des réponses plastiques à l'hétérogénéité environnementale. ii) Les plantes ont évolué un méchanisme permettant la transmission d'une partie de leur microbiote a leur descendance, assurant la qualité de leur habitat. iii) Le contexte spécifique des communautés de plantes est un facteur majeur structurant l'assemblage du microbiota des plantes à échelle locale. L'abondance de certaines espèces de plante dans le voisinage d'une plante cible augmente ou diminue la diversité de son microbiote, déterminant in fine ses performances. De manière générale, cette thèse démontre l'importance des organismes symbiotiques dans la compréhension de l'adaptation et de l'évolution des plantes. Plants live in association with a wide diversity of microorganisms forming the microbiota. The plant microbiota provides a variety of key functions that influence many aspects of plant's life comprising establishment, growth and reproduction. The present thesis aims at determining the assembly rules of the plant microbiota and its consequences for plant phenotype, adaptation and evolution. To fulfill this objective, we used different experimental approaches using either clonal plants as model organisms or grassland mesocosms for community-wide analyses. Our results demonstrated i) that Arbuscular Mycorrhizal Fungi induce important phenotypic variations in clonal plants traits involved in space exploration and resources exploitation. These changes depended on the identity of the symbionts and altered the plants ability to produce plastic responses to environmental heterogeneity. ii) Plants have evolved a mechanism allowing the transmission of a part of their microbiota to their progeny, ensuring thus their habitat quality. iii) The plant community context is a major factor structuring local plant microbiota assembly. Particular plant species identity in the neighborhood increase or decrease the microbiota diversity and ultimately determine the focal plant performance. This thesis overall demonstrates the importance of symbiotic microorganisms in the understanding of the plant adaptation and evolution. From the knowledges acquired we developed a novel understanding of symbiotic interactions in clonal plants by extending the holobiont theory to the meta-holobiont theory. Electronic Thesis or DissertationText en application/x-zip-compressed1 : 5430 Kohttps://ecm.univ-rennes1.fr/nuxeo/site/esupversions/969deccd-9a18-4582-ae62-879bf7e820dd Vannier Nathan 1991-06-13 FR 225437635 nathan.vannier35@gmail.com 2017REN1B027 http://www.theses.fr/2017REN1B027 2017-10-23 Biologie Universite de Rennes 1thesis.degree.grantor_1 02778715X Doctorat non ouiVandenkoornhuysePhilippeintervenant_1122542215MonyCendrineintervenant_2144309866BittebiereAnne-Kristelintervenant_3163517363 EGAALecoleDoctorale_1 221491066 Universite Bretagne LoirepartenaireRecherche_1 191639044 Ecobio partenaireRecherche_2 151300046 ddc:570 VandenkoornhuysePhilippeMonyCendrineBittebiereAnne-KristelUniversite de Rennes 1Sciences et technologie, medecine, pharmacie, odontologie, droit, economie, gestion, philosophieEGAALUniversite Bretagne Loire Communaute des etablissements d enseignement superieur et de recherche (ComuE) Ecobio ASCII PDF 5560448