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Étude des performances diagnostiques du kit de PCR multiplex Allplex™ Bacterial Vaginosis plus Assay pour le diagnostic de la vaginose bactérienne (Study of the diagnostic of the Allplex™ Bacterial multiplex PCR multiplex Allplex™ Bacterial Vaginosis plus Assay for diagnosis of bacterial vaginosis vaginosis) Zas, Inès-Lou - (2024-04-03) / Universite de Rennes - Étude des performances diagnostiques du kit de PCR multiplex Allplex™ Bacterial Vaginosis plus Assay pour le diagnostic de la vaginose bactérienne
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Langue : Français Directeur(s) de thèse: Piau, Caroline Discipline : Medecine Classification : Médecine et santé Mots-clés : Microbiote , vaginal, vaginose bactérienne, PCR, diagnostic moléculaire
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Résumé : La vaginose bactérienne (VB) est l’infection gynécologique la plus courante dans le monde et facteur de risque de nombreuses infections génitales, de complications post-chirurgicales et obstétricales. Le diagnostic conventionnel est basé sur l’identification microscopique de morphotypes plus ou moins associée à la culture. Cependant, ces techniques dépendent souvent de l’expertise du laboratoire et de l’expérience du technicien. Par conséquent, l’approche moléculaire, dans la qualification et la quantification des microorganismes, pourrait s’avérer utile pour le diagnostic de VB. L’objectif de notre étude est de réaliser une évaluation en « vraie vie » des performances diagnostiques d’un kit de PCR multiplex, Allplex™ BV plus Assay, pour le diagnostic de la VB par rapport au score de Spiegel associé ou non à la culture. Nous avons mené une étude prospective ayant permis d’inclure 184 échantillons vaginaux, chez des patientes enceintes ou non, et avons recueilli leurs données démographiques, cliniques et bactériologiques. Au total, 64,1% des prélèvements vaginaux (PV) étaient concordants entre la PCR et le score de Spiegel et 66,7% entre la PCR et le score de Spiegel associé à la culture lorsque les deux étaient concordants. Avec une sensibilité satisfaisante à 92,7% par rapport au score de Spiegel et 96,3% par rapport au score de Spiegel associé à la culture, ce test pourrait être un bon test de dépistage notamment chez des femmes symptomatiques avec des facteurs de risque. La spécificité était plus faible à 88,1% et 91,4% respectivement, mais pourrait être améliorée en perfectionnant le kit de PCR ou en sélectionnant des populations particulières. La bactériologie conventionnelle garde malgré tout une place incontournable dans la caractérisation des flores et le portage de germes à risque néonatal lors de la grossesse. Abstract : Bacterial vaginosis (BV) is the most common gynecological infection worldwide, and a risk factor for many genital risk factor for many genital infections, post-surgical and obstetric complications. Conventional is based on microscopic identification of morphotypes more or less associated with culture. However, these techniques often depend on the expertise of the laboratory and the experience of the technician. Consequently, the molecular approach to qualifying and quantifying microorganisms, could prove useful for the diagnosis of BV. The aim of our study is to carry out a "real-life" evaluation "of the diagnostic performance of a multiplex PCR kit, Allplex™ BV plus Assay, for the diagnosis of diagnosis of BV compared with Spiegel's score associated or not with culture. We conducted a prospective study 184 vaginal samples from pregnant and non-pregnant patients, and collected demographic, clinical and bacteriological demographic, clinical and bacteriological data. A total of 64.1% of vaginal swabs (PV) were concordant between PCR and Spiegel score, and 66.7% between PCR and Spiegel score when Spiegel score when both were concordant. With a satisfactory sensitivity of 92.7% compared to Spiegel score and 96.3% to Spiegel score combined with culture, this test could be a good a good screening test, particularly for symptomatic women with risk factors. The specificity was lower at 88.1% and 91.4% respectively, but could be improved by refining the PCR kit or by selecting specific populations. Conventional bacteriology nevertheless to characterize the flora and carriage of neonatal risk germs during pregnancy. during pregnancy. |