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| Étude des processus de remodelage de la chromatine dépendant de l'ADP-ribose et intervenant à des stades précoces de la réponse aux dommages de l'ADN ( Investigating ADP-ribose dependent chromatin remodeling processes occurring at early stages of the DNA damage response) Pinto, Eva - (2024-12-02) / Université de Rennes, Université de Szeged - Étude des processus de remodelage de la chromatine dépendant de l'ADP-ribose et intervenant à des stades précoces de la réponse aux dommages de l'ADN
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Langue : Anglais Directeur(s) de thèse: Huet, Sébastien; Timinszky, Gyula Discipline : Biologie cellulaire, biologie du développement Laboratoire : IGDR Ecole Doctorale : SVS Classification : Sciences de la vie, biologie, biochimie Mots-clés : Chromatine, organisation, remodelage, ADP-ribose, microscopie
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Résumé : Grâce à diverses techniques, notamment la microscopie et la biologie moléculaire, la chromatine a été décrite comme une structure hiérarchique à plusieurs échelles. Toutefois, ce modèle bien défini a été remis en question par des découvertes récentes suggérant que les fibres de chromatine soient plutôt disposées de manière irrégulière dans le noyau. De plus, la structure de la chromatine, au lieu d'être rigide et régulière, semble comme une structure plastique qui peut être réorganisée à différentes échelles pour remplir diverses fonctions nucléaires. En particulier, dans le contexte des lésions à l'ADN, l'activation de la réponse aux dommages de l'ADN (DDR) modifie l'organisation de la chromatine afin de faciliter l'accès aux lésions et de restaurer l'intégrité génomique avec précision. Ce processus de remodelage de la chromatine implique de nombreux acteurs de la réparation de l'ADN.Parmi ceux-ci, l'ADP-ribosylation, une modification post-traductionnelle, favorise le remodelage de la chromatine aux premiers stades de la DDR, soit en modifiant les histones, soit en recrutant plusieurs remodeleurs de la chromatine. Au cours de ma thèse, par le biais de la microscopie de super-resolution, j'ai obtenu une description préliminaire à l’échelle du nucleosome de la structure de la chromatin et de son remodelage à proximité des sites de lésions de l'ADN. Par ailleurs, grâce à l’utilisation de méthodes d’imagerie de cellules vivantes, j'ai pu déterminer le rôle de l'ADP-ribosylation dans le recrutement du complexe de remodelage de la chromatine ACF aux dommages à l’ADN. Enfin, j'ai examiné les fonctions potentielles des complexes de remodelage ACF et CHRAC au cours la réparation de l'ADN. Abstract : Using various techniques, including microscopy and molecular biology, chromatin has been described as a multiscale hierarchical structure. However, this well-defined model has been challenged by recent findings, suggesting that chromatin fibers are irregularly arranged within the nucleus. In addition, the chromatin structure, rather than being rigid and regular, appears as a plastic structure that can be reorganized at different scales to perform various nuclear functions. In particular, in the context of DNA lesions, the activation of the DNA damage response (DDR) alters the chromatin organization to facilitate access to lesions as well as restoring genomic integrity. This chromatin remodeling process involves many DNA repair actors.Among those, ADP-ribosylation, a post-translation modification, promotes chromatin remodeling at early stages of DDR either by modifying the histones or by recruiting several chromatin remodelers. Therefore, through my thesis, I preliminary described chromatin structure and remodeling in the vicinity of DNA damage sites at single-nucleosome level using super-resolution microscopy. Furthermore, I deciphered the role of ADP-ribosylation in recruiting the ACF chromatin remodeling complex to lesions using live-cell imaging methods. Finally, I examined the potential functions of both ACF and CHRAC remodeling complexes during DNA repair. | |||