SCD-Universite de Rennes 1 Rôle de la protéine CELF1 dans la régulation post- transcriptionnelle de l'expression des gènes CELF1 protein in the post-transcriptional regulation of gene expression expression géniquetranscriptomeprotéines de liaison aux ARNépissage alternatifbiologie moléculairerégulation gene expressiontranscriptomeRNA-binding proteinalternative splicingmolecular biologyregulation Expression génique Thèses et écrits académiques Protéines de liaison à l'ARN Thèses et écrits académiques Épissage alternatif Thèses et écrits académiques Biologie moléculaire Thèses et écrits académiques Dans les cellules eucaryotes, l'expression des gènes est régulée à de multiples étapes. Les régulations post-transcriptionnelles regroupent l'ensemble des contrôles qui s'exercent sur un ARN, en particulier sa maturation nucléaire, sa stabilité et son contrôle traductionnel. Les protéines de liaison aux ARN sont des acteurs majeurs de ces régulations post-transcriptionnelles. Les protéines CELF1 et ELAVL1, abondantes et quasiment ubiquitaires, participent à ces différents niveaux de régulation et sont susceptibles de modifier le devenir des transcrits. Au cours de ces travaux, nous avons étudié l'impact de CELF1 sur l'abondance et la maturation des ARN par des approches transcriptomiques. Nous avons classé les transcrits en fonction de leurs réponses aux différentes inactivations. L'ensemble de ces données montre que i) CELF1 et ELAVL1 ont des rôles bivalents, leur déplétion étant associée à une répression ou une activation de certains gènes ; ii) dans des cellules HeLa, les effets des différentes déplétions sont majoritairement des effets indirects ; iii) CELF1 et ELAVL1 ont très majoritairement le même effet sur l'abondance des ARNm qu'elles contrôlent directement ; iv) CELF1 et ELAVL1 ont le plus souvent des effets coopératifs ou redondants sur l'abondance des transcrits liés. L'effet combinatoire de CELF1 et ELAVL1 dépend de l'ARNm considéré, révélant une complexité des régulations post-transcriptionnelles critiques pour le devenir d'une cellule. In eukaryotic cells, after transcription gene expression is controlled at multiple steps. These qualitative and quantitative post-transcriptional regulations are specified by RNA binding proteins (RBP). By combining transcriptomic analysis and binding site information for CELF1, we showed that CELF1 regulates both nuclear and cytoplasmic steps of gene expression. CELF1 directly controls the stability of cyclin D1 mRNA and the splicing of several RNA including KLC1 (light chain kinesin 1). Because mRNAs are in complexes consisting of multiple RBP we studied whether CELF1 and ELAVL1 would interact and control the abundance of their bound mRNAs. This analysis unravel a surprising redundancy or cooperativity of CELF1 and ELAVL1. The combinatorial effects of CELF1 and ELAVL1 were highly dependent on the considered RNA. Interestingly, we showed that both proteins cooperate and interact physically. Electronic Thesis or DissertationText fr en application/pdf1 : 16419 Kohttps://ecm.univ-rennes1.fr/nuxeo/site/esupversions/764aab4e-7caa-4319-bbba-625811658936 David Géraldine 1979-11-06 FR 192547283 g_david@aliceadsl.fr 2015REN1S094 http://www.theses.fr/2015REN1S094 2015-01-15 Biologie Universite de Rennes 1thesis.degree.grantor_1 02778715X Doctorat Université européenne de BretagnepartenaireRecherche_1 139075119 non ouiPaillardLucintervenant_1139197494AudicYannintervenant_2145356841 Vie-Agro-SantéecoleDoctorale_1 13908620X IGDR partenaireRecherche_2 178579254 ddc:570 PaillardLucAudicYannUniversite de Rennes 1Sciences et technologie, medecine, pharmacie, odontologie, droit, economie, gestion, philosophieVie-Agro-SantéÉcole doctorale Vie-Agro-Santé (Rennes)Université européenne de Bretagne Pôle de recherche et d'enseignement supérieur de Bretagne IGDR ASCII PDF 16813398