| Etude de la régulation transcriptionnelle de deux ARN régulateurs de Staphylococcus aureus : implication d'un facteur de transcription de la famille SarA (Transcriptional regulation study of two sRNAs in Staphylococcus aureus : involvement of a transcription factor from SarA family) Mauro, Tony - (2017-03-09) / Universite de Rennes 1 - Etude de la régulation transcriptionnelle de deux ARN régulateurs de Staphylococcus aureus : implication d'un facteur de transcription de la famille SarA
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Langue : Français Directeur(s) de thèse: Felden, Brice; Rouillon, Astrid Discipline : Biologie et sciences de la santé Laboratoire : Fonction, structure et inactivation d'ARN bactériens Ecole Doctorale : VIE-AGRO-SANTE Classification : Médecine et santé Mots-clés : S. aureus, ARN régulateurs, Facteur de transcription, Transcription, SarA
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Résumé : Staphylococcus aureus est une bactérie pathogène portée par 30% de la population humaine. Cette bactérie agressive est responsable d'1/5ème des maladies acquises à l’hôpital (infections nosocomiales). Le passage d’un état commensal (portage) à un état infectieux implique le contrôle de l’expression de facteurs de virulence (toxines, adhésines…) ; ce qui nécessite un large arsenal de régulateurs bactériens comprenant des protéines (facteurs de transcription) et des ARN régulateurs (ARNrég). Parmi ces derniers, l’ARN Srn_3610_SprC est impliqué, entre autres, dans la prévention de la phagocytose et dans l’atténuation de la virulence de la bactérie. Or, cet ARN, dont l’expression est habituellement faible, se retrouve fortement exprimé durant les premières minutes de la phagocytose. Le but de cette thèse a été d’identifier les régulateurs transcriptionnels de srn_3610_sprC. SarA, un des facteurs de transcription majeur de S. aureus impliqué dans de nombreuses étapes clé de la virulence (antibiorésistance, formation de biofilm…), a été caractérisé comme le répresseur fort de l’expression de srn_3610_sprC. L’identification du site de fixation de SarA sur le promoteur de ce gène a permis de révéler un second ARNrég, Srn_9340, dont l’expression est également réprimée par SarA. Dans les 2 cas, SarA empêche la fixation de l’ARN polymérase sur leur promoteur, entrainant un faible niveau de transcription. La recherche du signal permettant l’induction de la transcription de ces gènes via le décrochage de SarA est en cours. En parallèle, les données de fixation de SarA sur ces 2 promoteurs ont permis d’identifier de nouvelles cibles de SarA. Nous poursuivrons cette recherche de cibles via une analyse à haut débit par RNASeq. Abstract : Staphylococcus aureus is a bacterial pathogen responsible for about 1/5 of health-care associated infections. Nevertheless, 30% of humans are healthy carriers of this bacterium. Switch from commensal to infectious mode requires that virulence factors (toxins, adhesins), involved in S. aureus pathogenicity, are regulated by transcription factors (TF) and small non-coding RNA (sRNA). One of these sRNA, Srn_3610_SprC, has a key-role in prevention of phagocytosis and in attenuation of S. aureus virulence. Whereas srn_3610_sprC is usually poorly expressed, its expression is up-regulated during the first minutes of phagocytosis process. The aim of this thesis was to identify TF regulating srn_3610_sprC expression. We characterized SarA, the main TF of S. aureus, as a repressor of srn_3610_sprC transcription. Following SarA binding site determination, we highlighted a second sRNA (Srn_9340) also transcriptionally repressed by SarA. For both sRNA, SarA prevents RNA polymerase binding on their promoters. The next challenge will be to determine SarA derepression signal allowing high level of sRNAs transcription. Meanwhile, researches on SarA binding sequences allowed us to identify new SarA targets. To better understand SarA functions in S. aureus (antibiotic resistance, biofilm formation), we are now initiating a global study for the determination of SarA targets. | |||