Apport des PCR GeneXpert et GeneXpert Ultra dans la diagnostic de la tuberculose maladie chez les enfants âgés de moins de 15ans en Bretagne
(Contribution of Xpert MTB/RIF and Xpert Ultra in the diagnosis of tuberculosis disease in children under the age of 15 years old in Brittany)

Allanore, Alexandra - (2024-06-26) / Universite de Rennes - Apport des PCR GeneXpert et GeneXpert Ultra dans la diagnostic de la tuberculose maladie chez les enfants âgés de moins de 15ans en Bretagne

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Langue : Français

Directeur(s) de thèse:  Vigier, Clémentine

Discipline : Pédiatrie

Classification : Médecine et santé

Mots-clés : Tuberculose, Tuberculose pédiatrique, PCR GeneXpert, PCR GeneXpert Ultra, Diagnostic
Tuberculose  - Chez l'enfant
Diagnostic--Appareils et matériel
PCR (génétique)‎


Résumé : Introduction : La tuberculose est une maladie infectieuse majeure, responsable d'un nombre important de décès dans le monde avec un taux de mortalité plus élevé chez les enfants. La plupart de ces décès sont dus à des retards diagnostics liés à l’atypie de la présentation de la maladie chez l’enfant, mais également à la difficulté d’obtention d’une preuve microbiologique. Toutefois, l’utilisation de la PCR GeneXpert et de la PCR GeneXpert Ultra semble avoir changé les perspectives diagnostiques. L’objectif de notre étude est d’évaluer l’apport de la PCR GeneXpert et GeneXpert Ultra dans le diagnostic de la tuberculose pédiatrique. Méthode : Il s’agit d’une étude observationnelle rétrospective multicentrique réalisée dans les principaux centres hospitaliers de Bretagne. La population est composée des enfants hospitalisés pour un diagnostic de tuberculose maladie, âgés de moins de 15 ans lors du diagnostic, sur la période allant du 1er janvier 2010 au 31 décembre 2022. Le critère de jugement principal est la comparaison du taux d’obtention d’une preuve microbiologique de tuberculose maladie parmi les patients ayant eu une PCR GXP ou GXP Ultra que nous avons regroupé au sein du même groupe, à celui des patients n’ayant pas eu de PCR GXP/GXP Ultra. Résultats : 71 patients, dont 44 dans le groupe sans PCR GXP/ Ultra et 27 dans le groupe avec PCR GXP/ Ultra, ont été inclus. Le taux d’obtention de preuve microbiologique de tuberculose maladie était significativement plus élevé dans le groupe PCR GXP/ Ultra (p = 0,0039) avec un Odd Ratio calculé à 4.59 [1.63 ; 12.92]. Conclusion : La PCR GXP/ Ultra permet une augmentation de l’obtention d’une preuve microbiologique lors du diagnostic de tuberculose maladie chez les enfants âgés de moins de 15ans.

Abstract : Introduction: Tuberculosis is a major infectious disease responsible for a significant number of deaths worldwide, with a higher mortality rate among children. Most of these deaths are due to diagnostic delays related to the atypical presentation of the disease in children and the difficulty of obtaining microbiological evidence. However, the use of PCR GeneXpert and GeneXpert Ultra has changed diagnostic perspectives. The objective of our study is to evaluate the contribution of PCR GeneXpert and GeneXpert Ultra in the diagnosis of pediatric tuberculosis. Method: This is a multicenter retrospective observational study conducted in major hospitals in Brittany. The study population includes children hospitalized for a diagnosis of tuberculosis disease from January 1, 2010, to December 31, 2022, who were under 15 years old at the time of diagnosis. The primary endpoint is the comparison of the rate of obtaining microbiological evidence of tuberculosis disease among patients who had a PCR GXP or GXP Ultra, grouped together, versus those who did not have a PCR GXP/GXP Ultra. Results: Seventy-one patients were included, with 44 in the non-PCR GXP/Ultra group and 27 in the PCR GXP/Ultra group. The rate of obtaining microbiological evidence of tuberculosis disease was significantly higher in the PCR GXP/Ultra group (p = 0.0039), with an Odds Ratio calculated at 4.59 [1.63; 12.92]. Conclusion: The GXP/Ultra PCR increases the statistical probability of obtaining microbiological evidence of tuberculosis disease among children under the age of 15 years old.