SCD-Universite de Rennes 1 Analyses de lichens par spectrométrie de masse : déréplication et histolocalisation Mass spectrometric analyses of lichens: from dereplication to histolocalization Pharmacognosie Chimie Analytique Lichens Spectrométrie de masse DART-MS LDI-MS Spectroscopie RMN Pharmacognosy Analytical Chemistry Lichens Mass Spectrometry DART-MS LDI-MS NMR Spectroscopy Pharmacognosie Thèses et écrits académiques Lichens Thèses et écrits académiques Chimie analytique Thèses et écrits académiques Spectroscopie de masse Thèses et écrits académiques Spectroscopie de la résonance magnétique nucléaire Thèses et écrits académiques Les lichens, organismes symbiotiques associant un champignon et un partenaire photosynthétique (algue verte et/ou cyanobactérie), sont caractérisés par la biosynthèse de métabolites secondaires uniques dotés de bioactivités variées. Pour valoriser au mieux cette ressource privilégiée, des méthodes innovantes de spectrométrie de masse ont été développées dans le but de minimiser la préparation de l’échantillon et la durée des analyses. Deux techniques de spectrométrie de masse ont été évaluées en ce sens : le DART-MS et le LDI-MS. L’apport de chacune de ces deux méthodes a pu être établi sur un large panel de lichens, représentant une part importante de l’espace chimique couvert par ces organismes. Il a été démontré que des profils chimiques complets pouvaient être obtenus respectivement à partir de thalles lichéniques et d’extraits acétoniques totaux. Compte tenu de la très large utilisation de la CCM pour l’analyse chimique de lichens, les possibilités offertes par le couplage de la CCM à l’ionisation electrospray ont également été explorées. Une seconde partie de ces travaux avait pour but de cartographier la distribution des métabolites secondaires au sein du thalle lichénique. À ces fins, des analyses d’imagerie LDI ont été réalisées sur une coupe transversale d’un lichen crustacé modèle : Ophioparma ventosa. Ce lichen a été étudié en phytochimie pour identifier six napthopyranones à partir des apothécies dont quatre nouvelles structures. Les principaux métabolites de ce lichen ont pu être imagés par LDI-MSI avec une résolution spatiale de 50 μm environ. Une corrélation entre la distribution des molécules et leur rôle écologique présumé permet d’avancer des hypothèses d’écologie chimique. Des approches conjointes reliant histolocalisation et étude génétique des partenaires de la symbiose ont été entreprises. La recherche des gènes de la biosynthèse de la mycosporine sérinol chez les symbiontes isolés de Lichina pygmaea par microdissection capture laser a été initiée en ce sens. D’autres approches innovantes comme l’analyse cristallographique par diffraction de poudre par les rayons X sont également abordées dans ce document articulé autour de six publications issues de ce travail et de deux articles en cours de soumission. Lichens are self-sustaining symbiotic partnerships comprising a fungus associated with a green alga and/or a cyanobacteria. This consortium produces unique secondary metabolites that are endowed with various biological activities. To harness this privileged chemodiversity, innovative mass spectrometry techniques were developed in the course of this study to accelerate the dereplicative holdup through both a minimal sample preparation and a decrease of the time of analysis. Two approaches were considered during this work: DART-MS and LDI-MS and their adequacy for lichen dereplication was assessed on a vast array of samples encompassing a wide range of metabolites. Both of them facilitated complete chemical profiles, respectively from unprocessed lichen material and crude acetone extracts. Since TLC still enjoys a wide-spread popularity among lichenologists, the advantages offered by TLC-ESI-MS hyphenation were evaluated as well. A second part of this manuscript focused on the histolocalization of lichen metabolites. For this purpose, LDI mass spectrometry imaging studies were undertaken on the crustose lichen Ophioparma ventosa. The phytochemical investigation of this species afforded the isolation of six naphthopyranones from its apothecia, four of them being new molecules. LDI-MSI revealed the distribution patterns of all the main metabolites of this lichen, reaching a spatial resolution of 50 μm. Most interestingly, the distribution pattern of imaged metabolites within the thallus is highly organized and is related to their ecological relevance. Joint strategies combining histolocalization and genetic investigation of lichen symbionts separated using laser capture microdissection were also considered. As such, an investigation of the biosynthesis of mycosporine serinol within Lichina pygmaea dissociated symbionts was initiated. Further analytical strategies such as X-ray powder diffraction are introduced in this thesis that contains six publications and two drafts to be submitted. Electronic Thesis or Dissertation Text fr en application pdf 1 : 35929 Ko https://ecm.univ-rennes1.fr/nuxeo/site/esupversions/c0eaa55b-0c6a-4be3-a322-e3d701593430 Le Pogam-Alluard Pierre 1989-10-30 FR 19771417X pierre.lepogam.alluard@gmail.com 2016REN1S056 http://www.theses.fr/2016REN1S056 2016-09-09 Chimie Universite de Rennes 1 thesis.degree.grantor_1 02778715X Doctorat Universite Bretagne Loire partenaireRecherche_1 191639044 non oui Boustié Joël intervenant_1 059806893 Legouin Béatrice intervenant_2 160834775 SCIENCES DE LA MATIERE ecoleDoctorale_1 139061916 Sciences chimiques de Rennes partenaireRecherche_2 161775241 ddc:540 Boustié Joël Legouin Béatrice Universite de Rennes 1 Sciences et technologie, medecine, pharmacie, odontologie, droit, economie, gestion, philosophie SCIENCES DE LA MATIERE École doctorale Sciences de la matière (Rennes) Universite Bretagne Loire Communaute des etablissements d enseignement superieur et de recherche (ComuE) Sciences chimiques de Rennes ASCII PDF 36791130